MicrobiologicalQualityChecker

Microbiological

antibiotics biologics heavy metals herbal microbiology particulate contamination Ph. Eur. pharmacopoeia
Открыть подборку

Microbiological Quality Checker — Проверка микробиологического качества (Ph. Eur. 5.1.4, 5.1.8)

ℹ️ Утилита проверяет соответствие микробиологических показателей требованиям Европейской фармакопеи.
ℹ️ Не использует машинное обучение — только правила.

Использование:
MicrobiologicalQualityChecker.exe → демо-режим (вывод в консоль)
MicrobiologicalQualityChecker.exe input.csv output.json → оценка ваших данных

Формат input.csv:
ProductName,BatchNumber,ProductCategory,TotalAerobicMicrobialCount,YeastAndMoldCount,EscherichiaColiDetected,SalmonellaDetected,PseudomonasAeruginosaDetected

Пример:
Peppermint_Leaves,B20250110,HerbalOral,10000,100,false,false,false

ProductCategory: OralNonAntibiotic, Topical, HerbalOral, Rectal

— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Микробиологическое качество — ключевой параметр безопасности:
• Превышение КМАФАнМ — риск порчи и инфекции,
• Обнаружение патогенов (E. coli, Salmonella) — недопустимо,
• Для растительного сырья допускаются более высокие пределы (до 10⁴ КОЕ/г).
Соответствие Ph. Eur. 5.1.4 и 5.1.8 обязательно для всех нестерильных ЛС.

input.csv

ProductName,BatchNumber,ProductCategory,TotalAerobicMicrobialCount,YeastAndMoldCount,EscherichiaColiDetected,SalmonellaDetected,PseudomonasAeruginosaDetected
Peppermint_Leaves,B20250110,HerbalOral,10000,100,false,false,false

URS & FS — пользовательские требования и функциональная спецификация

Этот документ описывает требования пользователя и функциональную спецификацию для утилиты контроля качества. Он предназначен для обсуждения внедрения, подготовки IQ/OQ и интеграции в контур ОКК/QC.

Утилита: MicrobiologicalQualityCheckerAPI / объект: MicrobiologicalКатегория: Pharmacopoeial methods

1. Область применения

Утилита Microbiological Quality Checker применяется для объекта Microbiological. Источником истины для структуры входных данных является фактический input.csv; критерии контроля задаются исполняемым модулем и предметным описанием.

Утилита не использует машинное обучение; решение формируется детерминированными правилами.

Категории: Pharmacopoeial methods

Теги: antibiotics, biologics, heavy metals, herbal, microbiology, particulate contamination, Ph. Eur., pharmacopoeia, residual solvents

2. Режимы запуска

MicrobiologicalQualityChecker.exe                            → демо-режим (вывод в консоль)
MicrobiologicalQualityChecker.exe input.csv output.json      → оценка ваших данных

3. Ключевые контролируемые области

  • остаточные растворители
  • микробиология и патогены
  • тяжёлые металлы / элементные примеси
  • pH и физико-химические параметры

4. Предметные ограничения и критические параметры

В исходном описании нет отдельного списка критических ограничений; применяются правила, реализованные в исполняемом модуле и определённые CSV-схемой.

Пределы, указанные в описании, должны быть сверены с актуальной утверждённой спецификацией, фармакопейной монографией и регистрационным досье перед продуктивным применением.

