HemagglutinationTiterChecker
Hemagglutination Titer
Vet veterinary veterinary vaccines animal health adjuvants aquaculture batch release CSV→JSON
Открыть подборкуОписание утилиты: Hemagglutination Titer
Hemagglutination Titer Checker — Контроль титра гемагглютинации (HA)
ℹ️ Утилита оценивает активность гемагглютинина в вирусных вакцинах (преимущественно гриппозных) согласно требованиям Ph. Eur. и WHO:
• Титр гемагглютинации (HA Titer): Количественная мера способности вируса агглютинировать эритроциты.
• Валидность контроля: Титр контрольной сыворотки должен соответствовать ожидаемому значению (в пределах одной ступени разведения).
• Паттерн агглютинации: Проверка на отсутствие эффекта прозоны (избыток антител/антигена) или слабой реакции.
• Тип эритроцитов: Учет вида животных (курица, индейка, морская свинка), так как чувствительность различается.
⚠️ КРИТИЧНО:
• Низкий титр HA указывает на низкое содержание антигена, что снижает эффективность вакцины.
• Эффект прозоны (Prozone) может привести к ложноотрицательному результату или занижению титра.
• Невалидный контроль сыворотки аннулирует весь тест.
Использование:
HemagglutinationTiterChecker.exe → демо-режим (вывод в консоль)
HemagglutinationTiterChecker.exe input.csv output.json → оценка ваших данных
Формат input.csv:
BatchNumber,ProductName,MeasuredHATiter,MinRequiredHATiter,RBC_Type,ControlSerumTiter,ExpectedControlTiter,AgglutinationPattern
Пример:
HA-001,Flu H1N1,256,128,1,64,64,Normal
— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Для инактивированных гриппозных вакцин содержание гемагглютинина является ключевым показателем дозы антигена (обычно 15 мкг HA на штамм).
Тест HA используется для стандартизации антигена перед формулированием вакцины и для контроля стабильности.
Это быстрый и недорогой скрининговый метод, часто используемый в паре с SRID (Single Radial Immunodiffusion).
⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• Чувствительность эритроцитов: Разные штаммы вируса лучше агглютинируют эритроциты разных видов птиц. Выбор правильного типа RBC критичен.
• Температура: Тест обычно проводится при 4°C или комнатной температуре в зависимости от протокола.
• Время инкубации: Чтение результатов должно проводиться в строго определенное время до оседания эритроцитов.
• Специфичность: HA не является специфичным только для инфекционного вируса; он измеряет все частицы с гемагглютинином (включая дефектные).
Ключевые особенности утилиты:
• Проверка соответствия титра минимальным требованиям
• Валидация теста через контрольную сыворотку
• Детекция аномалий агглютинации (прозона)
• Генерация отчетов для отделов биоконтроля и LIMS LabWare
• Соответствие требованиям Ph. Eur. и WHO для гриппозных вакцин
Критические параметры:
• Титр HA: ≥ Заявленного значения (например, 128 HAU)
• Отклонение контроля: ≤ 25%
• Паттерн: Normal (без прозоны)
💡 Советы по использованию:
1. Приготовление суспензии RBC: Концентрация эритроцитов должна быть стандартной (обычно 0.5-1.0%).
2. Встряхивание: Аккуратное встряхивание планшета перед чтением необходимо для различения истинной агглютинации и осадка.
3. Интерпретация прозоны: Если наблюдается прозона, пробу следует дополнительно развести и повторить тест.
4. Корреляция с SRID: HA титр коррелирует с содержанием белка, но SRID является более специфичным методом для количественного определения иммуногенного HA.
5. Хранение RBC: Эритроциты должны быть свежими или правильно стабилизированными (Alsever's solution).
⚠️ Особенность: Хотя HA является стандартным тестом, для современных адъювантных или рекомбинантных вакцин могут требоваться дополнительные методы подтверждения активности (например, нейраминидазная активность или ELISA).input.csv
BatchNumber,ProductName,MeasuredHATiter,MinRequiredHATiter,RBC_Type,ControlSerumTiter,ExpectedControlTiter,AgglutinationPattern HA-FLU-2026-001,Influenza A/H1N1 Antigen,256,128,1,64,64,Normal HA-FLU-2026-002,Influenza B/Yamagata,128,128,2,32,32,Normal HA-FAIL-2026-003,Influenza A/H3N2,64,128,1,60,64,Prozone
URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация
Документ описывает контролируемый интерфейс и поведение утилиты HemagglutinationTiterChecker для сценария Hemagglutination Titer Checker.
Предметные ограничения и критические параметры
Ниже приведены ключевые фрагменты исходного описания. Перед продуктивным применением пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
- ℹ️ Утилита оценивает активность гемагглютинина в вирусных вакцинах (преимущественно гриппозных) согласно требованиям Ph. Eur. и WHO:
- • Валидность контроля: Титр контрольной сыворотки должен соответствовать ожидаемому значению (в пределах одной ступени разведения).
- ⚠️ КРИТИЧНО:
- ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
- • Чувствительность эритроцитов: Разные штаммы вируса лучше агглютинируют эритроциты разных видов птиц. Выбор правильного типа RBC критичен.
