BacterialCountBioburdenChecker

Bacterial Count Bioburden

Vet veterinary veterinary vaccines animal health adjuvants aquaculture batch release CSV→JSON
Открыть подборку

Описание утилиты: Bacterial Count Bioburden

Bacterial Count Bioburden Checker — Контроль микробной обсемененности (Bioburden)

ℹ️  Утилита оценивает уровень микробной обсемененности нестерильных фармацевтических продуктов согласно Ph. Eur. 2.6.12 и USP <61>:
     • TAMC (Total Aerobic Microbial Count): Общее количество аэробных бактерий.
     • TYMC (Total Yeasts and Molds Count): Общее количество дрожжей и плесневых грибов.
     • Эффективность извлечения (Recovery Efficiency): Подтверждение того, что метод позволяет выявить микроорганизмы, присутствующие в продукте.
     • Условия инкубации: Строгий контроль времени выращивания культур.

⚠️  КРИТИЧНО: 
     • Превышение установленных лимитов (например, 100 КОЕ/г для TAMC) указывает на неудовлетворительное качество сырья или нарушение гигиены производства.
     • Эффективность извлечения ниже 50% означает, что метод не подходит для данного продукта без модификации (нейтрализации антимикробных свойств).

Использование:
  BacterialCountBioburdenChecker.exe                            → демо-режим (вывод в консоль)
  BacterialCountBioburdenChecker.exe input.csv output.json      → оценка ваших данных

Формат input.csv:
BatchNumber,ProductName,TAMC_CFU_per_unit,TYMC_CFU_per_unit,SampleWeight_g,DilutionFactor,IncubationDays_TAMC,IncubationDays_TYMC,RecoveryEfficiency_Percent

Пример:
  BB-001,Cream,50.0,10.0,1.0,10.0,3,5,85.0

— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Контроль бионагрузки необходим для обеспечения микробиологического качества нестерильных препаратов.
Высокий уровень микроорганизмов может привести к порче продукта, снижению эффективности консервантов и риску для здоровья пациента.
Результаты также используются для валидации процессов стерилизации (если продукт подвергается конечной стерилизации).

⚠️  КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• Лимиты зависят от пути введения и типа продукта (пероральный, местный, ректальный и т.д.).
• Метод мембранной фильтрации предпочтителен для продуктов с антимикробной активностью.
• Нейтрализация: Если продукт содержит консерванты, необходимо использовать нейтрализаторы в питательной среде.
• Инкубация: TAMC инкубируют при 30-35°C (3-5 дней), TYMC при 20-25°C (5-7 дней).

Ключевые особенности утилиты:
• Проверка соответствия лимитам TAMC и TYMC
• Контроль валидности метода через эффективность извлечения
• Проверка соблюдения условий инкубации
• Генерация отчетов для микробиологической лаборатории и LIMS LabWare
• Соответствие требованиям GMP и Фармакопей

Критические параметры:
• TAMC: ≤ 100 КОЕ/г (для местных препаратов)
• TYMC: ≤ 10 КОЕ/г (для местных препаратов)
• Эффективность извлечения: ≥ 50%
• Дни инкубации TAMC: 3–5
• Дни инкубации TYMC: 5–7

💡 Советы по использованию:
1. Отбор проб: Должен быть репрезентативным и проводиться асептически.
2. Гомогенизация: Тщательно гомогенизируйте образец с разбавителем для высвобождения микроорганизмов.
3. Подсчет колоний: Используйте только чашки с количеством колоний от 10 до 300 (или до 250 по USP) для точности.
4. Интерпретация: Если рост слишком обильный (TNTC), повторите тест с большим разведением.
5. Тренды: Анализируйте данные бионагрузки в динамике для раннего выявления проблем в процессе производства.

⚠️ Особенность: Бионагрузка — это показатель "чистоты" процесса до этапа стерилизации или конечного контроля. Для нестерильных продуктов это один из главных критериев выпуска.

input.csv

BatchNumber,ProductName,TAMC_CFU_per_unit,TYMC_CFU_per_unit,SampleWeight_g,DilutionFactor,IncubationDays_TAMC,IncubationDays_TYMC,RecoveryEfficiency_Percent
BB-2026-CREAM-001,Hydrocortisone Cream,50.0,10.0,1.0,10.0,3,5,85.0
BB-2026-SYRUP-002,Cough Syrup,20.0,5.0,10.0,1.0,4,6,90.0
BB-2026-FAIL-003,Herbal Powder,150.0,25.0,1.0,100.0,3,5,40.0

URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация

Документ описывает контролируемый интерфейс и поведение утилиты BacterialCountBioburdenChecker для сценария Bacterial Count Bioburden Checker.

