Aquaculture_ImmersionVaccine_Dosage_QualityChecker

Aquaculture Immersion Vaccine Dosage

Vet veterinary veterinary vaccines animal health adjuvants aquaculture batch release CSV→JSON
Открыть подборку

Описание утилиты: Aquaculture Immersion Vaccine Dosage

Aquaculture Immersion Vaccine Dosage Quality Checker — Контроль дозировки иммерсионных вакцин для аквакультуры

ℹ️  Утилита рассчитывает и валидирует параметры иммерсионной (ванночной) вакцинации рыб и других гидробионтов:
     • Расчет фактической концентрации вакцины в ванне после разведения
     • Оценка поглощенной дозы (TCID50 или EID50) на одну особь с учетом веса рыбы и скорости поглощения воды (Uptake Rate)
     • Контроль критических параметров процесса: время экспозиции, температура воды, биомасса
     • Проверка соответствия минимальной иммунизирующей дозе (Minimum Potency Dose)

⚠️  КРИТИЧНО: Недостаточная доза ведет к формированию неполного иммунитета и вспышкам заболеваний в садках!
     Избыточная концентрация может вызвать осмотический стресс у молоди или быть экономически неэффективной.
     Температура воды критически влияет на метаболизм рыбы и, следовательно, на объем поглощенной вакцины.

Использование:
  AquacultureImmersionVaccineDosageQualityChecker.exe                            → демо-режим (вывод в консоль)
  AquacultureImmersionVaccineDosageQualityChecker.exe input.csv output.json      → оценка ваших данных

Формат input.csv:
BatchNumber,ProductName,VaccineTiter_TCID50_per_ml,DilutionFactor,WaterVolume_Liters,FishBiomass_kg,ExposureTime_min,WaterTemperature_C,UptakeRate_ml_per_kg,MinRequiredDose_TCID50_per_fish,AverageFishWeight_g

Пример:
  AQUA-VAC-2026-001,Vibrio Vaccine,1.0E9,1000.0,500.0,50.0,30.0,15.0,2.5,1.0E5,10.0

— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
В аквакультуре массовая вакцинация молоди (мальков) чаще всего проводится методом погружения в раствор вакцины.
В отличие от инъекций, доза здесь не фиксирована шприцем, а зависит от поведения рыбы, температуры, солености и времени.
Точный расчет необходим для гарантии сероконверсии (выработки антител) всей популяции.

⚠️  КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• Uptake Rate (Скорость поглощения): Зависит от вида рыбы, размера жабр и активности. Обычно оценивается экспериментально (мл воды на кг биомассы за время экспозиции).
• Разведение: Ошибка в разведении концентрата вакцины в большой ванне (тысячи литров) может снизить титр ниже защитного уровня.
• Температура: При низкой температуре (<10°C) метаболизм рыб замедляется, они меньше дышат и поглощают меньше вакцины. Требуется коррекция времени или концентрации.
• Стресс: Длительная экспозиция или высокая концентрация адъювантов/консервантов в ванне могут повредить жабры.

Ключевые особенности утилиты:
• Автоматический расчет фактической дозы на особь
• Учет биомассы и среднего веса рыбы
• Проверка физиологических лимитов поглощения
• Контроль температурного режима проведения процедуры
• Генерация отчетов для технологов рыбоводных хозяйств и QA отделов производителей вакцин (Vaxxinova, HIPRA, Jinyu)

Критические параметры:
• Поглощенная доза: ≥ Минимальной требуемой дозы (указывается производителем)
• Время экспозиции: 15–60 минут (типично)
• Температура воды: Видоспецифичный диапазон (обычно 10–20°C)
• Концентрация в ванне: Достаточная для обеспечения дозы при заданном Uptake Rate

💡 Советы по использованию:
1. Аэрация: Во время вакцинации обязательно используйте аэрацию, так как высокая плотность рыбы и стресс повышают потребление кислорода.
2. Отключение подачи воды: Подачу свежей воды в ванну необходимо прекратить на время экспозиции, чтобы сохранить концентрацию вакцины.
3. Равномерность: Обеспечьте равномерное распределение вакцины в объеме ванны перед запуском рыбы.
4. Пост-вакцинационный период: После извлечения из ванны рыбу следует поместить в проточную воду для восстановления.
5. Валидация: Параметр Uptake Rate должен быть валидирован для каждого конкретного вида и размерной группы рыб в ваших условиях.

