TcmEndogenousToxinTransformationRatioChecker
Tcm Endogenous Toxin Transformation Ratio
ℹ️ Утилита оценивает безопасность токсичных лекарственных растений через хемометрические соотношения продуктов трансформации (Paozhi):
• Aconitum spp.: Соотношение Моноэфирные алкалоиды / Диэфирные алкалоиды (MDA/DDA ≥ 10)
• Strychnos nux-vomica: Соотношение Стрихнин / Бруцин (0.8 – 2.5)
• Абсолютное содержание высокотоксичных диэфирных алкалоидов (≤30 ppm для Aconite)
• Подтверждение наличия продуктов гидролиза как маркера корректной обработки
⚠️ КРИТИЧНО: Это утилита КОНТРОЛЯ БЕЗОПАСНОСТИ ЖИЗНИ!
Многие травы ТКМ (Aconite, Strychnos, Pinellia, Datura) содержат смертельные эндогенные токсины.
Терапевтическое окно достигается ТОЛЬКО путём специальной обработки (Paozhi).
Простое измерение "общего содержания" не отражает реальную токсичность.
Безопасность определяется СООТНОШЕНИЕМ токсичной формы к её продуктам распада.
Использование:
TcmEndogenousToxinTransformationRatioChecker.exe → демо-режим (вывод в консоль)
TcmEndogenousToxinTransformationRatioChecker.exe input.csv output.json → оценка ваших данных
Формат input.csv:
BatchNumber,HerbName,ToxinClass,DiesterAlkaloids_ppm,MonoesterAlkaloids_ppm,Strychnine_percent,Brucine_percent,TotalAlkaloids_percent,ProcessingMethod
Пример (Безопасный обработанный Aconite):
TCM-ACONITE-PREP-2026-001,Aconiti_Lateralis_Radix_Praeparata,Aconite,15.0,350.0,0,0,0.45,1
Поддерживаемые классы токсинов:
• Aconite — Аконитин, мезаконитин, гипаконитин (диэфирные → моноэфирные)
• Strychnos — Стрихнин, бруцин (контроль соотношения и общего уровня)
• (В разработке) Pinellia — Оксалаты кальция (кристаллическая структура)
• (В разработке) Datura — Скополамин/Атропин соотношение
— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
В отличие от внешних загрязнителей (пестициды, металлы), эти токсины являются ПРИРОДНЫМИ КОМПОНЕНТАМИ растения. Их нельзя просто "удалить". Их нужно ТРАНСФОРМИРОВАТЬ в менее токсичные формы.
• Диэфирные алкалоиды аконита (DDAs) в 1000 раз токсичнее моноэфирных (MDAs)
• Термический гидролиз превращает DDAs в MDAs, сохраняя противовоспалительную активность
• Если обработка недостаточна → высокое содержание DDAs → риск фатальной аритмии
• Если обработка чрезмерна → полное разрушение всех алкалоидов → потеря эффективности
• Ratio MDA/DDA является объективным индикатором "золотой середины" обработки
⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• Для Aconite: MDA/DDA Ratio ≥ 10.0 подтверждает достаточный гидролиз
• Для Aconite: DDAs ≤ 30 ppm (абсолютный предел безопасности по ChP 2020)
• Для Strychnos: Strychnine/Brucine Ratio 0.8-2.5 указывает на стандартную обработку
• Отсутствие моноэфирных алкалоидов при низких диэфирных = ДЕГРАДАЦИЯ, а не безопасность
• Любое отклонение в соотношении требует немедленной остановки выпуска партии
Ключевые особенности утилиты:
• Хемометрический подход к безопасности (Ratio-based assessment)
• Раздельная оценка токсичности и эффективности трансформации
• Поддержка различных механизмов детоксикации (гидролиз, окисление, изомеризация)
• Соответствие принципам традиционной технологии Paozhi и современным требованиям ChP
• Автоматическая классификация риска на основе профиля метаболитов
Критические параметры:
• Aconite MDA/DDA Ratio: ≥ 10.0
• Aconite Diester Alkaloids: ≤ 30 ppm
• Aconite Monoester Alkaloids: ≥ 100 ppm (подтверждение наличия продуктов реакции)
• Strychnos Strychnine/Brucine Ratio: 0.8 – 2.5
• Strychnos Total Alkaloids: ≤ 2.0%
💡 Советы по использованию:
1. Анализ проводится методом UHPLC-UV или LC-MS/MS с разделением изомеров
2. Калибровка должна включать отдельные стандарты для каждого алкалоида (не только аконитин!)
