EndotoxinAndSterilityChecker
Endotoxin And Sterility
Endotoxin & Sterility Checker — Микробиологическая безопасность (Ph. Eur. 2.6.1, 2.6.14 / USP <71>, <85>) ℹ️ Утилита проверяет валидность тестов (контроли), результат стерильности (рост/нет роста) и уровень эндотоксинов (LAL). ℹ️ Не использует машинное обучение — только правила фармакопеи. ⚠️ КРИТИЧНО! Положительный контроль должен быть 50-200%. Стерильность должна быть абсолютной. Эндотоксины ниже предела! Использование: EndotoxinAndSterilityChecker.exe → демо-режим EndotoxinAndSterilityChecker.exe input.csv output.json → оценка данных Формат input.csv: BatchNumber,Sterility_Test_Result,Endotoxin_EU_ml,Endotoxin_Limit_EU_ml,Dilution_Factor,Positive_Control_Recovery_Percent,Negative_Control_OD,Sample_pH,Sample_Temperature_C,Validity_Check,Method_Type Пример (Sterility: 0=Pass, 1=Fail; Validity: 1=Valid, 0=Invalid): STER-ENDO-2026-001,0,0.15,0.5,1.0,85.0,0.02,7.2,37.1,1,Chromogenic — ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО? Контроль стерильности и эндотоксинов — обязательное требование для всех инъекционных препаратов и имплантируемых изделий: • Стерильность (Ph. Eur. 2.6.1 / USP <71>): Отсутствие жизнеспособных микроорганизмов после 14 дней инкубации • Бактериальные эндотоксины (Ph. Eur. 2.6.14 / USP <85>): Лимит пирогенов (компонентов клеточной стенки грамотрицательных бактерий), вызывающих лихорадку и шок • Метод LAL (Limulus Amebocyte Lysate): Золотой стандарт определения эндотоксинов (гель-кластер, турбидиметрический, хромогенный) ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО: • Валидность теста — ПРЕЖДЕ всего! Если положительные/отрицательные контроли не прошли, результат теста недействителен • Положительный контроль (восстановление): 50–200% — подтверждает, что реактив работает и нет ингибиторов в образце • Отрицательный контроль: Должен быть чистым (низкий OD/отсутствие геля) — подтверждает отсутствие загрязнения реактивов • Стерильность: Любой рост (даже в одной пробирке) = FAIL. Требуется расследование • Эндотоксины: Должны быть СТРОГО ниже установленного предела (например, 0.5 EU/mL для инъекций, 0.2 EU/mL для интратекальных) • Условия проведения: pH 6.0–8.0, температура 37±1°C — критичны для активности фермента LAL ⚠️ Особенность: Утилита сначала проверяет валидность (Validity Check). Если тест невалиден (контроли не прошли), выносится вердикт "INVALID", независимо от результата образца. Это предотвращает ложный выпуск или ложную браковку. Для эндотоксинов рассчитывается запас безопасности (Safety Margin). Стерильность оценивается бинарно (0/1), так как это качественный тест.
input.csv
BatchNumber,Sterility_Test_Result,Endotoxin_EU_ml,Endotoxin_Limit_EU_ml,Dilution_Factor,Positive_Control_Recovery_Percent,Negative_Control_OD,Sample_pH,Sample_Temperature_C,Validity_Check,Method_Type STER-ENDO-2026-001,0,0.15,0.5,1.0,85.0,0.02,7.2,37.1,1,Chromogenic
URS & FS — пользовательские требования и функциональная спецификация
Этот документ описывает требования пользователя и функциональную спецификацию для утилиты контроля качества. Он предназначен для обсуждения внедрения, подготовки IQ/OQ и интеграции в контур ОКК/QC.
1. Область применения
Утилита Endotoxin And Sterility Checker применяется для объекта Endotoxin And Sterility. Источником истины для структуры входных данных является фактический input.csv; критерии контроля задаются исполняемым модулем и предметным описанием.
Утилита не использует машинное обучение; решение формируется детерминированными правилами.
Категории: Dermal fillers
Теги: biologics, dermal fillers, endotoxins, hyaluronic acid, injectables, microbiology, particles, rheology, sterility
2. Режимы запуска
EndotoxinAndSterilityChecker.exe → демо-режим EndotoxinAndSterilityChecker.exe input.csv output.json → оценка данных
3. Ключевые контролируемые области
- микробиология и патогены
- pH и физико-химические параметры
4. Предметные ограничения и критические параметры
- ⚠️ КРИТИЧНО! Положительный контроль должен быть 50-200%. Стерильность должна быть абсолютной. Эндотоксины ниже предела!
