HemagglutinationTiterChecker

Hemagglutination Titer

Vet veterinary veterinary vaccines animal health adjuvants aquaculture batch release CSV→JSON
Открыть подборку

Описание утилиты: Hemagglutination Titer

Hemagglutination Titer Checker — Контроль титра гемагглютинации (HA)

ℹ️  Утилита оценивает активность гемагглютинина в вирусных вакцинах (преимущественно гриппозных) согласно требованиям Ph. Eur. и WHO:
     • Титр гемагглютинации (HA Titer): Количественная мера способности вируса агглютинировать эритроциты.
     • Валидность контроля: Титр контрольной сыворотки должен соответствовать ожидаемому значению (в пределах одной ступени разведения).
     • Паттерн агглютинации: Проверка на отсутствие эффекта прозоны (избыток антител/антигена) или слабой реакции.
     • Тип эритроцитов: Учет вида животных (курица, индейка, морская свинка), так как чувствительность различается.

⚠️  КРИТИЧНО: 
     • Низкий титр HA указывает на низкое содержание антигена, что снижает эффективность вакцины.
     • Эффект прозоны (Prozone) может привести к ложноотрицательному результату или занижению титра.
     • Невалидный контроль сыворотки аннулирует весь тест.

Использование:
  HemagglutinationTiterChecker.exe                            → демо-режим (вывод в консоль)
  HemagglutinationTiterChecker.exe input.csv output.json      → оценка ваших данных

Формат input.csv:
BatchNumber,ProductName,MeasuredHATiter,MinRequiredHATiter,RBC_Type,ControlSerumTiter,ExpectedControlTiter,AgglutinationPattern

Пример:
  HA-001,Flu H1N1,256,128,1,64,64,Normal

— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Для инактивированных гриппозных вакцин содержание гемагглютинина является ключевым показателем дозы антигена (обычно 15 мкг HA на штамм).
Тест HA используется для стандартизации антигена перед формулированием вакцины и для контроля стабильности.
Это быстрый и недорогой скрининговый метод, часто используемый в паре с SRID (Single Radial Immunodiffusion).

⚠️  КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• Чувствительность эритроцитов: Разные штаммы вируса лучше агглютинируют эритроциты разных видов птиц. Выбор правильного типа RBC критичен.
• Температура: Тест обычно проводится при 4°C или комнатной температуре в зависимости от протокола.
• Время инкубации: Чтение результатов должно проводиться в строго определенное время до оседания эритроцитов.
• Специфичность: HA не является специфичным только для инфекционного вируса; он измеряет все частицы с гемагглютинином (включая дефектные).

Ключевые особенности утилиты:
• Проверка соответствия титра минимальным требованиям
• Валидация теста через контрольную сыворотку
• Детекция аномалий агглютинации (прозона)
• Генерация отчетов для отделов биоконтроля и LIMS LabWare
• Соответствие требованиям Ph. Eur. и WHO для гриппозных вакцин

Критические параметры:
• Титр HA: ≥ Заявленного значения (например, 128 HAU)
• Отклонение контроля: ≤ 25%
• Паттерн: Normal (без прозоны)

💡 Советы по использованию:
1. Приготовление суспензии RBC: Концентрация эритроцитов должна быть стандартной (обычно 0.5-1.0%).
2. Встряхивание: Аккуратное встряхивание планшета перед чтением необходимо для различения истинной агглютинации и осадка.
3. Интерпретация прозоны: Если наблюдается прозона, пробу следует дополнительно развести и повторить тест.
4. Корреляция с SRID: HA титр коррелирует с содержанием белка, но SRID является более специфичным методом для количественного определения иммуногенного HA.
5. Хранение RBC: Эритроциты должны быть свежими или правильно стабилизированными (Alsever's solution).

⚠️ Особенность: Хотя HA является стандартным тестом, для современных адъювантных или рекомбинантных вакцин могут требоваться дополнительные методы подтверждения активности (например, нейраминидазная активность или ELISA).

input.csv

BatchNumber,ProductName,MeasuredHATiter,MinRequiredHATiter,RBC_Type,ControlSerumTiter,ExpectedControlTiter,AgglutinationPattern
HA-FLU-2026-001,Influenza A/H1N1 Antigen,256,128,1,64,64,Normal
HA-FLU-2026-002,Influenza B/Yamagata,128,128,2,32,32,Normal
HA-FAIL-2026-003,Influenza A/H3N2,64,128,1,60,64,Prozone

URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация

Документ описывает контролируемый интерфейс и поведение утилиты HemagglutinationTiterChecker для сценария Hemagglutination Titer Checker.