3. Отбор проб должен учитывать неоднородность корней аконита (клубни разного размера обрабатываются по-разному)
4. Сравнение с историческими данными серии помогает выявить дрейф процесса варки/пропаривания
5. При Ratio < 10 партия может быть ДОПОЛНИТЕЛЬНО ОБРАБОТАНА (повторная варка), но не выпущена
⚠️ Особенность: Этот тест является МОСТОМ между традиционной медициной и современной аналитикой. Традиционные мастера проверяли готовность аконита "на язык" (ощущение онемения). Сегодня мы заменяем субъективное ощущение объективным хроматографическим соотношением. Отсутствие этого теста в западных фармакопеях делает импорт необработанного или плохо обработанного сырья ТКМ экстремально рискованным. Утилита закрывает этот критический пробел в системе контроля качества.
input.csv
BatchNumber,HerbName,ToxinClass,DiesterAlkaloids_ppm,MonoesterAlkaloids_ppm,Strychnine_percent,Brucine_percent,TotalAlkaloids_percent,ProcessingMethod TCM-ACONITE-PREP-2026-001,Aconiti_Lateralis_Radix_Praeparata,Aconite,15.0,350.0,0,0,0.45,1 TCM-ACONITE-RAW-FAIL-002,Aconiti_Lateralis_Radix_Raw,Aconite,850.0,40.0,0,0,1.10,0 TCM-STRYCHNOS-PROC-2026-003,Strychni_Semen_Processed,Strychnos,0,0,1.20,0.95,2.15,3 TCM-STRYCHNOS-OVERHEAT-004,Strychni_Semen_Overprocessed,Strychnos,0,0,0.40,0.85,1.25,3
TcmEndogenousToxinTransformationRatioChecker — URS & FS
TCM Endogenous Toxin Transformation Ratio Checker
TCM Endogenous Toxin Transformation Ratio Checker
1. Назначение документа
Документ описывает пользовательские требования (URS) и функциональную спецификацию (FS) для утилиты TcmEndogenousToxinTransformationRatioChecker. Утилита предназначена для детерминированной проверки данных input.csv, формирования структурированного результата output.json и поддержки прослеживаемого QA/QC review.
Документ является проектной URS/FS-основой для CSV/CSA, IQ/OQ/PQ и дальнейшей валидации в контексте конкретной лабораторной процедуры.
2. Исходное описание утилиты
3. URS — пользовательские требования
3.1 Цель и область применения
Система должна принимать табличные результаты лабораторного контроля, выполнять проверку по заранее заданным критериям и возвращать понятный статус по каждой серии/записи: Pass, Review или Fail.
3.2 Нормативная / методическая база
В исходном описании и правилах утилиты используются следующие ориентиры: ChP 2020, ChP, EP. Финальные лимиты должны быть подтверждены утверждённой спецификацией, монографией, SOP или протоколом трансфера метода.
3.3 Ключевые QC-проверки
- Aconitum spp.: Соотношение Моноэфирные алкалоиды / Диэфирные алкалоиды (MDA/DDA ≥ 10)
- Strychnos nux-vomica: Соотношение Стрихнин / Бруцин (0.8 – 2.5)
- Абсолютное содержание высокотоксичных диэфирных алкалоидов (≤30 ppm для Aconite)
- Подтверждение наличия продуктов гидролиза как маркера корректной обработки
- Aconite — Аконитин, мезаконитин, гипаконитин (диэфирные → моноэфирные)
- Strychnos — Стрихнин, бруцин (контроль соотношения и общего уровня)
- (В разработке) Pinellia — Оксалаты кальция (кристаллическая структура)
- (В разработке) Datura — Скополамин/Атропин соотношение
3.4 Пользователи
- QC analyst — подготовка и загрузка
input.csv. - QA/QC reviewer — проверка результата и отклонений.
