CE_Glycosylation_Profiler

URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация

Документ описывает контролируемый интерфейс, требования пользователя и функциональное поведение утилиты CE_Glycosylation_Profiler. Назначение: автоматизированная проверка лабораторных, фармакопейных, аналитических или производственных QC-параметров на основе данных input.csv с формированием структурированного результата output.json.

Предметные ограничения и критические параметры

• • Асиалированные формы (Asialo): ≤5.0%
• • Распределение изоформ (G0–G4): в соответствии со спецификацией
• • Индекс сиаловых кислот (Sialic Acid Index): ≥2.5
• • Сиаловые кислоты на концах гликановых цепей защищают белок от разрушения и удаления из кровотока.
• • Капиллярный электрофорез (КЭ) с лазерно-индуцированной флуоресценцией (LIF) позволяет разделять изоформы по заряду (количеству сиаловых кислот).
• • Профиль гликозилирования влияет на эффективность (potency), фармакокинетику и иммуногенность препарата.
• • Контроль необходим для обеспечения консистентности производственного процесса (cell culture consistency).
• • Асиалированные формы (G0) должны быть минимальны. Их накопление свидетельствует о проблемах в процессе очистки или нестабильности белка.
• • Индекс сиаловых кислот (SA Index) — интегральный показатель качества. Падение индекса ниже 2.5 критично для ЭПО.
• • Сдвиг профиля в сторону менее сиалированных форм (левый сдвиг на электрофорограмме) — признак деградации или ошибок в гликозилировании клеткой-продуцентом.
• • Метод требует высокой разрешающей способности и использования стандартов для калибровки времени миграции.
• • Расчет процентного распределения гликоформ.
• • Оценка индекса сиаловых кислот.
• • Контроль качества процесса экспрессии рекомбинантных белков.
• • Asialo Forms: ≤5.0%
• • Disialo/Tetrasialo Forms: Within Specification Range

URS — пользовательские требования

Контракт input.csv

BatchNumber,Asialo%,Mono%,Di%,Tri%,Tetra%,SA_Index
EPO-CE-2026-001,1.5,15.0,45.0,25.0,13.5,2.8
EPO-CE-2026-002,2.0,18.0,42.0,24.0,14.0,2.7
EPO-FAIL-DESIALO,8.5,25.0,40.0,15.0,11.5,2.1

FS — функциональная спецификация

Пример output.json

{
  "utilityId": "ce-glycosylation-profiler",
  "utilityName": "CE_Glycosylation_Profiler",
  "overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
  "sourceFile": "input.csv",
  "checks": [
    {
      "parameter": "BatchNumber",
      "value": "EPO-CE-2026-001",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "Asialo%",
      "value": "1.5",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "Mono%",
      "value": "15.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "Di%",
      "value": "45.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "Tri%",
      "value": "25.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "Tetra%",
      "value": "13.5",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    },
    {
      "parameter": "SA_Index",
      "value": "2.8",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result"
    }
  ],
  "criticalFindings": [],
  "warnings": [],
  "generatedFor": "QA/QC review and LIMS integration"
}

Матрица трассируемости

OQ/PQ тестовые сценарии

QA/QC и change control

• Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
• Хранить input.csv, output.json, версию исполняемого файла, документацию и checksum.
• Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
• Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, локальными SOP и регистрационным досье.