Предметные ограничения и критические параметры

Ниже приведены ключевые фрагменты исходного описания. Перед продуктивным применением пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
  • ℹ️ Утилита оценивает активность гемагглютинина в вирусных вакцинах (преимущественно гриппозных) согласно требованиям Ph. Eur. и WHO:
  • • Валидность контроля: Титр контрольной сыворотки должен соответствовать ожидаемому значению (в пределах одной ступени разведения).
  • ⚠️ КРИТИЧНО:
  • ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
  • • Чувствительность эритроцитов: Разные штаммы вируса лучше агглютинируют эритроциты разных видов птиц. Выбор правильного типа RBC критичен.
  • • Время инкубации: Чтение результатов должно проводиться в строго определенное время до оседания эритроцитов.
  • • Соответствие требованиям Ph. Eur. и WHO для гриппозных вакцин
  • Критические параметры:
  • • Титр HA: ≥ Заявленного значения (например, 128 HAU)
  • • Отклонение контроля: ≤ 25%
  • 4. Корреляция с SRID: HA титр коррелирует с содержанием белка, но SRID является более специфичным методом для количественного определения иммуногенного HA.

URS — пользовательские требования

IDТребованиеКритичностьКритерий приемки
URS-001Утилита должна принимать файл input.csv для Hemagglutination Titer Checker с заголовками, определёнными в контракте данных.HighФайл обрабатывается без ручного изменения заголовков.
URS-002Утилита должна выполнять детерминированную оценку QC/ОКК без машинного обучения и без вероятностного принятия решения о соответствии.HighПри одинаковых входных данных, версии правил и конфигурации результат полностью воспроизводим.
URS-003Утилита должна валидировать обязательные поля, типы данных, диапазоны, единицы измерения и предметную правдоподобность значений.HighОшибки схемы, преобразования и диапазона явно отражаются в результате.
URS-004Утилита должна применять предметные пределы и правила из описания, утверждённой спецификации, регистрационного досье и локальных SOP.HighКаждая проверка имеет результат PASS/WARNING/FAIL и понятное сообщение.
URS-005Утилита должна формировать output.json с машинно-читаемыми результатами, исходными значениями, предупреждениями, отказами и критическими находками.HighJSON пригоден для LIMS/ELN/MES-интеграции и QA/QC review.
URS-006Утилита должна сохранять трассируемость между серией/образцом, входным файлом, применёнными правилами и итоговым статусом.HighВыход содержит идентификаторы, список параметров и audit metadata.
URS-007Документация должна поддерживать подготовку IQ/OQ/PQ, CSV/CSA и обсуждение с инспекторами или внутренним QA.MediumURS, FS, контракт input/output и тестовые сценарии поставляются вместе с утилитой.
URS-008Утилита должна использоваться как decision-support инструмент QC, а не как замена утверждённым спецификациям и выпускному решению Qualified Person/QA.MediumВ документации указан контроль change control и необходимость сверки пределов.

Контракт input.csv

#ПолеТипПримерНазначение
1BatchNumberstring / controlled vocabularyHA-FLU-2026-001Идентификатор серии/партии для трассируемости.
2ProductNamestring / controlled vocabularyInfluenza A/H1N1 AntigenНаименование продукта или проверяемой лекарственной формы.
3MeasuredHATiterdecimal256Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил.
4MinRequiredHATiterdecimal128Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил.
5RBC_Typestring / controlled vocabulary1Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил.
6ControlSerumTiterstring / controlled vocabulary64Контрольная точка/контрольный образец для валидности серии анализа.
7ExpectedControlTiterdecimal64Контрольная точка/контрольный образец для валидности серии анализа.
8AgglutinationPatternstring / controlled vocabularyNormalКонтролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил.
BatchNumber,ProductName,MeasuredHATiter,MinRequiredHATiter,RBC_Type,ControlSerumTiter,ExpectedControlTiter,AgglutinationPattern
HA-FLU-2026-001,Influenza A/H1N1 Antigen,256,128,1,64,64,Normal
HA-FLU-2026-002,Influenza B/Yamagata,128,128,2,32,32,Normal
HA-FAIL-2026-003,Influenza A/H3N2,64,128,1,60,64,Prozone

Правила валидации входных данных

IDПолеПравилоКритичность
VR-001BatchNumberПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.High
VR-002ProductNameПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.High
VR-003MeasuredHATiterПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.High
VR-004MinRequiredHATiterПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-005RBC_TypeПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-006ControlSerumTiterПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-007ExpectedControlTiterПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-008AgglutinationPatternПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium

FS — функциональная спецификация

IDФункцияРеализация
FS-001CLI executionПоддержать режимы запуска: demo mode без аргументов и production mode input.csv output.json.
FS-002CSV importПрочитать input.csv в UTF-8/CSV-совместимом формате, проверить наличие заголовка и ожидаемых колонок.
FS-003Schema validationПроверить обязательные поля, количество колонок, неизвестные ключевые поля и пустые обязательные значения.
FS-004Type conversionПреобразовать числовые, флаговые и текстовые значения; некорректный формат фиксировать как ошибку строки.
FS-005Domain rule engineПрименить правила для Hemagglutination Titer Checker, включая критические пределы из описания и утверждённой спецификации.
FS-006Status aggregationСформировать итоговый статус: FAIL при критическом отказе, WARNING при некритическом отклонении, PASS при соответствии.
FS-007JSON exportЗаписать output.json с детализацией проверок, исходными значениями, предупреждениями, отказами и critical findings.
FS-008Audit supportСохранять структуру результата пригодной для review, расследования отклонений и воспроизведения расчёта.
FS-009Integration contractПоддержать сценарий LIMS/ELN/MES → input.csv → utility → output.json → portal/admin review.
FS-010Error handlingВозвращать явные сообщения для отсутствующего файла, пустого CSV, неверной схемы, ошибки записи output.json и некорректного формата.

Пример output.json

{
  "utilityId": "hemagglutinationtiterchecker",
  "utilityFolder": "HemagglutinationTiterChecker",
  "package": "Vet",
  "overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
  "sourceFile": "input.csv",
  "processedAtUtc": "2026-06-10T00:00:00Z",
  "checks": [
    {
      "parameter": "BatchNumber",
      "value": "HA-FLU-2026-001",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-001"
    },
    {
      "parameter": "ProductName",
      "value": "Influenza A/H1N1 Antigen",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-002"
    },
    {
      "parameter": "MeasuredHATiter",
      "value": "256",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-003"
    },
    {
      "parameter": "MinRequiredHATiter",
      "value": "128",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-004"
    },
    {
      "parameter": "RBC_Type",
      "value": "1",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-005"
    },
    {
      "parameter": "ControlSerumTiter",
      "value": "64",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-006"
    },
    {
      "parameter": "ExpectedControlTiter",
      "value": "64",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-007"
    },
    {
      "parameter": "AgglutinationPattern",
      "value": "Normal",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-008"
    }
  ],
  "criticalFindings": [],
  "warnings": [],
  "audit": {
    "inputHash": "sha256:<calculated at runtime>",
    "rulesVersion": "<utility executable version>",
    "documentation": "HemagglutinationTiterChecker.documentation.html"
  }
}

Матрица трассируемости

URSFSТестПодтверждение
URS-001FS-001, FS-002OQ-001Проверить запуск и импорт валидного input.csv.
URS-002FS-005, FS-006OQ-004Повторить один и тот же набор данных и сравнить output.json.
URS-003FS-003, FS-004, FS-010OQ-002, OQ-003Проверить отсутствующие колонки и неверные типы.
URS-004FS-005, FS-006OQ-004, PQ-001Проверить критические отклонения по реальным/граничным данным.
URS-005FS-007, FS-009OQ-005Проверить JSON schema и пригодность для downstream-систем.
URS-006FS-008OQ-006Проверить наличие идентификаторов и audit metadata.
URS-007FS-008, FS-010IQ-001, OQ-007Проверить комплектность документации и control evidence.
URS-008FS-005, FS-008PQ-002Проверить review workflow и запрет автоматической замены QA-решения.

IQ/OQ/PQ тестовые сценарии

IDСценарийОжидаемый результат
IQ-001Проверить наличие executable, input.csv, документации и контрольной суммы.Комплект поставки полон; версия зафиксирована.
OQ-001Валидная строка из примера input.csv.PASS или допустимый WARNING согласно правилам.
OQ-002Удалить обязательную колонку из CSV.Ошибка схемы или FAIL с указанием отсутствующей колонки.
OQ-003Внести нечисловое значение в числовое поле.Ошибка преобразования типа с указанием строки/поля.
OQ-004Значение критического параметра вывести за предел.FAIL и critical finding.
OQ-005Проверить структуру output.json.Все обязательные секции присутствуют, JSON валиден.
OQ-006Проверить трассируемость серии/образца.Идентификаторы входа и результатов совпадают.
PQ-001Проверить 3–5 реальных партий/образцов пользователя.Результат подтверждён QC/QA review.
PQ-002Проверить workflow отклонения и ручного QA-решения.Утилита поддерживает review, но не заменяет утверждённое решение.

QA/QC и change control

  • Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
  • Хранить input.csv, output.json, версию исполняемого файла и контрольную сумму.
  • Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
  • Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
  • Утилита предоставляет формализованный QC decision support, но окончательное решение выпуска остаётся за QA/QP и утверждёнными процедурами.

Входит в пакеты

Инфекционистика

Пакет QC-утилит для инфекционистики: антибактериальные, противовирусные, противогрибковые и противопаразитарные продукты, микробиология, стерильность, эндотоксины, вирусная безопасность, вакцинные release-checks.

Открыть

Vet — ветеринарные QC утилиты

Пакет Vet предназначен для ветеринарной фармацевтики и вакцин: адъюванты, антигены, аутогенные вакцины, аквакультура, корма/премиксы, антибактериальные и паразитарные препараты, стерильность и выпуск серии.

Открыть