- CSV/validation specialist — подтверждение пригодности утилиты.
- System owner — управление версией, доступом и изменениями.
3.5 Требования к данным и Data Integrity
- каждая строка CSV должна быть прослеживаемой к серии, образцу или измерению;
- исходные значения не должны изменяться утилитой;
- расчёты должны быть воспроизводимыми при повторном запуске;
- любое отклонение должно сохраняться как структурированное finding с указанием поля и правила;
- ручное изменение итогового статуса вне QA-процесса не допускается.
4. FS — функциональная спецификация
4.1 Поток обработки
- Проверить наличие и кодировку
input.csv. - Проверить заголовки, обязательные поля и типы данных.
- Нормализовать числовые и булевы значения без изменения исходного следа.
- Выбрать набор правил по категории продукта/типа, если он предусмотрен.
- Сравнить значения с лимитами и вычислить derived metrics.
- Сформировать запись результата по каждой строке.
- Сохранить
output.jsonс общей сводкой, findings и traceability.
4.2 CSV-схема
| № | Поле CSV | Тип | Обяз. | Назначение |
|---|---|---|---|---|
| 1 | BatchNumber | string | Да | Идентификатор серии / лота для прослеживаемости. |
| 2 | HerbName | string | Да | Идентичность продукта, препарата или образца. |
| 3 | ToxinClass | string | Да | Входной атрибут для детерминированной оценки правил и прослеживаемости результата. |
| 4 | DiesterAlkaloids_ppm | decimal | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 5 | MonoesterAlkaloids_ppm | decimal | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 6 | Strychnine_percent | decimal | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 7 | Brucine_percent | decimal | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 8 | TotalAlkaloids_percent | decimal | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 9 | ProcessingMethod | integer | Да | Метаданные аналитического метода или условий анализа. |
4.3 Пример входных данных
| BatchNumber | HerbName | ToxinClass | DiesterAlkaloids_ppm | MonoesterAlkaloids_ppm | Strychnine_percent | Brucine_percent | TotalAlkaloids_percent | ProcessingMethod |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TCM-ACONITE-PREP-2026-001 | Aconiti_Lateralis_Radix_Praeparata | Aconite | 15.0 | 350.0 | 0 | 0 | 0.45 | 1 |
| TCM-ACONITE-RAW-FAIL-002 | Aconiti_Lateralis_Radix_Raw | Aconite | 850.0 | 40.0 | 0 | 0 | 1.10 | 0 |
| TCM-STRYCHNOS-PROC-2026-003 | Strychni_Semen_Processed | Strychnos | 0 | 0 | 1.20 | 0.95 | 2.15 | 3 |
| TCM-STRYCHNOS-OVERHEAT-004 | Strychni_Semen_Overprocessed | Strychnos | 0 | 0 | 0.40 | 0.85 | 1.25 | 3 |
4.4 Выходной JSON
{
"utility": "TcmEndogenousToxinTransformationRatioChecker",
"runId": "urn:fuzkk:run:example",
"sourceFile": "input.csv",
"recordsProcessed": 4,
"overallStatus": "Pass / Review / Fail",
"records": [
{
"recordId": "TCM-ACONITE-PREP-2026-001",
"status": "Pass / Review / Fail",
"criticalFindings": [],
"warnings": [],
"evaluatedRules": [
"Configured acceptance criteria from the utility rule set"
],
"inputTrace": {
"BatchNumber": "TCM-ACONITE-PREP-2026-001",
"HerbName": "Aconiti_Lateralis_Radix_Praeparata",
"ToxinClass": "Aconite",
"DiesterAlkaloids_ppm": "15.0",
"MonoesterAlkaloids_ppm": "350.0",
"Strychnine_percent": "0",
"Brucine_percent": "0",
"TotalAlkaloids_percent": "0.45"
}
}
],
"dataIntegrity": {
"deterministicEvaluation": true,
"sourceRowTraceability": true,
"manualOverrideAllowed": false
}
}
5. Трассировка URS → FS → тесты
| URS | FS-механизм | Проверка |
|---|---|---|
| Загрузка корректного input.csv | CSV parser + schema validator | OQ: валидный/невалидный CSV |
| Детерминированная оценка лимитов | Rule engine с фиксированной конфигурацией | OQ: граничные значения и known expected results |
| Статусы Pass/Review/Fail | Status aggregator по findings | OQ/PQ: образцы с проходными и провальными сериями |
| Прослеживаемость к исходной строке | inputTrace + recordId | PQ: сверка output.json с исходным CSV |
| Поддержка QA review | структурированные findings и warnings | PQ: review сценарии и deviation handling |
6. CSV/CSA и валидационный подход
IQ
- проверка версии утилиты;
- проверка расположения исполняемого файла;
- проверка шаблона CSV;
- контроль прав доступа.
