ProteinResidueAnalyzer
Protein Residue Analyzer
Protein Residue Analyzer — Анализ остаточного белка и аллергенов (Ph. Eur., USP)
ℹ️ Утилита проверяет общий белок, специфические аллергены, валидность теста (R², контроли).
ℹ️ Не использует машинное обучение — только правила.
⚠️ КРИТИЧНО! Общий белок ≤ 10 ppm. Специфический аллерген ≤ 5 ppm. Валидность теста обязательна!
Использование:
ProteinResidueAnalyzer.exe → демо-режим
ProteinResidueAnalyzer.exe input.csv output.json → оценка данных
Формат input.csv:
BatchNumber,Total_Protein_ppm,Specific_Allergen_ppm,Sample_Weight_mg,Dilution_Factor,Absorbance_OD,Standard_Curve_R2,Positive_Control_Recovery_Percent,Negative_Control_OD,LOD_ppm,LOQ_ppm,pH_Value,SterilityTest,Endotoxin_EU_ml,Test_Method
Пример:
PROT-HA-2026-001,4.5,2.1,50.0,10.0,0.35,0.995,95.0,0.05,0.5,1.5,7.2,0,0.1,ELISA
— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Контроль остаточного белка критичен для филлеров небиоферментированного происхождения (из гребней петухов) и коллагеновых препаратов:
• Остаточный белок — сильный аллерген, может вызывать анафилактический шок при повторном введении
• Специфические аллергены (птичий, бычий) требуют отдельного количественного определения (ELISA)
• Методы анализа: ИФА (ELISA), BCA, Лоури — все требуют строгой валидации калибровочной кривой
⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• Общий белок ≤ 10 ppm — стандарт безопасности для инъекционных форм ГК
• Специфический аллерген ≤ 5 ppm — более строгий лимит для видоспецифичных белков
• Валидность теста: R² ≥ 0.98 (линейность), восстановление положительного контроля 70–130%, отрицательный контроль чистый
• Если тест невалиден — результат не может быть использован для выпуска партии
• Стерильность и эндотоксины — обязательные сопутствующие параметры
⚠️ Особенность: Утилита сначала проверяет валидность аналитической процедуры. Если калибровочная кривая нелинейна или контроли не прошли, выносится вердикт "INVALID". Это предотвращает ложный выпуск на основе некорректных данных. Раздельный контроль общего и специфического белка позволяет точно оценить риск аллергии. Для биоферментированной ГК уровень белка обычно ниже предела обнаружения, но анализ все равно проводится для подтверждения чистоты процесса.
input.csv
BatchNumber,Total_Protein_ppm,Specific_Allergen_ppm,Sample_Weight_mg,Dilution_Factor,Absorbance_OD,Standard_Curve_R2,Positive_Control_Recovery_Percent,Negative_Control_OD,LOD_ppm,LOQ_ppm,pH_Value,SterilityTest,Endotoxin_EU_ml,Test_Method PROT-HA-2026-001,4.5,2.1,50.0,10.0,0.35,0.995,95.0,0.05,0.5,1.5,7.2,0,0.1,ELISA
URS & FS — пользовательские требования и функциональная спецификация
Этот документ описывает требования пользователя и функциональную спецификацию для утилиты контроля качества. Он предназначен для обсуждения внедрения, подготовки IQ/OQ и интеграции в контур ОКК/QC.
1. Область применения
Утилита Protein Residue Analyzer применяется для объекта Protein Residue Analyzer. Источником истины для структуры входных данных является фактический input.csv; критерии контроля задаются исполняемым модулем и предметным описанием.
Утилита не использует машинное обучение; решение формируется детерминированными правилами.
Категории: Dermal fillers
Теги: dermal fillers, endotoxins, hyaluronic acid, particles, rheology, sterility
2. Режимы запуска
ProteinResidueAnalyzer.exe → демо-режим ProteinResidueAnalyzer.exe input.csv output.json → оценка данных
3. Ключевые контролируемые области
- микробиология и патогены
- pH и физико-химические параметры
4. Предметные ограничения и критические параметры
- ⚠️ КРИТИЧНО! Общий белок ≤ 10 ppm. Специфический аллерген ≤ 5 ppm. Валидность теста обязательна!
- ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
- Общий белок ≤ 10 ppm — стандарт безопасности для инъекционных форм ГК
- Специфический аллерген ≤ 5 ppm — более строгий лимит для видоспецифичных белков
- Валидность теста: R² ≥ 0.98 (линейность), восстановление положительного контроля 70–130%, отрицательный контроль чистый
- Если тест невалиден — результат не может быть использован для выпуска партии
- Стерильность и эндотоксины — обязательные сопутствующие параметры
- ⚠️ Особенность: Утилита сначала проверяет валидность аналитической процедуры. Если калибровочная кривая нелинейна или контроли не прошли, выносится вердикт "INVALID". Это предотвращает ложный выпуск на основе некорректных данных. Раздельный контроль общего и специфического белка позволяет точно оценить риск аллергии. Для биоферментированной ГК уровень белка обычно ниже предела обнаружения, но анализ все равно проводится для подтверждения чистоты процесса.
5. URS — пользовательские требования
| ID | Требование | Критичность | Критерий приемки |
|---|---|---|---|
| URS-001 | Система должна принимать файл input.csv для Protein Residue Analyzer с точным набором колонок, перечисленным в разделе «Контракт входных данных». | High | Файл с корректным заголовком читается без ручного редактирования; отсутствие обязательной колонки приводит к FAIL/ошибке импорта. |
| URS-002 | Система должна обрабатывать запуск без аргументов в демонстрационном режиме и запуск с аргументами input.csv output.json для пользовательских данных. | Medium | Оба сценария запуска дают предсказуемый результат или понятное сообщение об ошибке. |
| URS-003 | Система должна выполнять rule-based контроль по областям: микробиология и патогены, pH и физико-химические параметры. | High | Каждый контролируемый параметр получает статус и сообщение; результат не зависит от скрытых Excel-формул или ML. |
| URS-004 | Система должна сохранять трассируемость между серией/партией, исходными значениями, применёнными правилами и итоговым вердиктом. | High | В выходе присутствуют идентификатор серии, исходные значения, статусы параметров и критические находки. |
| URS-005 | Система должна формировать машинно-читаемый output.json для LIMS/ELN/MES, batch record и QA/QC review. | High | JSON содержит общий статус, массив проверок, предупреждения, отказы и ссылку на исходный файл. |
| URS-006 | Система должна поддерживать применение в валидационном пакете клиента: URS/FS, IQ/OQ-подготовка, проверка установки и операционных сценариев. | High | Документ, тестовые сценарии и воспроизводимый CSV/JSON-поток пригодны для аудита и внутреннего согласования. |
| URS-007 | Система должна явно отделять технические ошибки данных от предметных несоответствий спецификации. | Medium | Ошибки схемы/типов не смешиваются с фармакопейными отклонениями и отображаются отдельно. |
6. Контракт входных данных input.csv
Источник истины для схемы входа — фактический заголовок input.csv. Имена колонок технические и не переводятся.
| # | Колонка | Тип | Ед. | Описание | Пример | Правило контроля |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | BatchNumber | идентификатор | as specified | Batch Number | PROT-HA-2026-001 | обязательное поле; используется для трассируемости серии/партии |
| 2 | Total_Protein_ppm | десятичное число | ppm | Total Protein ppm | 4.5 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 3 | Specific_Allergen_ppm | десятичное число | ppm | Specific Allergen ppm | 2.1 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 4 | Sample_Weight_mg | десятичное число | as specified | Sample Weight mg | 50.0 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 5 | Dilution_Factor | десятичное число | as specified | Dilution Factor | 10.0 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 6 | Absorbance_OD | десятичное число | as specified | Absorbance OD | 0.35 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 7 | Standard_Curve_R2 | десятичное число | as specified | Standard Curve R2 | 0.995 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 8 | Positive_Control_Recovery_Percent | логический флаг | % | Positive Control Recovery % | 95.0 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 9 | Negative_Control_OD | логический флаг | as specified | Negative Control OD | 0.05 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 10 | LOD_ppm | десятичное число | ppm | LOD ppm | 0.5 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 11 | LOQ_ppm | десятичное число | ppm | LOQ ppm | 1.5 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 12 | pH_Value | десятичное число | pH | p H Value | 7.2 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 13 | SterilityTest | логический флаг | 0/1 | Sterility Test | 0 | значение должно быть допустимым флагом; для запрещённых микроорганизмов и роста обычно ожидается 0 / отсутствие |