- • Время инкубации: Чтение результатов должно проводиться в строго определенное время до оседания эритроцитов.
- • Соответствие требованиям Ph. Eur. и WHO для гриппозных вакцин
- Критические параметры:
- • Титр HA: ≥ Заявленного значения (например, 128 HAU)
- • Отклонение контроля: ≤ 25%
- 4. Корреляция с SRID: HA титр коррелирует с содержанием белка, но SRID является более специфичным методом для количественного определения иммуногенного HA.
URS — пользовательские требования
| ID | Требование | Критичность | Критерий приемки |
|---|---|---|---|
| URS-001 | Утилита должна принимать файл input.csv для Hemagglutination Titer Checker с заголовками, определёнными в контракте данных. | High | Файл обрабатывается без ручного изменения заголовков. |
| URS-002 | Утилита должна выполнять детерминированную оценку QC/ОКК без машинного обучения и без вероятностного принятия решения о соответствии. | High | При одинаковых входных данных, версии правил и конфигурации результат полностью воспроизводим. |
| URS-003 | Утилита должна валидировать обязательные поля, типы данных, диапазоны, единицы измерения и предметную правдоподобность значений. | High | Ошибки схемы, преобразования и диапазона явно отражаются в результате. |
| URS-004 | Утилита должна применять предметные пределы и правила из описания, утверждённой спецификации, регистрационного досье и локальных SOP. | High | Каждая проверка имеет результат PASS/WARNING/FAIL и понятное сообщение. |
| URS-005 | Утилита должна формировать output.json с машинно-читаемыми результатами, исходными значениями, предупреждениями, отказами и критическими находками. | High | JSON пригоден для LIMS/ELN/MES-интеграции и QA/QC review. |
| URS-006 | Утилита должна сохранять трассируемость между серией/образцом, входным файлом, применёнными правилами и итоговым статусом. | High | Выход содержит идентификаторы, список параметров и audit metadata. |
| URS-007 | Документация должна поддерживать подготовку IQ/OQ/PQ, CSV/CSA и обсуждение с инспекторами или внутренним QA. | Medium | URS, FS, контракт input/output и тестовые сценарии поставляются вместе с утилитой. |
| URS-008 | Утилита должна использоваться как decision-support инструмент QC, а не как замена утверждённым спецификациям и выпускному решению Qualified Person/QA. | Medium | В документации указан контроль change control и необходимость сверки пределов. |
Контракт input.csv
| # | Поле | Тип | Пример | Назначение |
|---|---|---|---|---|
| 1 | BatchNumber | string / controlled vocabulary | HA-FLU-2026-001 | Идентификатор серии/партии для трассируемости. |
| 2 | ProductName | string / controlled vocabulary | Influenza A/H1N1 Antigen | Наименование продукта или проверяемой лекарственной формы. |
| 3 | MeasuredHATiter | decimal | 256 | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
| 4 | MinRequiredHATiter | decimal | 128 | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
| 5 | RBC_Type | string / controlled vocabulary | 1 | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
| 6 | ControlSerumTiter | string / controlled vocabulary | 64 | Контрольная точка/контрольный образец для валидности серии анализа. |
| 7 | ExpectedControlTiter | decimal | 64 | Контрольная точка/контрольный образец для валидности серии анализа. |
| 8 | AgglutinationPattern | string / controlled vocabulary | Normal | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
BatchNumber,ProductName,MeasuredHATiter,MinRequiredHATiter,RBC_Type,ControlSerumTiter,ExpectedControlTiter,AgglutinationPattern HA-FLU-2026-001,Influenza A/H1N1 Antigen,256,128,1,64,64,Normal HA-FLU-2026-002,Influenza B/Yamagata,128,128,2,32,32,Normal HA-FAIL-2026-003,Influenza A/H3N2,64,128,1,60,64,Prozone
Правила валидации входных данных
| ID | Поле | Правило | Критичность |
|---|---|---|---|
| VR-001 | BatchNumber | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | High |
| VR-002 | ProductName | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | High |
| VR-003 | MeasuredHATiter | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | High |
| VR-004 | MinRequiredHATiter | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-005 | RBC_Type | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-006 | ControlSerumTiter | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-007 | ExpectedControlTiter | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-008 | AgglutinationPattern | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
FS — функциональная спецификация
| ID | Функция | Реализация |
|---|---|---|
| FS-001 | CLI execution | Поддержать режимы запуска: demo mode без аргументов и production mode input.csv output.json. |
| FS-002 | CSV import | Прочитать input.csv в UTF-8/CSV-совместимом формате, проверить наличие заголовка и ожидаемых колонок. |
| FS-003 | Schema validation | Проверить обязательные поля, количество колонок, неизвестные ключевые поля и пустые обязательные значения. |
| FS-004 | Type conversion | Преобразовать числовые, флаговые и текстовые значения; некорректный формат фиксировать как ошибку строки. |
