Назначение

Определить пользовательские требования к автономной FUZKK-утилите, которая принимает CSV-файл лабораторных данных, выполняет проверку по зашитым в код правилам и формирует LabWare-compatible JSON.

Область применения

Утилита предназначена для предварительной QC/QA-оценки, интеграционного тестирования, LIMS/LabWare flow и подготовки evidence trail. Окончательное решение остаётся за валидированной процедурой лаборатории и ответственным персоналом.

Пользователи

QC analyst, QA reviewer, CSV/validation engineer, LIMS/LabWare integration engineer, responsible laboratory specialist.

Пользовательские требования

1. Утилита должна запускаться без параметров и выводить самоописание, пример input.csv из GetDemoData() и demo evaluation для встроенного набора данных.
2. Утилита должна запускаться с двумя параметрами: input.csv output.json.
3. Утилита не должна читать input.csv и не должна писать output.json при запуске без параметров.
4. CSV должен читаться с CultureInfo.InvariantCulture для числовых значений.
5. Результат должен формироваться в LabWare-compatible JSON с Header, Samples, Results, Status, StatusCode, ErrorMessage, Description и DescriptionEN.
6. При PASS поле ErrorMessage должно быть пустой строкой.
7. Зашитые лимиты должны следовать приоритету: Ph. Eur. → British Pharmacopoeia / UK implementation → ЕАЭС / региональные требования → EMA/ICH/EU guidance → USP fallback.
8. Если точная монография неизвестна, применяются строгие стандартные API-лимиты: Assay 98–102%, total impurities ≤1.0%, individual impurity ≤0.5%, если это применимо к типу утилиты.
9. Для биопрепаратов и mAb-like продуктов должны учитываться агрегаты, стерильность и эндотоксины, если такие параметры релевантны назначению утилиты.
10. Если параметр может приходить в разных единицах, единица должна быть отдельным входным полем или явно отражаться в имени поля input.csv.

Входной CSV

BatchNumber,ProductName,SubstanceName,ProductClass,Assay_Percent,TotalImpurities_Percent,IndividualImpurityMax_Percent,Aggregates_Percent,Sterility_Result,Endotoxin_Value,Endotoxin_Unit,Particles_10um_Value,Particles_10um_Unit,Particles_25um_Value,Particles_25um_Unit,ContainerVolume_mL,Turbidity_NTU,DAR_Value,RadiochemicalPurity_Percent,RadionuclidicPurity_Percent,pH,RegionCode,SpecificationSource,MethodID
EU-QC-2026-001,Reference product batch,ADC / conjugated biologics,ADC / conjugated biologics,99.4,0.42,0.18,0.9,PASS,0.12,EU/mL,1200,particles/container,90,particles/container,1.0,2.0,4.0,98.5,99.95,6.4,EU,PhEur_BP_EAEU_EU_guidance_first,QC-METHOD-001
EU-QC-2026-002,Out-of-trend batch,ADC / conjugated biologics,ADC / conjugated biologics,96.7,1.35,0.72,2.2,FAIL,0.9,EU/mL,7200,particles/container,810,particles/container,1.0,14.0,8.6,93.5,99.5,8.6,EU,strict_default_when_exact_monograph_unknown,QC-METHOD-001
EU-QC-2026-003,Unit conversion example,ADC / conjugated biologics,ADC / conjugated biologics,100.1,0.22,0.09,0.6,STERILE,3.2,EU/container,450,particles/mL,40,particles/mL,2.0,1.5,3.5,97.1,99.92,6.8,UK,BP_UK_implementation_units_demo,QC-METHOD-002

Поля input.csv

Описание утилиты

ADCRelease Readiness Checker — проверка качества по EU-first фармакопейным лимитам

ADCRelease Readiness Checker — проверка качества по EU-first фармакопейным лимитам

ℹ️ Утилита выполняет deterministic QC review для ADC / conjugated biologics:
• Приоритет источников: Ph. Eur. → British Pharmacopoeia / UK implementation → ЕАЭС → EMA/ICH/EU guidance → USP fallback
• Стандартные строгие API defaults, если точная монография ещё не зашита: Assay 98–102%, Total impurities ≤1.0%, Individual impurity ≤0.5%
• Для биопрепаратов / mAb-like продуктов: aggregates, sterility и endotoxin checks
• Для парентеральных/стерильных продуктов: sub-visible particles с поддержкой units particles/container и particles/mL

⚠️ КРИТИЧНО: Product-specific monograph / approved specification имеет приоритет над default limits.
Hardcoded defaults используются для раннего backlog-проекта и должны уточняться при продуктовой проработке.

