Назначение

Определить пользовательские требования к автономной FUZKK-утилите, которая принимает CSV-файл лабораторных данных, выполняет проверку по зашитым в код правилам и формирует LabWare-compatible JSON.

Область применения

Утилита предназначена для предварительной QC/QA-оценки, интеграционного тестирования, LIMS/LabWare flow и подготовки evidence trail. Окончательное решение остаётся за валидированной процедурой лаборатории и ответственным персоналом.

Пользователи

QC analyst, QA reviewer, CSV/validation engineer, LIMS/LabWare integration engineer, responsible laboratory specialist.

Пользовательские требования

1. Утилита должна запускаться без параметров и выводить самоописание, пример input.csv из GetDemoData() и demo evaluation для встроенного набора данных.
2. Утилита должна запускаться с двумя параметрами: input.csv output.json.
3. Утилита не должна читать input.csv и не должна писать output.json при запуске без параметров.
4. CSV должен читаться с CultureInfo.InvariantCulture для числовых значений.
5. Результат должен формироваться в LabWare-compatible JSON с Header, Samples, Results, Status, StatusCode, ErrorMessage, Description и DescriptionEN.
6. При PASS поле ErrorMessage должно быть пустой строкой.
7. Зашитые лимиты должны следовать приоритету: Ph. Eur. → British Pharmacopoeia / UK implementation → ЕАЭС / региональные требования → EMA/ICH/EU guidance → USP fallback.
8. Если точная монография неизвестна, применяются строгие стандартные API-лимиты: Assay 98–102%, total impurities ≤1.0%, individual impurity ≤0.5%, если это применимо к типу утилиты.
9. Для биопрепаратов и mAb-like продуктов должны учитываться агрегаты, стерильность и эндотоксины, если такие параметры релевантны назначению утилиты.
10. Если параметр может приходить в разных единицах, единица должна быть отдельным входным полем или явно отражаться в имени поля input.csv.

Входной CSV

BatchNumber,ProductName,EC50_ng_ml,IC50_ng_ml,Kd_nM,RelativePotency_Percent,VEGF_A_Binding_Percent,PlGF_Binding_Percent,Ang2_Binding_Percent,R_Squared,CV_Percent,StandardEC50_ng_ml
EYE-POT-2026-001,Aflibercept Intravitreal,5.2,6.0,0.05,102.0,98.0,96.0,0.0,0.995,5.5,5.1
EYE-POT-2026-002,Ranibizumab Solution,2.5,3.0,0.1,98.0,99.0,10.0,0.0,0.992,6.0,2.6
EYE-POT-2026-003,Faricimab IVT,4.0,4.5,0.08,105.0,97.0,95.0,98.0,0.998,4.5,4.2

Поля input.csv

Описание утилиты

Anti-VEGF Potency Binding Assay Reviewer — Рецензент активности анти-VEGF препаратов

Anti-VEGF Potency Binding Assay Reviewer — Рецензент активности анти-VEGF препаратов

ℹ️ Утилита анализирует данные связывания с рецепторами VEGF:
• Относительная потенция (80-120%)
• EC50 и Kd (аффинность)
• Специфичность связывания (VEGF-A, PlGF, Ang2)
• Качество биоанализа (R², CV)

⚠️ КРИТИЧНО: Снижение аффинности ведет к неэффективности терапии!
Окисление или агрегация могут блокировать сайты связывания.

Использование:
AntiVEGFPotencyBindingAssayReviewer.exe → демо-режим (вывод в консоль)
AntiVEGFPotencyBindingAssayReviewer.exe input.csv output.json → оценка ваших данных

Формат input.csv:
BatchNumber,ProductName,EC50_ng_ml,IC50_ng_ml,Kd_nM,RelativePotency_Percent,VEGF_A_Binding_Percent,PlGF_Binding_Percent,Ang2_Binding_Percent,R_Squared,CV_Percent,StandardEC50_ng_ml

Пример:
EYE-POT-2026-001,Aflibercept Intravitreal,5.2,6.0,0.05,102.0,98.0,96.0,0.0,0.995,5.5,5.1

— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Контроль биологической активности критичен для офтальмологических биопрепаратов (Roche, Novartis, Kanghong):
• Механизм действия основан на высокоаффинном связывании с VEGF-A (и PlGF/Ang2 для новых препаратов)
• Любые структурные изменения (окисление, дезамидирование) снижают способность блокировать ангиогенез
• Биоанализ является ключевым тестом выпуска (release assay)
• Для биспецифических антител (Faricimab) важно подтверждение связывания с обеими мишенями

⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• Относительная потенция 80-120% — узкий диапазон для обеспечения клинической эффективности
• EC50 должен коррелировать со стандартом (±30%)
• Kd (константа диссоциации) должна оставаться в пикомолярном/наномолярном диапазоне
• Связывание с VEGF-A и PlGF ≥90% — подтверждение функциональности "ловушки" (Trap)
• Высокое качество фитинга кривой (R² ≥0.98) обязательно