5. URS — пользовательские требования

IDТребованиеКритичностьКритерий приемки
URS-001Система должна принимать файл input.csv для Microbiological с точным набором колонок, перечисленным в разделе «Контракт входных данных».HighФайл с корректным заголовком читается без ручного редактирования; отсутствие обязательной колонки приводит к FAIL/ошибке импорта.
URS-002Система должна обрабатывать запуск без аргументов в демонстрационном режиме и запуск с аргументами input.csv output.json для пользовательских данных.MediumОба сценария запуска дают предсказуемый результат или понятное сообщение об ошибке.
URS-003Система должна выполнять rule-based контроль по областям: остаточные растворители, микробиология и патогены, тяжёлые металлы / элементные примеси, pH и физико-химические параметры.HighКаждый контролируемый параметр получает статус и сообщение; результат не зависит от скрытых Excel-формул или ML.
URS-004Система должна сохранять трассируемость между серией/партией, исходными значениями, применёнными правилами и итоговым вердиктом.HighВ выходе присутствуют идентификатор серии, исходные значения, статусы параметров и критические находки.
URS-005Система должна формировать машинно-читаемый output.json для LIMS/ELN/MES, batch record и QA/QC review.HighJSON содержит общий статус, массив проверок, предупреждения, отказы и ссылку на исходный файл.
URS-006Система должна поддерживать применение в валидационном пакете клиента: URS/FS, IQ/OQ-подготовка, проверка установки и операционных сценариев.HighДокумент, тестовые сценарии и воспроизводимый CSV/JSON-поток пригодны для аудита и внутреннего согласования.
URS-007Система должна явно отделять технические ошибки данных от предметных несоответствий спецификации.MediumОшибки схемы/типов не смешиваются с фармакопейными отклонениями и отображаются отдельно.

6. Контракт входных данных input.csv

Источник истины для схемы входа — фактический заголовок input.csv. Имена колонок технические и не переводятся.

#КолонкаТипЕд.ОписаниеПримерПравило контроля
1ProductNameидентификаторas specifiedProduct NamePeppermint_Leavesобязательное значение; формат и допустимость проверяются утилитой
2BatchNumberидентификаторas specifiedBatch NumberB20250110обязательное поле; используется для трассируемости серии/партии
3ProductCategoryтекстas specifiedProduct CategoryHerbalOralобязательное значение; формат и допустимость проверяются утилитой
4TotalAerobicMicrobialCountдесятичное числоas specifiedTotal Aerobic Microbial Count10000число; сравнивается с микробиологическими пределами
5YeastAndMoldCountдесятичное числоas specifiedYeast And Mold Count100число; сравнивается с микробиологическими пределами
6EscherichiaColiDetectedлогический флаг0/1Escherichia Coli Detectedfalseзначение должно быть допустимым флагом; для запрещённых микроорганизмов и роста обычно ожидается 0 / отсутствие
7SalmonellaDetectedлогический флаг0/1Salmonella Detectedfalseзначение должно быть допустимым флагом; для запрещённых микроорганизмов и роста обычно ожидается 0 / отсутствие
8PseudomonasAeruginosaDetectedлогический флаг0/1Pseudomonas Aeruginosa Detectedfalseзначение должно быть допустимым флагом; для запрещённых микроорганизмов и роста обычно ожидается 0 / отсутствие

Пример CSV

ProductName,BatchNumber,ProductCategory,TotalAerobicMicrobialCount,YeastAndMoldCount,EscherichiaColiDetected,SalmonellaDetected,PseudomonasAeruginosaDetected
Peppermint_Leaves,B20250110,HerbalOral,10000,100,false,false,false

7. FS — функциональная спецификация

IDФункцияОписание реализации
FS-001CLI entry pointИсполняемый файл MicrobiologicalQualityChecker.exe принимает режим демонстрации и режим обработки input.csv output.json.
FS-002CSV parserМодуль импорта читает CSV, проверяет заголовок, порядок/наличие колонок, количество значений и кодировку. Для десятичных значений ожидается точка.
FS-003Field conversionДля каждой колонки выполняется преобразование к ожидаемому типу: идентификатор, текст, десятичное число, дата/время или логический флаг.
FS-004Domain rule engineДля объекта Microbiological применяются явные правила: диапазон, минимум, максимум, отсутствие запрещённого признака, полнота данных или расчётная проверка.
FS-005Criticality handlingКритичные нарушения формируют FAIL; некритичные отклонения и неполные данные формируют WARNING; соответствие всем правилам формирует PASS.
FS-006JSON writeroutput.json сохраняет общий статус, результаты по каждому параметру, исходные значения, предупреждения, отказы и диагностические сообщения.
FS-007Integration contractФормат CSV → JSON стабилен для вызова из LIMS/ELN/MES, планировщика задач или wrapper-сервиса.
FS-008Error handlingПри ошибке схемы, отсутствующем файле, нечисловом значении или невозможности записи JSON возвращается диагностируемая ошибка без тихого PASS.