OQ
- проверка обязательных полей;
- проверка типов данных;
- проверка граничных значений;
- проверка zero-tolerance правил.
PQ
- прогоны на реальных/репрезентативных данных;
- сверка с ручным расчётом;
- подтверждение QA review workflow.
Change control
- версионирование лимитов;
- impact assessment при изменении правил;
- регрессия после обновления.
1. Document purpose
This document defines user requirements (URS) and functional specification (FS) for TcmEndogenousToxinTransformationRatioChecker. The utility is intended to evaluate input.csv data deterministically, generate structured output.json output and support traceable QA/QC review.
This document is a project-level URS/FS baseline for CSV/CSA, IQ/OQ/PQ and further validation under an approved laboratory procedure.
2. Source utility description
3. URS — user requirements
3.1 Intended use and scope
The system shall accept tabular laboratory QC results, evaluate them against configured acceptance criteria and return a clear status for each batch or record: Pass, Review or Fail.
3.2 Regulatory / methodological basis
The source description and utility rules refer to the following framework: ChP 2020, ChP, EP. Final acceptance limits shall be confirmed by the approved specification, pharmacopoeial monograph, SOP or method-transfer protocol.
3.3 Key QC checks
- Aconitum spp.: Monoester/Diester Alkaloids Ratio (MDA/DDA ≥ 10)
- Strychnos nux-vomica: Strychnine/Brucine Ratio (0.8 – 2.5)
- Absolute content of highly toxic diester alkaloids (≤30 ppm for Aconite)
- Confirmation of hydrolysis products presence as marker of correct processing
- Aconite — Aconitine, mesaconitine, hypaconitine (diester → monoester)
- Strychnos — Strychnine, brucine (ratio and total level control)
- (In development) Pinellia — Calcium oxalates (crystalline structure)
- (In development) Datura — Scopolamine/Atropine ratio
3.4 Users
- QC analyst — prepares and loads
input.csv. - QA/QC reviewer — reviews output, findings and deviations.
- CSV/validation specialist — confirms fitness for intended use.
- System owner — controls versioning, access and change management.
3.5 Data and data-integrity requirements
- each CSV row shall be traceable to a batch, sample or analytical measurement;
- source values shall not be modified by the utility;
- calculations shall be reproducible on repeated execution;
- each deviation shall be captured as a structured finding with field and rule references;
- manual override of the final status outside QA process is not allowed.
4. FS — functional specification
4.1 Processing flow
- Verify presence and encoding of
input.csv. - Validate headers, mandatory fields and data types.
- Normalize numeric and boolean values while preserving the source trace.
- Select an adaptive rule set by product/category type, where applicable.
- Compare values with limits and compute derived metrics.
- Create a result record for each input row.
- Write
output.jsonwith summary, findings and traceability.
