URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация
Документ описывает контролируемый интерфейс и поведение утилиты FMDVaccinePotencyAssayReviewer для сценария FMD Vaccine Potency Assay Reviewer.
Предметные ограничения и критические параметры
Ниже приведены ключевые фрагменты исходного описания. Перед продуктивным применением пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
- FMD Vaccine Potency Assay Reviewer — Ревью теста на потенцию вакцины против ящура
- ℹ️ Утилита выполняет автоматическую проверку критериев приемлемости для тестов на потенцию вакцин против ящура (FMD) согласно Ph. Eur. 2.7.16 и стандартам WOAH:
- • Расчет потенции: Определение дозы PD50 (доза, защищающая 50% животных) и сравнение с минимальным требованием (обычно ≥ 3.0 PD50).
- ⚠️ ВАЖНО:
- FMDVaccinePotencyAssayReviewer.exe → демо-режим (вывод в консоль)
- FMDVaccinePotencyAssayReviewer.exe input.csv output.json → оценка ваших данных
- BatchNumber,Serotype,StdCurve_Slope,StdCurve_R2,ControlSerum_Titer_Log10,MinControlTiter_Limit,Vaccine_PD50_Dose,MinPD50_Requirement
- Эффективность вакцины против ящура критически важна для предотвращения эпидемий.
- ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
- • R² Стандартной кривой: Должен быть ≥ 0.90 для обеспечения точности интерполяции.
- • PD50 Limit: Для КРС минимум обычно 3.0 PD50, для свиней требования могут отличаться.
- • Сравнение полученной потенции с нормативными требованиями
- Критические параметры:
- • Std Curve R²: ≥ 0.90
- • Control Serum Titer: В установленных пределах
- • Vaccine PD50: ≥ 3.0 (или по спецификации)
URS — пользовательские требования
| ID | Требование | Критичность | Критерий приемки |
|---|
| URS-001 | Утилита должна принимать файл input.csv для FMD Vaccine Potency Assay Reviewer с заголовками, определёнными в контракте данных. | High | Файл обрабатывается без ручного изменения заголовков. |
| URS-002 | Утилита должна выполнять детерминированную оценку QC/ОКК без машинного обучения и без вероятностного принятия решения о соответствии. | High | При одинаковых входных данных, версии правил и конфигурации результат полностью воспроизводим. |
| URS-003 | Утилита должна валидировать обязательные поля, типы данных, диапазоны, единицы измерения и предметную правдоподобность значений. | High | Ошибки схемы, преобразования и диапазона явно отражаются в результате. |
| URS-004 | Утилита должна применять предметные пределы и правила из описания, утверждённой спецификации, регистрационного досье и локальных SOP. | High | Каждая проверка имеет результат PASS/WARNING/FAIL и понятное сообщение. |
| URS-005 | Утилита должна формировать output.json с машинно-читаемыми результатами, исходными значениями, предупреждениями, отказами и критическими находками. | High | JSON пригоден для LIMS/ELN/MES-интеграции и QA/QC review. |
| URS-006 | Утилита должна сохранять трассируемость между серией/образцом, входным файлом, применёнными правилами и итоговым статусом. | High | Выход содержит идентификаторы, список параметров и audit metadata. |
| URS-007 | Документация должна поддерживать подготовку IQ/OQ/PQ, CSV/CSA и обсуждение с инспекторами или внутренним QA. | Medium | URS, FS, контракт input/output и тестовые сценарии поставляются вместе с утилитой. |
| URS-008 | Утилита должна использоваться как decision-support инструмент QC, а не как замена утверждённым спецификациям и выпускному решению Qualified Person/QA. | Medium | В документации указан контроль change control и необходимость сверки пределов. |
Контракт input.csv
| # | Поле | Тип | Пример | Назначение |
|---|
| 1 | BatchNumber | string / controlled vocabulary | FMD-2026-O-001 | Идентификатор серии/партии для трассируемости. |
| 2 | Serotype | string / controlled vocabulary | O | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
| 3 | StdCurve_Slope | decimal | -1.1 | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
| 4 | StdCurve_R2 | decimal | 0.98 | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
| 5 | ControlSerum_Titer_Log10 | string / controlled vocabulary | 2.1 | Контрольная точка/контрольный образец для валидности серии анализа. |
| 6 | MinControlTiter_Limit | decimal | 1.7 | Контрольная точка/контрольный образец для валидности серии анализа. |
| 7 | Vaccine_PD50_Dose | decimal | 4.5 | Доза/дозировочная единица; параметр выпуска и безопасности. |
| 8 | MinPD50_Requirement | decimal | 3.0 | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
BatchNumber,Serotype,StdCurve_Slope,StdCurve_R2,ControlSerum_Titer_Log10,MinControlTiter_Limit,Vaccine_PD50_Dose,MinPD50_Requirement
FMD-2026-O-001,O,-1.1,0.98,2.1,1.7,4.5,3.0
FMD-2026-A-002,A,-0.9,0.85,1.9,1.7,2.8,3.0
FMD-2026-Asia1-003,Asia1,-1.05,0.95,2.3,1.7,5.1,3.0
Правила валидации входных данных
| ID | Поле | Правило | Критичность |
|---|
| VR-001 | BatchNumber | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | High |
| VR-002 | Serotype | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | High |
| VR-003 | StdCurve_Slope | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | High |
| VR-004 | StdCurve_R2 | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-005 | ControlSerum_Titer_Log10 | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-006 | MinControlTiter_Limit | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-007 | Vaccine_PD50_Dose | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-008 | MinPD50_Requirement | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