8. Выходной контракт output.json

Выходной файл должен быть пригоден для автоматической обработки, аудита и сопоставления с исходной строкой input.csv.

{
  "utility": "MicrobiologicalQualityChecker",
  "api": "Microbiological",
  "batchNumber": "B20250110",
  "overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
  "checkedAtUtc": "2026-05-18T00:00:00Z",
  "checks": [
    {
      "parameter": "ProductName",
      "value": "Peppermint_Leaves",
      "unit": "as specified",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Результат проверки по правилу"
    },
    {
      "parameter": "BatchNumber",
      "value": "B20250110",
      "unit": "as specified",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Результат проверки по правилу"
    },
    {
      "parameter": "ProductCategory",
      "value": "HerbalOral",
      "unit": "as specified",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Результат проверки по правилу"
    },
    {
      "parameter": "TotalAerobicMicrobialCount",
      "value": "10000",
      "unit": "as specified",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Результат проверки по правилу"
    },
    {
      "parameter": "YeastAndMoldCount",
      "value": "100",
      "unit": "as specified",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Результат проверки по правилу"
    },
    {
      "parameter": "EscherichiaColiDetected",
      "value": "false",
      "unit": "0/1",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Результат проверки по правилу"
    },
    {
      "parameter": "SalmonellaDetected",
      "value": "false",
      "unit": "0/1",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Результат проверки по правилу"
    },
    {
      "parameter": "PseudomonasAeruginosaDetected",
      "value": "false",
      "unit": "0/1",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Результат проверки по правилу"
    }
  ],
  "criticalFindings": [],
  "sourceFile": "input.csv"
}

9. Тестовые сценарии OQ/PQ

IDСценарийОжидаемый результат
TC-001Валидный CSV с заголовком и строкой из примераВсе строки обработаны; результат содержит PASS/WARNING/FAIL и детализацию по параметрам.
TC-002Отсутствует обязательная колонка из input.csvИмпорт отклоняется или строка получает FAIL со ссылкой на схему.
TC-003Числовое поле содержит текст или пустое значениеФиксируется ошибка преобразования типа; результат не маскируется как PASS.
TC-004Параметр выходит за предел спецификации / критического лимитаДля критического параметра формируется FAIL; для некритического — WARNING согласно правилу.
TC-005Положительный патогенный/микробиологический флаг или превышение микробиологического лимитаФормируется критический FAIL с указанием параметра.

10. QA/QC, CSV и управление изменениями

  • Перед применением на производстве клиент фиксирует версию исполняемого файла, контрольную сумму, версию спецификации/монографии, тестовый CSV, ожидаемый JSON и результаты IQ/OQ.
  • Нельзя менять имена колонок без обновления валидатора и тестовых сценариев.
  • Исходный CSV, output.json и версия утилиты должны храниться вместе как пакет доказательств.
  • Любое изменение правил контроля должно проходить change control и повторную проверку OQ-сценариев.

Входит в пакеты

European Pharmacopoeia QC Suite

Утилиты для общих фармакопейных методов и испытаний по европейскому регуляторному контуру.

Открыть

Проктология

Пакет для проктологии: местные анестетики, кортикостероиды, противовоспалительные, антиинфекционные и вспомогательные препараты для ректальных лекарственных форм.

Открыть