⚠️ Особенность: В отличие от человеческих или сельскохозяйственных наземных животных, где доза строго индивидуальна, в аквакультуре мы оперируем статистической вероятностью поглощения дозы каждой особью в популяции.

input.csv

BatchNumber,ProductName,VaccineTiter_TCID50_per_ml,DilutionFactor,WaterVolume_Liters,FishBiomass_kg,ExposureTime_min,WaterTemperature_C,UptakeRate_ml_per_kg,MinRequiredDose_TCID50_per_fish,AverageFishWeight_g
AQUA-VAC-2026-001,Vibrio Anguillarum Immersion Vaccine,1.0E9,1000.0,500.0,50.0,30.0,15.0,2.5,1.0E5,10.0
AQUA-VAC-2026-002,IPN Virus Vaccine for Trout,5.0E8,500.0,1000.0,100.0,45.0,12.0,3.0,5.0E4,5.0

URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация

Документ описывает контролируемый интерфейс и поведение утилиты Aquaculture_ImmersionVaccine_Dosage_QualityChecker для сценария Aquaculture Immersion Vaccine Dosage Quality Checker.

Предметные ограничения и критические параметры

Ниже приведены ключевые фрагменты исходного описания. Перед продуктивным применением пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
  • • Контроль критических параметров процесса: время экспозиции, температура воды, биомасса
  • • Проверка соответствия минимальной иммунизирующей дозе (Minimum Potency Dose)
  • ⚠️ КРИТИЧНО: Недостаточная доза ведет к формированию неполного иммунитета и вспышкам заболеваний в садках!
  • Температура воды критически влияет на метаболизм рыбы и, следовательно, на объем поглощенной вакцины.
  • ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
  • • Температура: При низкой температуре (<10°C) метаболизм рыб замедляется, они меньше дышат и поглощают меньше вакцины. Требуется коррекция времени или концентрации.
  • Критические параметры:
  • • Поглощенная доза: ≥ Минимальной требуемой дозы (указывается производителем)
  • 3. Равномерность: Обеспечьте равномерное распределение вакцины в объеме ванны перед запуском рыбы.

URS — пользовательские требования

IDТребованиеКритичностьКритерий приемки
URS-001Утилита должна принимать файл input.csv для Aquaculture Immersion Vaccine Dosage Quality Checker с заголовками, определёнными в контракте данных.HighФайл обрабатывается без ручного изменения заголовков.
URS-002Утилита должна выполнять детерминированную оценку QC/ОКК без машинного обучения и без вероятностного принятия решения о соответствии.HighПри одинаковых входных данных, версии правил и конфигурации результат полностью воспроизводим.
URS-003Утилита должна валидировать обязательные поля, типы данных, диапазоны, единицы измерения и предметную правдоподобность значений.HighОшибки схемы, преобразования и диапазона явно отражаются в результате.
URS-004Утилита должна применять предметные пределы и правила из описания, утверждённой спецификации, регистрационного досье и локальных SOP.HighКаждая проверка имеет результат PASS/WARNING/FAIL и понятное сообщение.
URS-005Утилита должна формировать output.json с машинно-читаемыми результатами, исходными значениями, предупреждениями, отказами и критическими находками.HighJSON пригоден для LIMS/ELN/MES-интеграции и QA/QC review.
URS-006Утилита должна сохранять трассируемость между серией/образцом, входным файлом, применёнными правилами и итоговым статусом.HighВыход содержит идентификаторы, список параметров и audit metadata.
URS-007Документация должна поддерживать подготовку IQ/OQ/PQ, CSV/CSA и обсуждение с инспекторами или внутренним QA.MediumURS, FS, контракт input/output и тестовые сценарии поставляются вместе с утилитой.
URS-008Утилита должна использоваться как decision-support инструмент QC, а не как замена утверждённым спецификациям и выпускному решению Qualified Person/QA.MediumВ документации указан контроль change control и необходимость сверки пределов.