FS — функциональная спецификация
| ID | Функция | Реализация |
|---|
| FS-001 | CLI execution | Поддержать режимы запуска: demo mode без аргументов и production mode input.csv output.json. |
| FS-002 | CSV import | Прочитать input.csv в UTF-8/CSV-совместимом формате, проверить наличие заголовка и ожидаемых колонок. |
| FS-003 | Schema validation | Проверить обязательные поля, количество колонок, неизвестные ключевые поля и пустые обязательные значения. |
| FS-004 | Type conversion | Преобразовать числовые, флаговые и текстовые значения; некорректный формат фиксировать как ошибку строки. |
| FS-005 | Domain rule engine | Применить правила для FMD Vaccine Potency Assay Reviewer, включая критические пределы из описания и утверждённой спецификации. |
| FS-006 | Status aggregation | Сформировать итоговый статус: FAIL при критическом отказе, WARNING при некритическом отклонении, PASS при соответствии. |
| FS-007 | JSON export | Записать output.json с детализацией проверок, исходными значениями, предупреждениями, отказами и critical findings. |
| FS-008 | Audit support | Сохранять структуру результата пригодной для review, расследования отклонений и воспроизведения расчёта. |
| FS-009 | Integration contract | Поддержать сценарий LIMS/ELN/MES → input.csv → utility → output.json → portal/admin review. |
| FS-010 | Error handling | Возвращать явные сообщения для отсутствующего файла, пустого CSV, неверной схемы, ошибки записи output.json и некорректного формата. |
Пример output.json
{
"utilityId": "fmdvaccinepotencyassayreviewer",
"utilityFolder": "FMDVaccinePotencyAssayReviewer",
"package": "Vet",
"overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
"sourceFile": "input.csv",
"processedAtUtc": "2026-06-10T00:00:00Z",
"checks": [
{
"parameter": "BatchNumber",
"value": "FMD-2026-O-001",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-001"
},
{
"parameter": "Serotype",
"value": "O",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-002"
},
{
"parameter": "StdCurve_Slope",
"value": "-1.1",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-003"
},
{
"parameter": "StdCurve_R2",
"value": "0.98",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-004"
},
{
"parameter": "ControlSerum_Titer_Log10",
"value": "2.1",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-005"
},
{
"parameter": "MinControlTiter_Limit",
"value": "1.7",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-006"
},
{
"parameter": "Vaccine_PD50_Dose",
"value": "4.5",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-007"
},
{
"parameter": "MinPD50_Requirement",
"value": "3.0",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-008"
}
],
"criticalFindings": [],
"warnings": [],
"audit": {
"inputHash": "sha256:<calculated at runtime>",
"rulesVersion": "<utility executable version>",
"documentation": "FMDVaccinePotencyAssayReviewer.documentation.html"
}
}
Матрица трассируемости
| URS | FS | Тест | Подтверждение |
|---|
| URS-001 | FS-001, FS-002 | OQ-001 | Проверить запуск и импорт валидного input.csv. |
| URS-002 | FS-005, FS-006 | OQ-004 | Повторить один и тот же набор данных и сравнить output.json. |
| URS-003 | FS-003, FS-004, FS-010 | OQ-002, OQ-003 | Проверить отсутствующие колонки и неверные типы. |
| URS-004 | FS-005, FS-006 | OQ-004, PQ-001 | Проверить критические отклонения по реальным/граничным данным. |
| URS-005 | FS-007, FS-009 | OQ-005 | Проверить JSON schema и пригодность для downstream-систем. |
| URS-006 | FS-008 | OQ-006 | Проверить наличие идентификаторов и audit metadata. |
| URS-007 | FS-008, FS-010 | IQ-001, OQ-007 | Проверить комплектность документации и control evidence. |
| URS-008 | FS-005, FS-008 | PQ-002 | Проверить review workflow и запрет автоматической замены QA-решения. |
IQ/OQ/PQ тестовые сценарии
| ID | Сценарий | Ожидаемый результат |
|---|
| IQ-001 | Проверить наличие executable, input.csv, документации и контрольной суммы. | Комплект поставки полон; версия зафиксирована. |
| OQ-001 | Валидная строка из примера input.csv. | PASS или допустимый WARNING согласно правилам. |
| OQ-002 | Удалить обязательную колонку из CSV. | Ошибка схемы или FAIL с указанием отсутствующей колонки. |
| OQ-003 | Внести нечисловое значение в числовое поле. | Ошибка преобразования типа с указанием строки/поля. |
| OQ-004 | Значение критического параметра вывести за предел. | FAIL и critical finding. |
| OQ-005 | Проверить структуру output.json. | Все обязательные секции присутствуют, JSON валиден. |
| OQ-006 | Проверить трассируемость серии/образца. | Идентификаторы входа и результатов совпадают. |
| PQ-001 | Проверить 3–5 реальных партий/образцов пользователя. | Результат подтверждён QC/QA review. |
| PQ-002 | Проверить workflow отклонения и ручного QA-решения. | Утилита поддерживает review, но не заменяет утверждённое решение. |
QA/QC и change control
- Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
- Хранить
input.csv, output.json, версию исполняемого файла и контрольную сумму. - Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
- Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
- Утилита предоставляет формализованный QC decision support, но окончательное решение выпуска остаётся за QA/QP и утверждёнными процедурами.