- Стерильность (Ph. Eur. 2.6.1 / USP <71>): Отсутствие жизнеспособных микроорганизмов после 14 дней инкубации
- Бактериальные эндотоксины (Ph. Eur. 2.6.14 / USP <85>): Лимит пирогенов (компонентов клеточной стенки грамотрицательных бактерий), вызывающих лихорадку и шок
- ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
- Валидность теста — ПРЕЖДЕ всего! Если положительные/отрицательные контроли не прошли, результат теста недействителен
- Положительный контроль (восстановление): 50–200% — подтверждает, что реактив работает и нет ингибиторов в образце
- Отрицательный контроль: Должен быть чистым (низкий OD/отсутствие геля) — подтверждает отсутствие загрязнения реактивов
- Стерильность: Любой рост (даже в одной пробирке) = FAIL. Требуется расследование
- Эндотоксины: Должны быть СТРОГО ниже установленного предела (например, 0.5 EU/mL для инъекций, 0.2 EU/mL для интратекальных)
- Условия проведения: pH 6.0–8.0, температура 37±1°C — критичны для активности фермента LAL
- ⚠️ Особенность: Утилита сначала проверяет валидность (Validity Check). Если тест невалиден (контроли не прошли), выносится вердикт "INVALID", независимо от результата образца. Это предотвращает ложный выпуск или ложную браковку. Для эндотоксинов рассчитывается запас безопасности (Safety Margin). Стерильность оценивается бинарно (0/1), так как это качественный тест.
5. URS — пользовательские требования
| ID | Требование | Критичность | Критерий приемки |
|---|---|---|---|
| URS-001 | Система должна принимать файл input.csv для Endotoxin And Sterility с точным набором колонок, перечисленным в разделе «Контракт входных данных». | High | Файл с корректным заголовком читается без ручного редактирования; отсутствие обязательной колонки приводит к FAIL/ошибке импорта. |
| URS-002 | Система должна обрабатывать запуск без аргументов в демонстрационном режиме и запуск с аргументами input.csv output.json для пользовательских данных. | Medium | Оба сценария запуска дают предсказуемый результат или понятное сообщение об ошибке. |
| URS-003 | Система должна выполнять rule-based контроль по областям: микробиология и патогены, pH и физико-химические параметры. | High | Каждый контролируемый параметр получает статус и сообщение; результат не зависит от скрытых Excel-формул или ML. |
| URS-004 | Система должна сохранять трассируемость между серией/партией, исходными значениями, применёнными правилами и итоговым вердиктом. | High | В выходе присутствуют идентификатор серии, исходные значения, статусы параметров и критические находки. |
| URS-005 | Система должна формировать машинно-читаемый output.json для LIMS/ELN/MES, batch record и QA/QC review. | High | JSON содержит общий статус, массив проверок, предупреждения, отказы и ссылку на исходный файл. |
| URS-006 | Система должна поддерживать применение в валидационном пакете клиента: URS/FS, IQ/OQ-подготовка, проверка установки и операционных сценариев. | High | Документ, тестовые сценарии и воспроизводимый CSV/JSON-поток пригодны для аудита и внутреннего согласования. |
| URS-007 | Система должна явно отделять технические ошибки данных от предметных несоответствий спецификации. | Medium | Ошибки схемы/типов не смешиваются с фармакопейными отклонениями и отображаются отдельно. |
6. Контракт входных данных input.csv
Источник истины для схемы входа — фактический заголовок input.csv. Имена колонок технические и не переводятся.
