qPCRIdentityAssayReviewer

URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация

Документ описывает контролируемый интерфейс и поведение утилиты qPCRIdentityAssayReviewer для сценария qPCR Identity Assay Reviewer.

Предметные ограничения и критические параметры

• ℹ️ Утилита оценивает валидность и результаты тестов молекулярной идентификации методом количественной ПЦР (qPCR) согласно Ph. Eur. 5.2.14 и ICH Q2(R1):
• • Ct (Cycle Threshold): Значение цикла, при котором сигнал превышает порог. Должно быть в пределах динамического диапазона.
• • Линейность (R²): Коэффициент детерминации стандартной кривой должен быть ≥ 0.98.
• ⚠️ КРИТИЧНО:
• • Низкая эффективность (<90%) может привести к ложноотрицательным результатам при низкой концентрации матрицы.
• Это критически важно для контроля клеточных банков (MCB/WCB) и сырья биотехнологического происхождения.
• ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• • Соответствие требованиям GMP и Фармакопей
• Критические параметры:
• • Ct Target: < 35 (или в пределах валидированного диапазона)
• • R²: ≥ 0.98
• 4. Интерпретация Ct: Высокие значения Ct (>35) могут быть неспецифическим шумом. Требуют подтверждения повторным тестом.

URS — пользовательские требования

Контракт input.csv

BatchNumber,ProductName,Ct_Value_Target,Ct_Value_Control,Amplification_Efficiency_Percent,R_Squared,Melt_Curve_Analysis,NTC_Result,Positive_Control_Ct
QPCR-ID-2026-001,Recombinant Factor VIII,22.5,18.0,98.0,0.995,Single Peak,Undetermined,21.0
QPCR-ID-2026-002,mRNA Vaccine Construct,19.5,17.5,102.0,0.990,Single Peak,Undetermined,18.5
QPCR-FAIL-CONTAM-003,Cell Bank Master,25.0,18.0,95.0,0.985,Single Peak,28.5,24.0

Правила валидации входных данных

FS — функциональная спецификация

Пример output.json

{
  "utilityId": "qpcridentityassayreviewer",
  "utilityFolder": "qPCRIdentityAssayReviewer",
  "package": "Vet",
  "overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
  "sourceFile": "input.csv",
  "processedAtUtc": "2026-06-10T00:00:00Z",
  "checks": [
    {
      "parameter": "BatchNumber",
      "value": "QPCR-ID-2026-001",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-001"
    },
    {
      "parameter": "ProductName",
      "value": "Recombinant Factor VIII",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-002"
    },
    {
      "parameter": "Ct_Value_Target",
      "value": "22.5",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-003"
    },
    {
      "parameter": "Ct_Value_Control",
      "value": "18.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-004"
    },
    {
      "parameter": "Amplification_Efficiency_Percent",
      "value": "98.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-005"
    },
    {
      "parameter": "R_Squared",
      "value": "0.995",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-006"
    },
    {
      "parameter": "Melt_Curve_Analysis",
      "value": "Single Peak",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-007"
    },
    {
      "parameter": "NTC_Result",
      "value": "Undetermined",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-008"
    },
    {
      "parameter": "Positive_Control_Ct",
      "value": "21.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-009"
    }
  ],
  "criticalFindings": [],
  "warnings": [],
  "audit": {
    "inputHash": "sha256:<calculated at runtime>",
    "rulesVersion": "<utility executable version>",
    "documentation": "qPCRIdentityAssayReviewer.documentation.html"
  }
}

Матрица трассируемости

IQ/OQ/PQ тестовые сценарии

QA/QC и change control

• Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
• Хранить input.csv, output.json, версию исполняемого файла и контрольную сумму.
• Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
• Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
• Утилита предоставляет формализованный QC decision support, но окончательное решение выпуска остаётся за QA/QP и утверждёнными процедурами.