Ключевые особенности утилиты:
• Оценка аффинности связывания (SPR/ELISA data)
• Контроль специфичности для мульти-таргетных препаратов
• Валидация качества биоанализа (Z-factor аналог через R²/CV)
• Поддержка различных молекул (Ranibizumab, Aflibercept, Faricimab, Brolucizumab)

Критические параметры:
• Относительная потенция: 80–120%
• EC50: В пределах 30% от стандарта
• Kd: ≤1.0 нМ (пример)
• Связывание с VEGF-A/PlGF: ≥90%
• R²: ≥0.98
• CV: ≤15%

💡 Советы по использованию:
1. Используйте референсный стандарт в каждом запуске для нормализации
2. Для Faricimab обязательно проверяйте связывание с Angiopoietin-2
3. SPR (поверхностный плазмонный резонанс) дает более точные данные по Kd, чем ELISA
4. Сравнивайте профили связывания с историческими данными для выявления дрейфа
5. При низкой потенции проверьте наличие агрегатов или окисления CDR-регионов

⚠️ Особенность: В отличие от системных препаратов, где важна общая экспозиция, в глазу критична именно локальная концентрация активного вещества, способного связывать VEGF. Даже небольшое снижение аффинности может привести к рецидиву отека макулы. Утилита помогает гарантировать максимальную эффективность каждой дозы.

Трассируемость и ограничения

• URS используется как исходный документ для functional specification, CSV review и последующей CSV/validation работы.
• Документ не является заменой утверждённой фармакопейной монографии, валидированного метода или внутренней спецификации продукта.
• Для product-specific лимитов приоритет имеет утверждённая спецификация заказчика.

Функциональная спецификация описывает поведение автономной консольной утилиты FUZKK, формат входных данных, алгоритм оценки и структуру выходного JSON.

Функциональный поток

1. Main() проверяет количество аргументов.
2. Если аргументов нет: PrintHello() выводит описание и встроенный пример input.csv, затем RunDemoEvaluation() выполняет Evaluate() по GetDemoData() и печатает demo JSON.
3. Если передано два аргумента: RunWithFiles(input.csv, output.json) читает CSV, выполняет Evaluate() по каждой строке и записывает LabWare-compatible JSON.
4. LoadData() использует CultureInfo.InvariantCulture и не должен вызываться в no-args режиме.
5. Evaluate() возвращает именованный кортеж с BatchNumber, ProductName, Parameters, CriticalFailCount, WarningCount, Recommendation и RecommendationEN.
6. GetIssues() формирует сообщения для ErrorMessage при WARNING/FAIL.

Правила оценки

• PASS: CriticalFailCount = 0 и WarningCount = 0.
• WARNING: CriticalFailCount = 0 и WarningCount > 0.
• FAIL: CriticalFailCount > 0.
• ERROR: исключение при чтении или обработке данных.
• ErrorMessage остаётся пустым при PASS.
• Лимиты зашиты в Program.cs; внешняя конфигурация лимитов не требуется.

Ввод и поля

BatchNumber,ProductName,EC50_ng_ml,IC50_ng_ml,Kd_nM,RelativePotency_Percent,VEGF_A_Binding_Percent,PlGF_Binding_Percent,Ang2_Binding_Percent,R_Squared,CV_Percent,StandardEC50_ng_ml
EYE-POT-2026-001,Aflibercept Intravitreal,5.2,6.0,0.05,102.0,98.0,96.0,0.0,0.995,5.5,5.1
EYE-POT-2026-002,Ranibizumab Solution,2.5,3.0,0.1,98.0,99.0,10.0,0.0,0.992,6.0,2.6
EYE-POT-2026-003,Faricimab IVT,4.0,4.5,0.08,105.0,97.0,95.0,98.0,0.998,4.5,4.2

Выходной JSON

{
  "Header": {
    "UtilityName": "AntiVEGF_Potency_Binding_Assay_Reviewer",
    "Version": "1.0.0",
    "Timestamp": "UTC",
    "InstrumentID": "FUZKK-QC-WORKSTATION",
    "OperatorID": "Admin"
  },
  "Samples": [
    {
      "SampleID": "from BatchNumber",
      "BatchNumber": "from CSV",
      "ProductName": "from CSV",
      "TestName": "utility-specific test",
      "AnalysisCode": "utility-specific code",
      "Status": "PASS | WARNING | FAIL | ERROR",
      "StatusCode": "1 | 2 | 0 | -1",
      "ErrorMessage": "",
      "Description": "Russian recommendation",
      "DescriptionEN": "English recommendation",
      "Results": [
        {
          "ParameterName": "parameter",
          "ResultValue": 0.0,
          "UnitOfMeasure": "unit",
          "SpecificationLimit": "limit",
          "IsWithinSpec": true
        }
      ]
    }
  ]
}