Контракт input.csv

#ПолеТипПримерНазначение
1BatchNumberstring / controlled vocabularyAQUA-VAC-2026-001Идентификатор серии/партии для трассируемости.
2ProductNamestring / controlled vocabularyVibrio Anguillarum Immersion VaccineНаименование продукта или проверяемой лекарственной формы.
3VaccineTiter_TCID50_per_mldecimal1.0E9Объём/доза; используется для расчёта нагрузки, предела или выпуска.
4DilutionFactordecimal1000.0Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил.
5WaterVolume_Litersdecimal500.0Объём/доза; используется для расчёта нагрузки, предела или выпуска.
6FishBiomass_kgdecimal50.0Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил.
7ExposureTime_mininteger / decimal30.0Временной параметр процесса, инкубации, хранения или анализа.
8WaterTemperature_Cdecimal15.0Температурный профиль/MKT; параметр хранения, перевозки и стабильности.
9UptakeRate_ml_per_kgdecimal2.5Объём/доза; используется для расчёта нагрузки, предела или выпуска.
10MinRequiredDose_TCID50_per_fishdecimal1.0E5Доза/дозировочная единица; параметр выпуска и безопасности.
11AverageFishWeight_gdecimal10.0Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил.
BatchNumber,ProductName,VaccineTiter_TCID50_per_ml,DilutionFactor,WaterVolume_Liters,FishBiomass_kg,ExposureTime_min,WaterTemperature_C,UptakeRate_ml_per_kg,MinRequiredDose_TCID50_per_fish,AverageFishWeight_g
AQUA-VAC-2026-001,Vibrio Anguillarum Immersion Vaccine,1.0E9,1000.0,500.0,50.0,30.0,15.0,2.5,1.0E5,10.0
AQUA-VAC-2026-002,IPN Virus Vaccine for Trout,5.0E8,500.0,1000.0,100.0,45.0,12.0,3.0,5.0E4,5.0

Правила валидации входных данных

IDПолеПравилоКритичность
VR-001BatchNumberПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.High
VR-002ProductNameПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.High
VR-003VaccineTiter_TCID50_per_mlПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.High
VR-004DilutionFactorПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-005WaterVolume_LitersПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-006FishBiomass_kgПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-007ExposureTime_minПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-008WaterTemperature_CПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-009UptakeRate_ml_per_kgПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-010MinRequiredDose_TCID50_per_fishПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium
VR-011AverageFishWeight_gПоле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме.Medium

FS — функциональная спецификация

IDФункцияРеализация
FS-001CLI executionПоддержать режимы запуска: demo mode без аргументов и production mode input.csv output.json.
FS-002CSV importПрочитать input.csv в UTF-8/CSV-совместимом формате, проверить наличие заголовка и ожидаемых колонок.
FS-003Schema validationПроверить обязательные поля, количество колонок, неизвестные ключевые поля и пустые обязательные значения.
FS-004Type conversionПреобразовать числовые, флаговые и текстовые значения; некорректный формат фиксировать как ошибку строки.
FS-005Domain rule engineПрименить правила для Aquaculture Immersion Vaccine Dosage Quality Checker, включая критические пределы из описания и утверждённой спецификации.
FS-006Status aggregationСформировать итоговый статус: FAIL при критическом отказе, WARNING при некритическом отклонении, PASS при соответствии.
FS-007JSON exportЗаписать output.json с детализацией проверок, исходными значениями, предупреждениями, отказами и critical findings.
FS-008Audit supportСохранять структуру результата пригодной для review, расследования отклонений и воспроизведения расчёта.
FS-009Integration contractПоддержать сценарий LIMS/ELN/MES → input.csv → utility → output.json → portal/admin review.
FS-010Error handlingВозвращать явные сообщения для отсутствующего файла, пустого CSV, неверной схемы, ошибки записи output.json и некорректного формата.

