ResidualHostCellDNAqPCRChecker

URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация

Документ описывает контролируемый интерфейс и поведение утилиты ResidualHostCellDNAqPCRChecker для сценария Residual Host Cell DNA qPCR Checker.

Предметные ограничения и критические параметры

• ℹ️ Утилита оценивает содержание остаточной ДНК клеток-хозяев в рекомбинантных и культуральных препаратах согласно руководствам WHO и FDA:
• • Критический лимит: < 10 нг на одну дозу препарата (для непрерывных клеточных линий).
• • Валидация метода qPCR: Коэффициент детерминации (R²) ≥ 0.98, Эффективность амплификации 90-110%.
• • Контроль пределов обнаружения (LOD) и количественного определения (LOQ).
• ⚠️ КРИТИЧНО: Превышение лимита 10 нг/дозу считается неприемлемым из-за потенциального онкогенного риска!
• ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• • Лимит 10 нг/дозу: Установлен WHO как безопасный порог для большинства рекомбинантных вакцин и белков.
• Критические параметры:
• • ДНК на дозу: < 10 нг
• • R² стандартной кривой: ≥ 0.98
• 3. Интерпретация: Если результат < LOQ, но > LOD, он считается количественно неопределенным, но качественное присутствие должно быть отмечено.
• ⚠️ Особенность: Для некоторых новых платформ (например, мРНК) требования могут варьироваться, но принцип минимизации宿主 ДНК остается золотым стандартом GMP.

URS — пользовательские требования

Контракт input.csv

BatchNumber,ProductName,CellLine,MeasuredConcentration_ng_per_ml,DilutionFactor,DoseVolume_ml,LOD_ng_per_ml,LOQ_ng_per_ml,R_Squared,Efficiency_Percent,NTC_Result
DNA-CHO-2026-001,Monoclonal Antibody,CHO-K1,0.5,10.0,1.0,0.1,0.3,0.995,98.0,Undetermined
DNA-VERO-2026-002,Vaccine Inactivated,Vero,2.0,5.0,0.5,0.2,0.5,0.990,95.0,Undetermined
DNA-FAIL-2026-003,Recombinant Protein,HEK293,15.0,1.0,1.0,0.1,0.3,0.992,99.0,Undetermined

Правила валидации входных данных

FS — функциональная спецификация

Пример output.json

{
  "utilityId": "residualhostcelldnaqpcrchecker",
  "utilityFolder": "ResidualHostCellDNAqPCRChecker",
  "package": "Vet",
  "overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
  "sourceFile": "input.csv",
  "processedAtUtc": "2026-06-10T00:00:00Z",
  "checks": [
    {
      "parameter": "BatchNumber",
      "value": "DNA-CHO-2026-001",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-001"
    },
    {
      "parameter": "ProductName",
      "value": "Monoclonal Antibody",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-002"
    },
    {
      "parameter": "CellLine",
      "value": "CHO-K1",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-003"
    },
    {
      "parameter": "MeasuredConcentration_ng_per_ml",
      "value": "0.5",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-004"
    },
    {
      "parameter": "DilutionFactor",
      "value": "10.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-005"
    },
    {
      "parameter": "DoseVolume_ml",
      "value": "1.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-006"
    },
    {
      "parameter": "LOD_ng_per_ml",
      "value": "0.1",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-007"
    },
    {
      "parameter": "LOQ_ng_per_ml",
      "value": "0.3",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-008"
    },
    {
      "parameter": "R_Squared",
      "value": "0.995",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-009"
    },
    {
      "parameter": "Efficiency_Percent",
      "value": "98.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-010"
    },
    {
      "parameter": "NTC_Result",
      "value": "Undetermined",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-011"
    }
  ],
  "criticalFindings": [],
  "warnings": [],
  "audit": {
    "inputHash": "sha256:<calculated at runtime>",
    "rulesVersion": "<utility executable version>",
    "documentation": "ResidualHostCellDNAqPCRChecker.documentation.html"
  }
}

Матрица трассируемости

IQ/OQ/PQ тестовые сценарии

QA/QC и change control

• Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
• Хранить input.csv, output.json, версию исполняемого файла и контрольную сумму.
• Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
• Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
• Утилита предоставляет формализованный QC decision support, но окончательное решение выпуска остаётся за QA/QP и утверждёнными процедурами.