CE_Peptide_Map_Fingerprint

URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация

Документ описывает контролируемый интерфейс, требования пользователя и функциональное поведение утилиты CE_Peptide_Map_Fingerprint. Назначение: автоматизированная проверка лабораторных, фармакопейных, аналитических или производственных QC-параметров на основе данных input.csv с формированием структурированного результата output.json.

Предметные ограничения и критические параметры

• • Количество пиков: ≥20 (зависит от белка и протеазы)
• • Покрытие последовательности (Sequence Coverage): ≥95.0%
• • Корреляция с эталонным профилем (Fingerprint Correlation): ≥0.98
• • Количество новых/неидентифицированных пиков: 0
• • Белок расщепляется специфической протеазой (например, трипсином) на пептиды.
• • Капиллярный электрофорез (КЭ) разделяет пептиды по заряду и размеру с высоким разрешением.
• • Полученный профиль ("отпечаток пальца") сравнивается с референсным стандартом.
• • Любое отклонение в профиле (сдвиг пиков, появление новых, исчезновение старых) свидетельствует об изменении первичной структуры или посттрансляционных модификациях.
• • Соответствие требованиям USP <1053> и Ph. Eur. 2.2.47.
• • Покрытие последовательности ≥95% гарантирует, что большая часть молекулы проанализирована.
• • Корреляция ≥0.98 подтверждает идентичность партии эталону.
• • Отсутствие новых пиков критично для выявления следовых продуктов деградации (дезамидирование, окисление).
• • Метод требует высокой воспроизводимости условий digesiton и разделения.
• • Оценка сложности пептидной карты (количество пиков).
• • Расчет покрытия последовательности.
• • Статистическое сравнение профилей (корреляция).

URS — пользовательские требования

Контракт input.csv

BatchNumber,PeakCount,Coverage%,Correlation,MainArea%,NovelPeaks
PEPMAP-CE-2026-001,45,98.5,0.995,100.0,0
PEPMAP-CE-2026-002,44,97.8,0.992,99.5,0
PEPMAP-FAIL-2026-003,30,85.0,0.920,95.0,3

FS — функциональная спецификация

Пример output.json

{
  "utilityId": "ce-peptide-map-fingerprint",
  "utilityName": "CE_Peptide_Map_Fingerprint",
  "overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
  "sourceFile": "input.csv",
  "checks": [
    {
      "parameter": "BatchNumber",
      "value": "PEPMAP-CE-2026-001",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "PeakCount",
      "value": "45",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "Coverage%",
      "value": "98.5",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "Correlation",
      "value": "0.995",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "MainArea%",
      "value": "100.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "NovelPeaks",
      "value": "0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    }
  ],
  "criticalFindings": [],
  "warnings": [],
  "generatedFor": "QA/QC review and LIMS integration"
}

Матрица трассируемости

OQ/PQ тестовые сценарии

QA/QC и change control

• Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
• Хранить input.csv, output.json, версию исполняемого файла, документацию и checksum.
• Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
• Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, локальными SOP и регистрационным досье.