| 14 | Endotoxin_EU_ml | десятичное число | as specified | Endotoxin EU ml | 0.1 | число; критический показатель безопасности, сравнивается с лимитом эндотоксинов |
| 15 | Test_Method | текст | as specified | Test Method | ELISA | обязательное значение; формат и допустимость проверяются утилитой |
Пример CSV
BatchNumber,Total_Protein_ppm,Specific_Allergen_ppm,Sample_Weight_mg,Dilution_Factor,Absorbance_OD,Standard_Curve_R2,Positive_Control_Recovery_Percent,Negative_Control_OD,LOD_ppm,LOQ_ppm,pH_Value,SterilityTest,Endotoxin_EU_ml,Test_Method PROT-HA-2026-001,4.5,2.1,50.0,10.0,0.35,0.995,95.0,0.05,0.5,1.5,7.2,0,0.1,ELISA
7. FS — функциональная спецификация
| ID | Функция | Описание реализации |
|---|---|---|
| FS-001 | CLI entry point | Исполняемый файл ProteinResidueAnalyzer.exe принимает режим демонстрации и режим обработки input.csv output.json. |
| FS-002 | CSV parser | Модуль импорта читает CSV, проверяет заголовок, порядок/наличие колонок, количество значений и кодировку. Для десятичных значений ожидается точка. |
| FS-003 | Field conversion | Для каждой колонки выполняется преобразование к ожидаемому типу: идентификатор, текст, десятичное число, дата/время или логический флаг. |
| FS-004 | Domain rule engine | Для объекта Protein Residue Analyzer применяются явные правила: диапазон, минимум, максимум, отсутствие запрещённого признака, полнота данных или расчётная проверка. |
| FS-005 | Criticality handling | Критичные нарушения формируют FAIL; некритичные отклонения и неполные данные формируют WARNING; соответствие всем правилам формирует PASS. |
| FS-006 | JSON writer | output.json сохраняет общий статус, результаты по каждому параметру, исходные значения, предупреждения, отказы и диагностические сообщения. |
| FS-007 | Integration contract | Формат CSV → JSON стабилен для вызова из LIMS/ELN/MES, планировщика задач или wrapper-сервиса. |
| FS-008 | Error handling | При ошибке схемы, отсутствующем файле, нечисловом значении или невозможности записи JSON возвращается диагностируемая ошибка без тихого PASS. |
8. Выходной контракт output.json
Выходной файл должен быть пригоден для автоматической обработки, аудита и сопоставления с исходной строкой input.csv.
{
"utility": "ProteinResidueAnalyzer",
"api": "Protein Residue Analyzer",
"batchNumber": "PROT-HA-2026-001",
"overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
"checkedAtUtc": "2026-05-18T00:00:00Z",
"checks": [
{
"parameter": "BatchNumber",
"value": "PROT-HA-2026-001",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Total_Protein_ppm",
"value": "4.5",
"unit": "ppm",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Specific_Allergen_ppm",
"value": "2.1",
"unit": "ppm",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Sample_Weight_mg",
"value": "50.0",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Dilution_Factor",
"value": "10.0",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Absorbance_OD",
"value": "0.35",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Standard_Curve_R2",
"value": "0.995",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Positive_Control_Recovery_Percent",
"value": "95.0",
"unit": "%",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
}
],
"criticalFindings": [],
"sourceFile": "input.csv"
}9. Тестовые сценарии OQ/PQ
| ID | Сценарий | Ожидаемый результат |
|---|---|---|
| TC-001 | Валидный CSV с заголовком и строкой из примера | Все строки обработаны; результат содержит PASS/WARNING/FAIL и детализацию по параметрам. |
| TC-002 | Отсутствует обязательная колонка из input.csv | Импорт отклоняется или строка получает FAIL со ссылкой на схему. |
| TC-003 | Числовое поле содержит текст или пустое значение | Фиксируется ошибка преобразования типа; результат не маскируется как PASS. |
| TC-004 | Параметр выходит за предел спецификации / критического лимита | Для критического параметра формируется FAIL; для некритического — WARNING согласно правилу. |
| TC-005 | Положительный патогенный/микробиологический флаг или превышение микробиологического лимита | Формируется критический FAIL с указанием параметра. |
10. QA/QC, CSV и управление изменениями
- Перед применением на производстве клиент фиксирует версию исполняемого файла, контрольную сумму, версию спецификации/монографии, тестовый CSV, ожидаемый JSON и результаты IQ/OQ.
- Нельзя менять имена колонок без обновления валидатора и тестовых сценариев.
- Исходный CSV, output.json и версия утилиты должны храниться вместе как пакет доказательств.
- Любое изменение правил контроля должно проходить change control и повторную проверку OQ-сценариев.
Входит в пакеты
Dermal Fillers QC Suite
Пакет для контроля качества инъекционных имплантатов и дермальных филлеров: гиалуроновая кислота, CaHA, PLLA, PMMA, коллаген и смежные испытания.
Открыть