Использование:
ADCReleaseReadinessChecker.exe → демо-режим (вывод в консоль)
ADCReleaseReadinessChecker.exe input.csv output.json → оценка ваших данных

Формат input.csv:
BatchNumber,ProductName,SubstanceName,ProductClass,Assay_Percent,TotalImpurities_Percent,IndividualImpurityMax_Percent,Aggregates_Percent,Sterility_Result,Endotoxin_Value,Endotoxin_Unit,Particles_10um_Value,Particles_10um_Unit,Particles_25um_Value,Particles_25um_Unit,ContainerVolume_mL,Turbidity_NTU,DAR_Value,RadiochemicalPurity_Percent,RadionuclidicPurity_Percent,pH,RegionCode,SpecificationSource,MethodID

Пример:
EU-QC-2026-001,Reference product batch,ADC / conjugated biologics,ADC / conjugated biologics,99.4,0.42,0.18,0.9,PASS,0.12,EU/mL,1200,particles/container,90,particles/container,1.0,2.0,4.0,98.5,99.95,6.4,EU,PhEur_BP_EAEU_EU_guidance_first,QC-METHOD-001

— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Утилита нужна для быстрого и воспроизводимого QC decision-support слоя:
• уменьшает ручную проверку Excel и локальных шаблонов
• показывает PASS / WARNING / FAIL в LabWare-compatible JSON
• фиксирует, какие hardcoded limits применены
• поддерживает unit variants для частиц и эндотоксинов
• помогает подготовить данные для review, audit trail и последующей CSV/CSA проверки

⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• Exact Ph. Eur./BP/EAEU monograph limit должен быть зашит в продуктовой версии утилиты, если он известен
• Если exact limit неизвестен, применяется строгий API default: Assay 98–102%, impurities ≤0.5–1.0%
• Для биопрепаратов обязательны aggregates, sterility и endotoxin checks
• Для particles значения могут приходить как particles/container или particles/mL; пересчёт делается через ContainerVolume_mL
• USP используется только как fallback, не как главный источник лимитов

Ключевые особенности утилиты:
• Hardcoded limits в одном Program.cs
• Никакой внешней конфигурации лимитов
• Поддержка EU-first source policy
• Unit conversion для particles/container и particles/mL
• Endotoxin unit handling для EU/mL, IU/mL, EU/mg, IU/mg, EU/container, IU/container
• LabWare-compatible output.json

Критические параметры:
• Assay: 98–102% default, если точная монография не зашита
• Total impurities: ≤1.0% default
• Individual impurity max: ≤0.5% default
• Aggregates for biologics: ≤1.5% strict default
• Sterility: PASS / STERILE / NEGATIVE / COMPLIANT
• Endotoxin: strict unit-based default; product-specific Ph. Eur. 2.6.14 calculation has priority
• Particles ≥10 µm: ≤6000/container; ≥25 µm: ≤600/container for small-volume parenteral default

💡 Советы по использованию:
1. При создании product-specific версии сначала проверьте Ph. Eur. / BP / ЕАЭС монографию
2. Если монографии нет, используйте строгие defaults только как screening layer
3. Для биопрепаратов не отключайте агрегаты, стерильность и эндотоксины
4. Если particle counts пришли per mL, обязательно заполните ContainerVolume_mL
5. Сохраняйте SpecificationSource и MethodID для audit trail

⚠️ Особенность: Утилита intentionally simple для поддержки: все лимиты зашиты в Program.cs. Это удобно для FUZKK-подхода, но требует version control и change control при изменении лимитов.

Трассируемость и ограничения

• URS используется как исходный документ для functional specification, CSV review и последующей CSV/validation работы.
• Документ не является заменой утверждённой фармакопейной монографии, валидированного метода или внутренней спецификации продукта.
• Для product-specific лимитов приоритет имеет утверждённая спецификация заказчика.