Предметные ограничения и критические параметры

Ниже приведены ключевые фрагменты исходного описания. Перед продуктивным применением пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
  • ℹ️ Утилита оценивает уровень микробной обсемененности нестерильных фармацевтических продуктов согласно Ph. Eur. 2.6.12 и USP <61>:
  • ⚠️ КРИТИЧНО:
  • Контроль бионагрузки необходим для обеспечения микробиологического качества нестерильных препаратов.
  • Результаты также используются для валидации процессов стерилизации (если продукт подвергается конечной стерилизации).
  • ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
  • • Соответствие требованиям GMP и Фармакопей
  • Критические параметры:
  • • TAMC: ≤ 100 КОЕ/г (для местных препаратов)
  • • TYMC: ≤ 10 КОЕ/г (для местных препаратов)
  • • Эффективность извлечения: ≥ 50%
  • 3. Подсчет колоний: Используйте только чашки с количеством колоний от 10 до 300 (или до 250 по USP) для точности.
  • ⚠️ Особенность: Бионагрузка — это показатель "чистоты" процесса до этапа стерилизации или конечного контроля. Для нестерильных продуктов это один из главных критериев выпуска.

URS — пользовательские требования

IDТребованиеКритичностьКритерий приемки
URS-001Утилита должна принимать файл input.csv для Bacterial Count Bioburden Checker с заголовками, определёнными в контракте данных.HighФайл обрабатывается без ручного изменения заголовков.
URS-002Утилита должна выполнять детерминированную оценку QC/ОКК без машинного обучения и без вероятностного принятия решения о соответствии.HighПри одинаковых входных данных, версии правил и конфигурации результат полностью воспроизводим.
URS-003Утилита должна валидировать обязательные поля, типы данных, диапазоны, единицы измерения и предметную правдоподобность значений.HighОшибки схемы, преобразования и диапазона явно отражаются в результате.
URS-004Утилита должна применять предметные пределы и правила из описания, утверждённой спецификации, регистрационного досье и локальных SOP.HighКаждая проверка имеет результат PASS/WARNING/FAIL и понятное сообщение.
URS-005Утилита должна формировать output.json с машинно-читаемыми результатами, исходными значениями, предупреждениями, отказами и критическими находками.HighJSON пригоден для LIMS/ELN/MES-интеграции и QA/QC review.
URS-006Утилита должна сохранять трассируемость между серией/образцом, входным файлом, применёнными правилами и итоговым статусом.HighВыход содержит идентификаторы, список параметров и audit metadata.
URS-007Документация должна поддерживать подготовку IQ/OQ/PQ, CSV/CSA и обсуждение с инспекторами или внутренним QA.MediumURS, FS, контракт input/output и тестовые сценарии поставляются вместе с утилитой.
URS-008Утилита должна использоваться как decision-support инструмент QC, а не как замена утверждённым спецификациям и выпускному решению Qualified Person/QA.MediumВ документации указан контроль change control и необходимость сверки пределов.

Контракт input.csv

#ПолеТипПримерНазначение
1BatchNumberstring / controlled vocabularyBB-2026-CREAM-001Идентификатор серии/партии для трассируемости.
2ProductNamestring / controlled vocabularyHydrocortisone CreamНаименование продукта или проверяемой лекарственной формы.
3TAMC_CFU_per_unitstring / controlled vocabulary50.0Счётный показатель; используется для микробиологического, частичного или клеточного контроля.
4TYMC_CFU_per_unitstring / controlled vocabulary10.0Счётный показатель; используется для микробиологического, частичного или клеточного контроля.
5SampleWeight_gstring / controlled vocabulary1.0Идентификатор образца или лабораторной пробы.
6DilutionFactordecimal10.0Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил.
7IncubationDays_TAMCinteger / decimal3Временной параметр процесса, инкубации, хранения или анализа.
8IncubationDays_TYMCinteger / decimal5Временной параметр процесса, инкубации, хранения или анализа.
9RecoveryEfficiency_Percentdecimal85.0Восстановление/извлечение; показатель валидности анализа.
BatchNumber,ProductName,TAMC_CFU_per_unit,TYMC_CFU_per_unit,SampleWeight_g,DilutionFactor,IncubationDays_TAMC,IncubationDays_TYMC,RecoveryEfficiency_Percent
BB-2026-CREAM-001,Hydrocortisone Cream,50.0,10.0,1.0,10.0,3,5,85.0
BB-2026-SYRUP-002,Cough Syrup,20.0,5.0,10.0,1.0,4,6,90.0
BB-2026-FAIL-003,Herbal Powder,150.0,25.0,1.0,100.0,3,5,40.0

Правила валидации входных данных

IDПолеПравилоКритичность
VR-001BatchNumberПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.High
VR-002ProductNameПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.High
VR-003TAMC_CFU_per_unitПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.High
VR-004TYMC_CFU_per_unitПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-005SampleWeight_gПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-006DilutionFactorПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-007IncubationDays_TAMCПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-008IncubationDays_TYMCПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-009RecoveryEfficiency_PercentПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium

FS — функциональная спецификация

IDФункцияРеализация
FS-001CLI executionПоддержать режимы запуска: demo mode без аргументов и production mode input.csv output.json.
FS-002CSV importПрочитать input.csv в UTF-8/CSV-совместимом формате, проверить наличие заголовка и ожидаемых колонок.
FS-003Schema validationПроверить обязательные поля, количество колонок, неизвестные ключевые поля и пустые обязательные значения.
FS-004Type conversionПреобразовать числовые, флаговые и текстовые значения; некорректный формат фиксировать как ошибку строки.
FS-005Domain rule engineПрименить правила для Bacterial Count Bioburden Checker, включая критические пределы из описания и утверждённой спецификации.
FS-006Status aggregationСформировать итоговый статус: FAIL при критическом отказе, WARNING при некритическом отклонении, PASS при соответствии.
FS-007JSON exportЗаписать output.json с детализацией проверок, исходными значениями, предупреждениями, отказами и critical findings.
FS-008Audit supportСохранять структуру результата пригодной для review, расследования отклонений и воспроизведения расчёта.
FS-009Integration contractПоддержать сценарий LIMS/ELN/MES → input.csv → utility → output.json → portal/admin review.
FS-010Error handlingВозвращать явные сообщения для отсутствующего файла, пустого CSV, неверной схемы, ошибки записи output.json и некорректного формата.

Пример output.json

{
  "utilityId": "bacterialcountbioburdenchecker",
  "utilityFolder": "BacterialCountBioburdenChecker",
  "package": "Vet",
  "overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
  "sourceFile": "input.csv",
  "processedAtUtc": "2026-06-10T00:00:00Z",
  "checks": [
    {
      "parameter": "BatchNumber",
      "value": "BB-2026-CREAM-001",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-001"
    },
    {
      "parameter": "ProductName",
      "value": "Hydrocortisone Cream",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-002"
    },
    {
      "parameter": "TAMC_CFU_per_unit",
      "value": "50.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-003"
    },
    {
      "parameter": "TYMC_CFU_per_unit",
      "value": "10.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-004"
    },
    {
      "parameter": "SampleWeight_g",
      "value": "1.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-005"
    },
    {
      "parameter": "DilutionFactor",
      "value": "10.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-006"
    },
    {
      "parameter": "IncubationDays_TAMC",
      "value": "3",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-007"
    },
    {
      "parameter": "IncubationDays_TYMC",
      "value": "5",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-008"
    },
    {
      "parameter": "RecoveryEfficiency_Percent",
      "value": "85.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-009"
    }
  ],
  "criticalFindings": [],
  "warnings": [],
  "audit": {
    "inputHash": "sha256:<calculated at runtime>",
    "rulesVersion": "<utility executable version>",
    "documentation": "BacterialCountBioburdenChecker.documentation.html"
  }
}

Матрица трассируемости

URSFSТестПодтверждение
URS-001FS-001, FS-002OQ-001Проверить запуск и импорт валидного input.csv.
URS-002FS-005, FS-006OQ-004Повторить один и тот же набор данных и сравнить output.json.
URS-003FS-003, FS-004, FS-010OQ-002, OQ-003Проверить отсутствующие колонки и неверные типы.
URS-004FS-005, FS-006OQ-004, PQ-001Проверить критические отклонения по реальным/граничным данным.
URS-005FS-007, FS-009OQ-005Проверить JSON schema и пригодность для downstream-систем.
URS-006FS-008OQ-006Проверить наличие идентификаторов и audit metadata.
URS-007FS-008, FS-010IQ-001, OQ-007Проверить комплектность документации и control evidence.
URS-008FS-005, FS-008PQ-002Проверить review workflow и запрет автоматической замены QA-решения.

IQ/OQ/PQ тестовые сценарии

IDСценарийОжидаемый результат
IQ-001Проверить наличие executable, input.csv, документации и контрольной суммы.Комплект поставки полон; версия зафиксирована.
OQ-001Валидная строка из примера input.csv.PASS или допустимый WARNING согласно правилам.
OQ-002Удалить обязательную колонку из CSV.Ошибка схемы или FAIL с указанием отсутствующей колонки.
OQ-003Внести нечисловое значение в числовое поле.Ошибка преобразования типа с указанием строки/поля.
OQ-004Значение критического параметра вывести за предел.FAIL и critical finding.
OQ-005Проверить структуру output.json.Все обязательные секции присутствуют, JSON валиден.
OQ-006Проверить трассируемость серии/образца.Идентификаторы входа и результатов совпадают.
PQ-001Проверить 3–5 реальных партий/образцов пользователя.Результат подтверждён QC/QA review.
PQ-002Проверить workflow отклонения и ручного QA-решения.Утилита поддерживает review, но не заменяет утверждённое решение.

QA/QC и change control

  • Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
  • Хранить input.csv, output.json, версию исполняемого файла и контрольную сумму.
  • Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
  • Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
  • Утилита предоставляет формализованный QC decision support, но окончательное решение выпуска остаётся за QA/QP и утверждёнными процедурами.

Входит в пакеты

Инфекционистика

Пакет QC-утилит для инфекционистики: антибактериальные, противовирусные, противогрибковые и противопаразитарные продукты, микробиология, стерильность, эндотоксины, вирусная безопасность, вакцинные release-checks.

Открыть

Vet — ветеринарные QC утилиты

Пакет Vet предназначен для ветеринарной фармацевтики и вакцин: адъюванты, антигены, аутогенные вакцины, аквакультура, корма/премиксы, антибактериальные и паразитарные препараты, стерильность и выпуск серии.

Открыть