| # | Колонка | Тип | Ед. | Описание | Пример | Правило контроля |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | BatchNumber | идентификатор | as specified | Batch Number | STER-ENDO-2026-001 | обязательное поле; используется для трассируемости серии/партии |
| 2 | Sterility_Test_Result | логический флаг | 0/1 | Sterility Test Result | 0 | значение должно быть допустимым флагом; для запрещённых микроорганизмов и роста обычно ожидается 0 / отсутствие |
| 3 | Endotoxin_EU_ml | десятичное число | as specified | Endotoxin EU ml | 0.15 | число; критический показатель безопасности, сравнивается с лимитом эндотоксинов |
| 4 | Endotoxin_Limit_EU_ml | десятичное число | as specified | Endotoxin Limit EU ml | 0.5 | число; критический показатель безопасности, сравнивается с лимитом эндотоксинов |
| 5 | Dilution_Factor | десятичное число | as specified | Dilution Factor | 1.0 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 6 | Positive_Control_Recovery_Percent | логический флаг | % | Positive Control Recovery % | 85.0 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 7 | Negative_Control_OD | логический флаг | as specified | Negative Control OD | 0.02 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 8 | Sample_pH | десятичное число | pH | Sample p H | 7.2 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 9 | Sample_Temperature_C | десятичное число | °C | Sample Temperature C | 37.1 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 10 | Validity_Check | десятичное число | as specified | Validity Check | 1 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 11 | Method_Type | текст | as specified | Method Type | Chromogenic | обязательное значение; формат и допустимость проверяются утилитой |
Пример CSV
BatchNumber,Sterility_Test_Result,Endotoxin_EU_ml,Endotoxin_Limit_EU_ml,Dilution_Factor,Positive_Control_Recovery_Percent,Negative_Control_OD,Sample_pH,Sample_Temperature_C,Validity_Check,Method_Type STER-ENDO-2026-001,0,0.15,0.5,1.0,85.0,0.02,7.2,37.1,1,Chromogenic
7. FS — функциональная спецификация
| ID | Функция | Описание реализации |
|---|---|---|
| FS-001 | CLI entry point | Исполняемый файл EndotoxinAndSterilityChecker.exe принимает режим демонстрации и режим обработки input.csv output.json. |
| FS-002 | CSV parser | Модуль импорта читает CSV, проверяет заголовок, порядок/наличие колонок, количество значений и кодировку. Для десятичных значений ожидается точка. |
| FS-003 | Field conversion | Для каждой колонки выполняется преобразование к ожидаемому типу: идентификатор, текст, десятичное число, дата/время или логический флаг. |
| FS-004 | Domain rule engine | Для объекта Endotoxin And Sterility применяются явные правила: диапазон, минимум, максимум, отсутствие запрещённого признака, полнота данных или расчётная проверка. |
| FS-005 | Criticality handling | Критичные нарушения формируют FAIL; некритичные отклонения и неполные данные формируют WARNING; соответствие всем правилам формирует PASS. |
| FS-006 | JSON writer | output.json сохраняет общий статус, результаты по каждому параметру, исходные значения, предупреждения, отказы и диагностические сообщения. |
| FS-007 | Integration contract | Формат CSV → JSON стабилен для вызова из LIMS/ELN/MES, планировщика задач или wrapper-сервиса. |
| FS-008 | Error handling | При ошибке схемы, отсутствующем файле, нечисловом значении или невозможности записи JSON возвращается диагностируемая ошибка без тихого PASS. |
8. Выходной контракт output.json
Выходной файл должен быть пригоден для автоматической обработки, аудита и сопоставления с исходной строкой input.csv.
{
"utility": "EndotoxinAndSterilityChecker",
"api": "Endotoxin And Sterility",
"batchNumber": "STER-ENDO-2026-001",
"overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
"checkedAtUtc": "2026-05-18T00:00:00Z",
"checks": [
{
"parameter": "BatchNumber",
"value": "STER-ENDO-2026-001",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Sterility_Test_Result",
"value": "0",
"unit": "0/1",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Endotoxin_EU_ml",
"value": "0.15",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Endotoxin_Limit_EU_ml",
"value": "0.5",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Dilution_Factor",
"value": "1.0",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Positive_Control_Recovery_Percent",
"value": "85.0",
"unit": "%",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Negative_Control_OD",
"value": "0.02",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Sample_pH",
"value": "7.2",
"unit": "pH",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
}
],
"criticalFindings": [],
"sourceFile": "input.csv"
}9. Тестовые сценарии OQ/PQ
| ID | Сценарий | Ожидаемый результат |
|---|---|---|
| TC-001 | Валидный CSV с заголовком и строкой из примера | Все строки обработаны; результат содержит PASS/WARNING/FAIL и детализацию по параметрам. |
| TC-002 | Отсутствует обязательная колонка из input.csv | Импорт отклоняется или строка получает FAIL со ссылкой на схему. |
| TC-003 | Числовое поле содержит текст или пустое значение | Фиксируется ошибка преобразования типа; результат не маскируется как PASS. |
| TC-004 | Параметр выходит за предел спецификации / критического лимита | Для критического параметра формируется FAIL; для некритического — WARNING согласно правилу. |
| TC-005 | Положительный патогенный/микробиологический флаг или превышение микробиологического лимита | Формируется критический FAIL с указанием параметра. |
10. QA/QC, CSV и управление изменениями
- Перед применением на производстве клиент фиксирует версию исполняемого файла, контрольную сумму, версию спецификации/монографии, тестовый CSV, ожидаемый JSON и результаты IQ/OQ.
- Нельзя менять имена колонок без обновления валидатора и тестовых сценариев.
- Исходный CSV, output.json и версия утилиты должны храниться вместе как пакет доказательств.
- Любое изменение правил контроля должно проходить change control и повторную проверку OQ-сценариев.
Входит в пакеты
Dermal Fillers QC Suite
Пакет для контроля качества инъекционных имплантатов и дермальных филлеров: гиалуроновая кислота, CaHA, PLLA, PMMA, коллаген и смежные испытания.
Открыть