Функциональная спецификация описывает поведение автономной консольной утилиты FUZKK, формат входных данных, алгоритм оценки и структуру выходного JSON.

Функциональный поток

1. Main() проверяет количество аргументов.
2. Если аргументов нет: PrintHello() выводит описание и встроенный пример input.csv, затем RunDemoEvaluation() выполняет Evaluate() по GetDemoData() и печатает demo JSON.
3. Если передано два аргумента: RunWithFiles(input.csv, output.json) читает CSV, выполняет Evaluate() по каждой строке и записывает LabWare-compatible JSON.
4. LoadData() использует CultureInfo.InvariantCulture и не должен вызываться в no-args режиме.
5. Evaluate() возвращает именованный кортеж с BatchNumber, ProductName, Parameters, CriticalFailCount, WarningCount, Recommendation и RecommendationEN.
6. GetIssues() формирует сообщения для ErrorMessage при WARNING/FAIL.

Правила оценки

• PASS: CriticalFailCount = 0 и WarningCount = 0.
• WARNING: CriticalFailCount = 0 и WarningCount > 0.
• FAIL: CriticalFailCount > 0.
• ERROR: исключение при чтении или обработке данных.
• ErrorMessage остаётся пустым при PASS.
• Лимиты зашиты в Program.cs; внешняя конфигурация лимитов не требуется.

Ввод и поля

BatchNumber,ProductName,SubstanceName,ProductClass,Assay_Percent,TotalImpurities_Percent,IndividualImpurityMax_Percent,Aggregates_Percent,Sterility_Result,Endotoxin_Value,Endotoxin_Unit,Particles_10um_Value,Particles_10um_Unit,Particles_25um_Value,Particles_25um_Unit,ContainerVolume_mL,Turbidity_NTU,DAR_Value,RadiochemicalPurity_Percent,RadionuclidicPurity_Percent,pH,RegionCode,SpecificationSource,MethodID
EU-QC-2026-001,Reference product batch,ADC / conjugated biologics,ADC / conjugated biologics,99.4,0.42,0.18,0.9,PASS,0.12,EU/mL,1200,particles/container,90,particles/container,1.0,2.0,4.0,98.5,99.95,6.4,EU,PhEur_BP_EAEU_EU_guidance_first,QC-METHOD-001
EU-QC-2026-002,Out-of-trend batch,ADC / conjugated biologics,ADC / conjugated biologics,96.7,1.35,0.72,2.2,FAIL,0.9,EU/mL,7200,particles/container,810,particles/container,1.0,14.0,8.6,93.5,99.5,8.6,EU,strict_default_when_exact_monograph_unknown,QC-METHOD-001
EU-QC-2026-003,Unit conversion example,ADC / conjugated biologics,ADC / conjugated biologics,100.1,0.22,0.09,0.6,STERILE,3.2,EU/container,450,particles/mL,40,particles/mL,2.0,1.5,3.5,97.1,99.92,6.8,UK,BP_UK_implementation_units_demo,QC-METHOD-002

Выходной JSON

{
  "Header": {
    "UtilityName": "ADCReleaseReadinessChecker",
    "Version": "1.0.0",
    "Timestamp": "UTC",
    "InstrumentID": "FUZKK-QC-WORKSTATION",
    "OperatorID": "Admin"
  },
  "Samples": [
    {
      "SampleID": "from BatchNumber",
      "BatchNumber": "from CSV",
      "ProductName": "from CSV",
      "TestName": "utility-specific test",
      "AnalysisCode": "utility-specific code",
      "Status": "PASS | WARNING | FAIL | ERROR",
      "StatusCode": "1 | 2 | 0 | -1",
      "ErrorMessage": "",
      "Description": "Russian recommendation",
      "DescriptionEN": "English recommendation",
      "Results": [
        {
          "ParameterName": "parameter",
          "ResultValue": 0.0,
          "UnitOfMeasure": "unit",
          "SpecificationLimit": "limit",
          "IsWithinSpec": true
        }
      ]
    }
  ]
}