BioburdenChecker
Bioburden
Bioburden Checker — Проверка микробной обсеменённости (Ph. Eur. 2.6.12)
ℹ️ Утилита проверяет соответствие результатов испытаний на микробную обсеменённость требованиям Европейской фармакопеи.
ℹ️ Не использует машинное обучение — только правила.
⚠️ Для нестерильных препаратов: TAMC ≤100 КОЕ/г(мл), TYMC ≤10 КОЕ/г(мл).
Использование:
BioburdenChecker.exe → демо-режим (вывод в консоль)
BioburdenChecker.exe input.csv output.json → оценка ваших данных
Формат input.csv:
ProductName,BatchNumber,ProductType,TAMC_CFU_per_g_or_ml,TYMC_CFU_per_g_or_ml,TestMethod,IncubationConditionsTAMC,IncubationConditionsTYMC
Пример:
GlucoseInfusion_5pct,B20260301,NonSterileLiquid,80,10,MembraneFiltration,"30-35°C, 5 days","20-25°C, 5 days"
— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Микробная обсеменённость — критический параметр качества для нестерильных лекарственных форм. Превышение допустимых уровней TAMC (общее микробное число) или TYMC (дрожжи и плесени) может:
• Указывать на нарушение санитарных условий производства,
• Снижать стабильность препарата,
• Вызывать инфекции у пациентов с ослабленным иммунитетом.
Соответствие Ph. Eur. 2.6.12 обязательно для выпуска нестерильных ЛП.
input.csv
ProductName,BatchNumber,ProductType,TAMC_CFU_per_g_or_ml,TYMC_CFU_per_g_or_ml,TestMethod,IncubationConditionsTAMC,IncubationConditionsTYMC GlucoseInfusion_5pct,B20260301,NonSterileLiquid,80,10,MembraneFiltration,"30-35�C, 5 days","20-25�C, 5 days"
URS & FS — пользовательские требования и функциональная спецификация
Этот документ описывает требования пользователя и функциональную спецификацию для утилиты контроля качества. Он предназначен для обсуждения внедрения, подготовки IQ/OQ и интеграции в контур ОКК/QC.
1. Область применения
Утилита Bioburden Checker применяется для объекта Bioburden. Источником истины для структуры входных данных является фактический input.csv; критерии контроля задаются исполняемым модулем и предметным описанием.
Утилита не использует машинное обучение; решение формируется детерминированными правилами.
Категории: EAEU pharmacopoeia, Sterile liquids
Теги: contrast media, dialysis, dissolution, EAEU, endotoxins, herbal, impurities, infusions, microbiology, pharmacopoeia, specification, sterile products, sterility, WFI
2. Режимы запуска
BioburdenChecker.exe → демо-режим (вывод в консоль) BioburdenChecker.exe input.csv output.json → оценка ваших данных
3. Ключевые контролируемые области
- растворение / распад
- микробиология и патогены
- pH и физико-химические параметры
4. Предметные ограничения и критические параметры
- ⚠️ Для нестерильных препаратов: TAMC ≤100 КОЕ/г(мл), TYMC ≤10 КОЕ/г(мл).