| FS-005 | Domain rule engine | Применить правила для Hemagglutination Titer Checker, включая критические пределы из описания и утверждённой спецификации. |
| FS-006 | Status aggregation | Сформировать итоговый статус: FAIL при критическом отказе, WARNING при некритическом отклонении, PASS при соответствии. |
| FS-007 | JSON export | Записать output.json с детализацией проверок, исходными значениями, предупреждениями, отказами и critical findings. |
| FS-008 | Audit support | Сохранять структуру результата пригодной для review, расследования отклонений и воспроизведения расчёта. |
| FS-009 | Integration contract | Поддержать сценарий LIMS/ELN/MES → input.csv → utility → output.json → portal/admin review. |
| FS-010 | Error handling | Возвращать явные сообщения для отсутствующего файла, пустого CSV, неверной схемы, ошибки записи output.json и некорректного формата. |
Пример output.json
{
"utilityId": "hemagglutinationtiterchecker",
"utilityFolder": "HemagglutinationTiterChecker",
"package": "Vet",
"overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
"sourceFile": "input.csv",
"processedAtUtc": "2026-06-10T00:00:00Z",
"checks": [
{
"parameter": "BatchNumber",
"value": "HA-FLU-2026-001",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-001"
},
{
"parameter": "ProductName",
"value": "Influenza A/H1N1 Antigen",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-002"
},
{
"parameter": "MeasuredHATiter",
"value": "256",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-003"
},
{
"parameter": "MinRequiredHATiter",
"value": "128",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-004"
},
{
"parameter": "RBC_Type",
"value": "1",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-005"
},
{
"parameter": "ControlSerumTiter",
"value": "64",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-006"
},
{
"parameter": "ExpectedControlTiter",
"value": "64",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-007"
},
{
"parameter": "AgglutinationPattern",
"value": "Normal",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-008"
}
],
"criticalFindings": [],
"warnings": [],
"audit": {
"inputHash": "sha256:<calculated at runtime>",
"rulesVersion": "<utility executable version>",
"documentation": "HemagglutinationTiterChecker.documentation.html"
}
}
Матрица трассируемости
| URS | FS | Тест | Подтверждение |
|---|---|---|---|
| URS-001 | FS-001, FS-002 | OQ-001 | Проверить запуск и импорт валидного input.csv. |
| URS-002 | FS-005, FS-006 | OQ-004 | Повторить один и тот же набор данных и сравнить output.json. |
| URS-003 | FS-003, FS-004, FS-010 | OQ-002, OQ-003 | Проверить отсутствующие колонки и неверные типы. |
| URS-004 | FS-005, FS-006 | OQ-004, PQ-001 | Проверить критические отклонения по реальным/граничным данным. |
| URS-005 | FS-007, FS-009 | OQ-005 | Проверить JSON schema и пригодность для downstream-систем. |
| URS-006 | FS-008 | OQ-006 | Проверить наличие идентификаторов и audit metadata. |
| URS-007 | FS-008, FS-010 | IQ-001, OQ-007 | Проверить комплектность документации и control evidence. |
| URS-008 | FS-005, FS-008 | PQ-002 | Проверить review workflow и запрет автоматической замены QA-решения. |
IQ/OQ/PQ тестовые сценарии
| ID | Сценарий | Ожидаемый результат |
|---|---|---|
| IQ-001 | Проверить наличие executable, input.csv, документации и контрольной суммы. | Комплект поставки полон; версия зафиксирована. |
| OQ-001 | Валидная строка из примера input.csv. | PASS или допустимый WARNING согласно правилам. |
| OQ-002 | Удалить обязательную колонку из CSV. | Ошибка схемы или FAIL с указанием отсутствующей колонки. |
| OQ-003 | Внести нечисловое значение в числовое поле. | Ошибка преобразования типа с указанием строки/поля. |
| OQ-004 | Значение критического параметра вывести за предел. | FAIL и critical finding. |
| OQ-005 | Проверить структуру output.json. | Все обязательные секции присутствуют, JSON валиден. |
| OQ-006 | Проверить трассируемость серии/образца. | Идентификаторы входа и результатов совпадают. |
| PQ-001 | Проверить 3–5 реальных партий/образцов пользователя. | Результат подтверждён QC/QA review. |
| PQ-002 | Проверить workflow отклонения и ручного QA-решения. | Утилита поддерживает review, но не заменяет утверждённое решение. |
QA/QC и change control
- Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
- Хранить
input.csv,output.json, версию исполняемого файла и контрольную сумму. - Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
- Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
- Утилита предоставляет формализованный QC decision support, но окончательное решение выпуска остаётся за QA/QP и утверждёнными процедурами.
Входит в пакеты
Инфекционистика
Пакет QC-утилит для инфекционистики: антибактериальные, противовирусные, противогрибковые и противопаразитарные продукты, микробиология, стерильность, эндотоксины, вирусная безопасность, вакцинные release-checks.
ОткрытьVet — ветеринарные QC утилиты
Пакет Vet предназначен для ветеринарной фармацевтики и вакцин: адъюванты, антигены, аутогенные вакцины, аквакультура, корма/премиксы, антибактериальные и паразитарные препараты, стерильность и выпуск серии.
Открыть