Пример output.json

{
  "utilityId": "aquaculture-immersionvaccine-dosage-qualitychecker",
  "utilityFolder": "Aquaculture_ImmersionVaccine_Dosage_QualityChecker",
  "package": "Vet",
  "overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
  "sourceFile": "input.csv",
  "processedAtUtc": "2026-06-10T00:00:00Z",
  "checks": [
    {
      "parameter": "BatchNumber",
      "value": "AQUA-VAC-2026-001",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-001"
    },
    {
      "parameter": "ProductName",
      "value": "Vibrio Anguillarum Immersion Vaccine",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-002"
    },
    {
      "parameter": "VaccineTiter_TCID50_per_ml",
      "value": "1.0E9",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-003"
    },
    {
      "parameter": "DilutionFactor",
      "value": "1000.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-004"
    },
    {
      "parameter": "WaterVolume_Liters",
      "value": "500.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-005"
    },
    {
      "parameter": "FishBiomass_kg",
      "value": "50.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-006"
    },
    {
      "parameter": "ExposureTime_min",
      "value": "30.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-007"
    },
    {
      "parameter": "WaterTemperature_C",
      "value": "15.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-008"
    },
    {
      "parameter": "UptakeRate_ml_per_kg",
      "value": "2.5",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-009"
    },
    {
      "parameter": "MinRequiredDose_TCID50_per_fish",
      "value": "1.0E5",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-010"
    },
    {
      "parameter": "AverageFishWeight_g",
      "value": "10.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-011"
    }
  ],
  "criticalFindings": [],
  "warnings": [],
  "audit": {
    "inputHash": "sha256:<calculated at runtime>",
    "rulesVersion": "<utility executable version>",
    "documentation": "Aquaculture_ImmersionVaccine_Dosage_QualityChecker.documentation.html"
  }
}

Матрица трассируемости

URSFSТестПодтверждение
URS-001FS-001, FS-002OQ-001Проверить запуск и импорт валидного input.csv.
URS-002FS-005, FS-006OQ-004Повторить один и тот же набор данных и сравнить output.json.
URS-003FS-003, FS-004, FS-010OQ-002, OQ-003Проверить отсутствующие колонки и неверные типы.
URS-004FS-005, FS-006OQ-004, PQ-001Проверить критические отклонения по реальным/граничным данным.
URS-005FS-007, FS-009OQ-005Проверить JSON schema и пригодность для downstream-систем.
URS-006FS-008OQ-006Проверить наличие идентификаторов и audit metadata.
URS-007FS-008, FS-010IQ-001, OQ-007Проверить комплектность документации и control evidence.
URS-008FS-005, FS-008PQ-002Проверить review workflow и запрет автоматической замены QA-решения.

IQ/OQ/PQ тестовые сценарии

IDСценарийОжидаемый результат
IQ-001Проверить наличие executable, input.csv, документации и контрольной суммы.Комплект поставки полон; версия зафиксирована.
OQ-001Валидная строка из примера input.csv.PASS или допустимый WARNING согласно правилам.
OQ-002Удалить обязательную колонку из CSV.Ошибка схемы или FAIL с указанием отсутствующей колонки.
OQ-003Внести нечисловое значение в числовое поле.Ошибка преобразования типа с указанием строки/поля.
OQ-004Значение критического параметра вывести за предел.FAIL и critical finding.
OQ-005Проверить структуру output.json.Все обязательные секции присутствуют, JSON валиден.
OQ-006Проверить трассируемость серии/образца.Идентификаторы входа и результатов совпадают.
PQ-001Проверить 3–5 реальных партий/образцов пользователя.Результат подтверждён QC/QA review.
PQ-002Проверить workflow отклонения и ручного QA-решения.Утилита поддерживает review, но не заменяет утверждённое решение.

QA/QC и change control

  • Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
  • Хранить input.csv, output.json, версию исполняемого файла и контрольную сумму.
  • Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
  • Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
  • Утилита предоставляет формализованный QC decision support, но окончательное решение выпуска остаётся за QA/QP и утверждёнными процедурами.

Входит в пакеты

Vet — ветеринарные QC утилиты

Пакет Vet предназначен для ветеринарной фармацевтики и вакцин: адъюванты, антигены, аутогенные вакцины, аквакультура, корма/премиксы, антибактериальные и паразитарные препараты, стерильность и выпуск серии.

Открыть