5. URS — пользовательские требования
| ID | Требование | Критичность | Критерий приемки |
|---|---|---|---|
| URS-001 | Система должна принимать файл input.csv для Bioburden с точным набором колонок, перечисленным в разделе «Контракт входных данных». | High | Файл с корректным заголовком читается без ручного редактирования; отсутствие обязательной колонки приводит к FAIL/ошибке импорта. |
| URS-002 | Система должна обрабатывать запуск без аргументов в демонстрационном режиме и запуск с аргументами input.csv output.json для пользовательских данных. | Medium | Оба сценария запуска дают предсказуемый результат или понятное сообщение об ошибке. |
| URS-003 | Система должна выполнять rule-based контроль по областям: растворение / распад, микробиология и патогены, pH и физико-химические параметры. | High | Каждый контролируемый параметр получает статус и сообщение; результат не зависит от скрытых Excel-формул или ML. |
| URS-004 | Система должна сохранять трассируемость между серией/партией, исходными значениями, применёнными правилами и итоговым вердиктом. | High | В выходе присутствуют идентификатор серии, исходные значения, статусы параметров и критические находки. |
| URS-005 | Система должна формировать машинно-читаемый output.json для LIMS/ELN/MES, batch record и QA/QC review. | High | JSON содержит общий статус, массив проверок, предупреждения, отказы и ссылку на исходный файл. |
| URS-006 | Система должна поддерживать применение в валидационном пакете клиента: URS/FS, IQ/OQ-подготовка, проверка установки и операционных сценариев. | High | Документ, тестовые сценарии и воспроизводимый CSV/JSON-поток пригодны для аудита и внутреннего согласования. |
| URS-007 | Система должна явно отделять технические ошибки данных от предметных несоответствий спецификации. | Medium | Ошибки схемы/типов не смешиваются с фармакопейными отклонениями и отображаются отдельно. |
6. Контракт входных данных input.csv
Источник истины для схемы входа — фактический заголовок input.csv. Имена колонок технические и не переводятся.
| # | Колонка | Тип | Ед. | Описание | Пример | Правило контроля |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | ProductName | идентификатор | as specified | Product Name | GlucoseInfusion_5pct | обязательное значение; формат и допустимость проверяются утилитой |
| 2 | BatchNumber | идентификатор | as specified | Batch Number | B20260301 | обязательное поле; используется для трассируемости серии/партии |
| 3 | ProductType | текст | as specified | Product Type | NonSterileLiquid | обязательное значение; формат и допустимость проверяются утилитой |
| 4 | TAMC_CFU_per_g_or_ml | десятичное число | CFU | TAMC CFU per g or ml | 80 | число; сравнивается с микробиологическими пределами |
| 5 | TYMC_CFU_per_g_or_ml | десятичное число | CFU | TYMC CFU per g or ml | 10 | число; сравнивается с микробиологическими пределами |
| 6 | TestMethod | текст | as specified | Test Method | MembraneFiltration | обязательное значение; формат и допустимость проверяются утилитой |
| 7 | IncubationConditionsTAMC | текст | as specified | Incubation Conditions TAMC | 30-35�C, 5 days | число; сравнивается с микробиологическими пределами |
| 8 | IncubationConditionsTYMC | текст | as specified | Incubation Conditions TYMC | 20-25�C, 5 days | число; сравнивается с микробиологическими пределами |
Пример CSV
ProductName,BatchNumber,ProductType,TAMC_CFU_per_g_or_ml,TYMC_CFU_per_g_or_ml,TestMethod,IncubationConditionsTAMC,IncubationConditionsTYMC GlucoseInfusion_5pct,B20260301,NonSterileLiquid,80,10,MembraneFiltration,"30-35�C, 5 days","20-25�C, 5 days"
7. FS — функциональная спецификация
| ID | Функция | Описание реализации |
|---|---|---|
| FS-001 | CLI entry point | Исполняемый файл BioburdenChecker.exe принимает режим демонстрации и режим обработки input.csv output.json. |
| FS-002 | CSV parser | Модуль импорта читает CSV, проверяет заголовок, порядок/наличие колонок, количество значений и кодировку. Для десятичных значений ожидается точка. |
| FS-003 | Field conversion | Для каждой колонки выполняется преобразование к ожидаемому типу: идентификатор, текст, десятичное число, дата/время или логический флаг. |
| FS-004 | Domain rule engine | Для объекта Bioburden применяются явные правила: диапазон, минимум, максимум, отсутствие запрещённого признака, полнота данных или расчётная проверка. |
| FS-005 | Criticality handling | Критичные нарушения формируют FAIL; некритичные отклонения и неполные данные формируют WARNING; соответствие всем правилам формирует PASS. |
| FS-006 | JSON writer | output.json сохраняет общий статус, результаты по каждому параметру, исходные значения, предупреждения, отказы и диагностические сообщения. |
| FS-007 | Integration contract | Формат CSV → JSON стабилен для вызова из LIMS/ELN/MES, планировщика задач или wrapper-сервиса. |
| FS-008 | Error handling | При ошибке схемы, отсутствующем файле, нечисловом значении или невозможности записи JSON возвращается диагностируемая ошибка без тихого PASS. |
8. Выходной контракт output.json
Выходной файл должен быть пригоден для автоматической обработки, аудита и сопоставления с исходной строкой input.csv.
