Назначение

Определить пользовательские требования к автономной FUZKK-утилите, которая принимает CSV-файл лабораторных данных, выполняет проверку по зашитым в код правилам и формирует LabWare-compatible JSON.

Область применения

Утилита предназначена для предварительной QC/QA-оценки, интеграционного тестирования, LIMS/LabWare flow и подготовки evidence trail. Окончательное решение остаётся за валидированной процедурой лаборатории и ответственным персоналом.

Пользователи

QC analyst, QA reviewer, CSV/validation engineer, LIMS/LabWare integration engineer, responsible laboratory specialist.

Пользовательские требования

1. Утилита должна запускаться без параметров и выводить самоописание, пример input.csv из GetDemoData() и demo evaluation для встроенного набора данных.
2. Утилита должна запускаться с двумя параметрами: input.csv output.json.
3. Утилита не должна читать input.csv и не должна писать output.json при запуске без параметров.
4. CSV должен читаться с CultureInfo.InvariantCulture для числовых значений.
5. Результат должен формироваться в LabWare-compatible JSON с Header, Samples, Results, Status, StatusCode, ErrorMessage, Description и DescriptionEN.
6. При PASS поле ErrorMessage должно быть пустой строкой.
7. Зашитые лимиты должны следовать приоритету: Ph. Eur. → British Pharmacopoeia / UK implementation → ЕАЭС / региональные требования → EMA/ICH/EU guidance → USP fallback.
8. Если точная монография неизвестна, применяются строгие стандартные API-лимиты: Assay 98–102%, total impurities ≤1.0%, individual impurity ≤0.5%, если это применимо к типу утилиты.
9. Для биопрепаратов и mAb-like продуктов должны учитываться агрегаты, стерильность и эндотоксины, если такие параметры релевантны назначению утилиты.
10. Если параметр может приходить в разных единицах, единица должна быть отдельным входным полем или явно отражаться в имени поля input.csv.

Входной CSV

BatchNumber,ProductName,DDT_Total_ppm,HCH_Total_ppm,Chlorpyrifos_ppm,Dichlorvos_ppm,Deltamethrin_ppm,Cypermethrin_ppm,Carbendazim_ppm,Limit_OC,Limit_OP,Limit_Pyr
TCM-PEST-2026-001,Goji Berry,0.05,0.02,0.1,0.0,0.05,0.0,0.1,0.2,0.5,0.5
TCM-PEST-2026-002,Chrysanthemum Flower,0.01,0.01,0.05,0.0,0.02,0.0,0.05,0.2,0.5,0.5
TCM-PEST-2026-003,Ginseng Root,0.3,0.15,0.8,0.1,0.6,0.1,0.8,0.2,0.5,0.5

Поля input.csv

Описание утилиты

TCM Pesticide Residue Screener — Скринер остатков пестицидов в традиционной китайской медицине

TCM Pesticide Residue Screener — Скринер остатков пестицидов в традиционной китайской медицине

ℹ️ Утилита контролирует остатки агрохимикатов (GC-MS/MS, LC-MS/MS):
• Хлорорганические (ДДТ, ГХЦГ)
• Фосфорорганические (Хлорпирифос)
• Пиретроиды (Дельтаметрин)
• Фунгициды (Карбендазим)

⚠️ КРИТИЧНО: Пестициды могут вызывать острые и хронические отравления!
Китайская фармакопея (ChP) требует скрининг 33+ пестицидов.

Использование:
TCMPesticideResidueScreener.exe → демо-режим (вывод в консоль)
TCMPesticideResidueScreener.exe input.csv output.json → оценка ваших данных

Формат input.csv:
BatchNumber,ProductName,DDT_Total_ppm,HCH_Total_ppm,Chlorpyrifos_ppm,Dichlorvos_ppm,Deltamethrin_ppm,Cypermethrin_ppm,Carbendazim_ppm,Limit_OC,Limit_OP,Limit_Pyr

Пример:
TCM-PEST-2026-001,Goji Berry,0.05,0.02,0.1,0.0,0.05,0.0,0.1,0.2,0.5,0.5

— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Контроль пестицидов критичен для безопасности ТСМ (Yunnan Baiyao, Tong Ren Tang):
• Травы часто выращиваются с интенсивным использованием агрохимикатов
• Остатки пестицидов могут сохраняться после сушки и экстракции
• Некоторые пестициды (хлорорганические) крайне стойки и накапливаются в организме
• Фармакопеи (ChP 2020, Ph.Eur., USP) устанавливают списки запрещенных и лимитируемых веществ

⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• ДДТ и ГХЦГ: Запрещены или строго лимитированы (<0.2 ppm) из-за канцерогенности
• Хлорпирифос: Нейротоксин, лимит обычно <0.5 ppm
• Пиретроиды: Менее токсичны, но требуют контроля (<0.5 ppm)
• Карбендазим: Популярный фунгицид, частый нарушитель лимитов
• Мультиметодный анализ (GC-MS/MS + LC-MS/MS) обязателен для покрытия широкого спектра