4.2 CSV schema
| # | CSV field | Type | Req. | Purpose |
|---|---|---|---|---|
| 1 | BatchNumber | string | Yes | Batch / lot identifier used for traceability. |
| 2 | HerbName | string | Yes | Product, preparation or sample identity. |
| 3 | ToxinClass | string | Yes | Input attribute required for deterministic rule evaluation and output traceability. |
| 4 | DiesterAlkaloids_ppm | decimal | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 5 | MonoesterAlkaloids_ppm | decimal | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 6 | Strychnine_percent | decimal | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 7 | Brucine_percent | decimal | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 8 | TotalAlkaloids_percent | decimal | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 9 | ProcessingMethod | integer | Yes | Analytical method / condition metadata required for technical review. |
4.3 Input data example
| BatchNumber | HerbName | ToxinClass | DiesterAlkaloids_ppm | MonoesterAlkaloids_ppm | Strychnine_percent | Brucine_percent | TotalAlkaloids_percent | ProcessingMethod |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TCM-ACONITE-PREP-2026-001 | Aconiti_Lateralis_Radix_Praeparata | Aconite | 15.0 | 350.0 | 0 | 0 | 0.45 | 1 |
| TCM-ACONITE-RAW-FAIL-002 | Aconiti_Lateralis_Radix_Raw | Aconite | 850.0 | 40.0 | 0 | 0 | 1.10 | 0 |
| TCM-STRYCHNOS-PROC-2026-003 | Strychni_Semen_Processed | Strychnos | 0 | 0 | 1.20 | 0.95 | 2.15 | 3 |
| TCM-STRYCHNOS-OVERHEAT-004 | Strychni_Semen_Overprocessed | Strychnos | 0 | 0 | 0.40 | 0.85 | 1.25 | 3 |
4.4 Output JSON
{
"utility": "TcmEndogenousToxinTransformationRatioChecker",
"runId": "urn:fuzkk:run:example",
"sourceFile": "input.csv",
"recordsProcessed": 4,
"overallStatus": "Pass / Review / Fail",
"records": [
{
"recordId": "TCM-ACONITE-PREP-2026-001",
"status": "Pass / Review / Fail",
"criticalFindings": [],
"warnings": [],
"evaluatedRules": [
"Configured acceptance criteria from the utility rule set"
],
"inputTrace": {
"BatchNumber": "TCM-ACONITE-PREP-2026-001",
"HerbName": "Aconiti_Lateralis_Radix_Praeparata",
"ToxinClass": "Aconite",
"DiesterAlkaloids_ppm": "15.0",
"MonoesterAlkaloids_ppm": "350.0",
"Strychnine_percent": "0",
"Brucine_percent": "0",
"TotalAlkaloids_percent": "0.45"
}
}
],
"dataIntegrity": {
"deterministicEvaluation": true,
"sourceRowTraceability": true,
"manualOverrideAllowed": false
}
}
5. Traceability URS → FS → tests
| URS | FS mechanism | Test evidence |
|---|---|---|
| Load valid input.csv | CSV parser + schema validator | OQ: valid/invalid CSV cases |
| Deterministic limit evaluation | Rule engine with fixed configuration | OQ: boundary values and known expected results |
| Pass/Review/Fail statuses | Status aggregator based on findings | OQ/PQ: passing and failing representative batches |
| Traceability to source row | inputTrace + recordId | PQ: output.json reconciliation to source CSV |
| QA review support | structured findings and warnings | PQ: review and deviation-handling scenarios |
6. CSV/CSA and validation approach
IQ
- utility version check;
- executable location check;
- CSV template check;
- access-right verification.
OQ
- mandatory field checks;
- data type checks;
- boundary-value checks;
- zero-tolerance rule checks.
PQ
- runs on real or representative data;
- comparison with manual calculation;
- confirmation of QA review workflow.
Change control
- rule and limit versioning;
- impact assessment for rule changes;
- regression after updates.
Входит в пакеты
Традиционная китайская медицина (ТКМ)
Пакет QC-утилит для ТКМ: botanical identity, fingerprint consistency, marker compounds, decoction pieces, Paozhi processing, pesticides, mycotoxins, heavy metals, sulfur fumigation, microbial limits and adulteration screening.
Открыть