{
"utility": "BioburdenChecker",
"api": "Bioburden",
"batchNumber": "B20260301",
"overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
"checkedAtUtc": "2026-05-18T00:00:00Z",
"checks": [
{
"parameter": "ProductName",
"value": "GlucoseInfusion_5pct",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "BatchNumber",
"value": "B20260301",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "ProductType",
"value": "NonSterileLiquid",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "TAMC_CFU_per_g_or_ml",
"value": "80",
"unit": "CFU",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "TYMC_CFU_per_g_or_ml",
"value": "10",
"unit": "CFU",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "TestMethod",
"value": "MembraneFiltration",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "IncubationConditionsTAMC",
"value": "30-35�C, 5 days",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "IncubationConditionsTYMC",
"value": "20-25�C, 5 days",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
}
],
"criticalFindings": [],
"sourceFile": "input.csv"
}9. Тестовые сценарии OQ/PQ
| ID | Сценарий | Ожидаемый результат |
|---|---|---|
| TC-001 | Валидный CSV с заголовком и строкой из примера | Все строки обработаны; результат содержит PASS/WARNING/FAIL и детализацию по параметрам. |
| TC-002 | Отсутствует обязательная колонка из input.csv | Импорт отклоняется или строка получает FAIL со ссылкой на схему. |
| TC-003 | Числовое поле содержит текст или пустое значение | Фиксируется ошибка преобразования типа; результат не маскируется как PASS. |
| TC-004 | Параметр выходит за предел спецификации / критического лимита | Для критического параметра формируется FAIL; для некритического — WARNING согласно правилу. |
| TC-005 | Положительный патогенный/микробиологический флаг или превышение микробиологического лимита | Формируется критический FAIL с указанием параметра. |
10. QA/QC, CSV и управление изменениями
- Перед применением на производстве клиент фиксирует версию исполняемого файла, контрольную сумму, версию спецификации/монографии, тестовый CSV, ожидаемый JSON и результаты IQ/OQ.
- Нельзя менять имена колонок без обновления валидатора и тестовых сценариев.
- Исходный CSV, output.json и версия утилиты должны храниться вместе как пакет доказательств.
- Любое изменение правил контроля должно проходить change control и повторную проверку OQ-сценариев.
Входит в пакеты
Диабет
Пакет для противодиабетических препаратов: инсулины, метформин, SGLT2/DPP-4/GLP-1 препараты, глюкагон и сопутствующие проверки качества лекарственных форм.
ОткрытьEAEU Pharmacopoeia QC Suite
Пакет утилит по фармакопейным методам ЕАЭС: спецификации, растворение, микробиология, примеси и общие испытания.
ОткрытьИнфекционистика
Пакет QC-утилит для инфекционистики: антибактериальные, противовирусные, противогрибковые и противопаразитарные продукты, микробиология, стерильность, эндотоксины, вирусная безопасность, вакцинные release-checks.
ОткрытьMedical Liquids QC Suite
Пакет контроля стерильных жидкостей, инфузионных растворов, диализных растворов, контрастных средств и воды для инъекций.
ОткрытьРадиология
Пакет для радиологии и диагностической визуализации: радиофармпрепараты, PET/SPECT, контрастные вещества, йодсодержащие и гадолиниевые препараты, а также проверки частиц, стерильности и эндотоксинов.
Открыть