Ключевые особенности утилиты:
• Группировка пестицидов по классам токсичности
• Проверка суммарных показателей (например, сумма изомеров ДДТ)
• Поддержка динамических лимитов для разных видов сырья
• Оценка соответствия требованиям ChP 2020 (33 пестицида)

Критические параметры:
• Organochlorines: ≤0.2 ppm
• Organophosphates: ≤0.5 ppm
• Pyrethroids: ≤0.5 ppm
• Carbendazim: ≤0.5 ppm

💡 Советы по использованию:
1. Используйте матрично-специфичные калибровочные стандарты для компенсации эффекта матрицы
2. Проводите скрининг на запрещенные пестициды даже если они не ожидаются
3. Обратите внимание на ягоды годжи и хризантему — культуры высокого риска
4. При положительных результатах проведите подтверждение на другом типе детектора
5. Ведите базу данных поставщиков с низким уровнем пестицидной нагрузки

⚠️ Особенность: В отличие от синтетических препаратов, где примеси известны, в травах спектр возможных пестицидов огромен. Утилита помогает систематизировать данные сложного мультиметодного анализа и быстро выявлять критические превышения.

Трассируемость и ограничения

• URS используется как исходный документ для functional specification, CSV review и последующей CSV/validation работы.
• Документ не является заменой утверждённой фармакопейной монографии, валидированного метода или внутренней спецификации продукта.
• Для product-specific лимитов приоритет имеет утверждённая спецификация заказчика.

Функциональная спецификация описывает поведение автономной консольной утилиты FUZKK, формат входных данных, алгоритм оценки и структуру выходного JSON.

Функциональный поток

1. Main() проверяет количество аргументов.
2. Если аргументов нет: PrintHello() выводит описание и встроенный пример input.csv, затем RunDemoEvaluation() выполняет Evaluate() по GetDemoData() и печатает demo JSON.
3. Если передано два аргумента: RunWithFiles(input.csv, output.json) читает CSV, выполняет Evaluate() по каждой строке и записывает LabWare-compatible JSON.
4. LoadData() использует CultureInfo.InvariantCulture и не должен вызываться в no-args режиме.
5. Evaluate() возвращает именованный кортеж с BatchNumber, ProductName, Parameters, CriticalFailCount, WarningCount, Recommendation и RecommendationEN.
6. GetIssues() формирует сообщения для ErrorMessage при WARNING/FAIL.

Правила оценки

• PASS: CriticalFailCount = 0 и WarningCount = 0.
• WARNING: CriticalFailCount = 0 и WarningCount > 0.
• FAIL: CriticalFailCount > 0.
• ERROR: исключение при чтении или обработке данных.
• ErrorMessage остаётся пустым при PASS.
• Лимиты зашиты в Program.cs; внешняя конфигурация лимитов не требуется.

Ввод и поля

BatchNumber,ProductName,DDT_Total_ppm,HCH_Total_ppm,Chlorpyrifos_ppm,Dichlorvos_ppm,Deltamethrin_ppm,Cypermethrin_ppm,Carbendazim_ppm,Limit_OC,Limit_OP,Limit_Pyr
TCM-PEST-2026-001,Goji Berry,0.05,0.02,0.1,0.0,0.05,0.0,0.1,0.2,0.5,0.5
TCM-PEST-2026-002,Chrysanthemum Flower,0.01,0.01,0.05,0.0,0.02,0.0,0.05,0.2,0.5,0.5
TCM-PEST-2026-003,Ginseng Root,0.3,0.15,0.8,0.1,0.6,0.1,0.8,0.2,0.5,0.5

Выходной JSON

{
  "Header": {
    "UtilityName": "TCM_Pesticide_Residue_Screener",
    "Version": "1.0.0",
    "Timestamp": "UTC",
    "InstrumentID": "FUZKK-QC-WORKSTATION",
    "OperatorID": "Admin"
  },
  "Samples": [
    {
      "SampleID": "from BatchNumber",
      "BatchNumber": "from CSV",
      "ProductName": "from CSV",
      "TestName": "utility-specific test",
      "AnalysisCode": "utility-specific code",
      "Status": "PASS | WARNING | FAIL | ERROR",
      "StatusCode": "1 | 2 | 0 | -1",
      "ErrorMessage": "",
      "Description": "Russian recommendation",
      "DescriptionEN": "English recommendation",
      "Results": [
        {
          "ParameterName": "parameter",
          "ResultValue": 0.0,
          "UnitOfMeasure": "unit",
          "SpecificationLimit": "limit",
          "IsWithinSpec": true
        }
      ]
    }
  ]
}