VaccinePotencyTCID50_EID50_QualityChecker
Vaccine Potency TCID50/EID50
Vet veterinary veterinary vaccines animal health adjuvants aquaculture batch release CSV→JSON
Открыть подборкуОписание утилиты: Vaccine Potency TCID50/EID50
Vaccine Potency TCID50/EID50 Quality Checker — Контроль титра вакцины (TCID50 / EID50)
ℹ️ Утилита оценивает potency (активность) живых ветеринарных вакцин методами определения тканевой инфекционной дозы (TCID50) или яйцевой инфекционной дозы (EID50):
• Сравнение расчетного титра (log10) с минимально требуемым уровнем активности
• Проверка валидности клеточного контроля (Cell Control): выживаемость клеток должна быть высокой (>80%), чтобы исключить токсичность среды
• Контроль обратной титрации (Back Titration): подтверждение того, что в лунки была внесена корректная доза вируса
• Поддержка методов Спирмена-Кербера и Рида-Мюнха (через входные данные расчета)
⚠️ КРИТИЧНО:
• Если выживаемость клеточного контроля низкая (<80%), тест считается НЕДЕЙСТВИТЕЛЬНЫМ (Invalid), так как ЦПД может быть вызвано токсичностью, а не вирусом.
• Титр ниже минимально требуемого уровня означает, что вакцина не обеспечит защитный иммунитет у животных.
Использование:
VaccinePotencyTCID50_EID50_QualityChecker.exe → демо-режим (вывод в консоль)
VaccinePotencyTCID50_EID50_QualityChecker.exe input.csv output.json → оценка ваших данных
Формат input.csv:
BatchNumber,ProductName,MethodType,CalculatedTiter_Log10,MinRequiredTiter_Log10,CellControlSurvival_Percent,VirusBackTitration_Log10,NumberOfReplicates,CPE_Observation_Days
Пример:
VAC-TCID-2026-001,IBR Vaccine,TCID50,7.5,6.5,95.0,4.0,8,"3,5,7"
— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Для живых вакцин титр является главным показателем качества и эффективности.
В отличие от инактивированных вакцин, где важна масса антигена, здесь важно количество жизнеспособных инфекционных единиц.
Методы TCID50 (на клетках) и EID50 (на куриных эмбрионах) являются стандартами де-факто в ветеринарной вирусологии.
⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• Cell Control: Должен показывать отсутствие ЦПД (цитопатического действия). Если клетки погибают в контроле, реагенты или условия культивирования непригодны.
• Back Titration: Проводится параллельно с основным тестом для подтверждения точности разведений. Отклонение более чем на 0.5-1.0 log от ожидаемого значения требует расследования.
• CPE Observation: Наблюдение за ЦПД должно проводиться в течение нескольких дней (например, 3, 5, 7 дни) для учета медленно растущих вирусов.
• Статистика: Расчет титра должен проводиться по валидированным статистическим методам (Spearman-Kärber или Reed-Muench).
Ключевые особенности утилиты:
• Проверка соответствия титра спецификации
• Валидация системного контроля (клетки и вирус)
• Поддержка различных методов титрования (TCID50, EID50)
• Генерация отчетов для отделов биоконтроля и LIMS LabWare
• Соответствие требованиям Ph. Eur. 5.2.14 и VICH GL53
Критические параметры:
• Титр: ≥ Минимально требуемого (указывается в досье)
• Выживаемость клеточного контроля: ≥ 80%
• Обратная титрация: в пределах допустимого диапазона от целевого значения
💡 Советы по использованию:
1. Чистота культуры: Используйте только свободные от микоплазмы клеточные линии. Микоплазма может искажать результаты титрования.
2. Считывание результатов: Оценка ЦПД должна проводиться слепым методом (blind reading) для исключения субъективности оператора.
3. Разведения: Используйте строгую технику серийных разведений (обычно 10-кратных) для обеспечения точности расчета.
4. Интерпретация: Если титр пограничный, рекомендуется повторить тест на новой алликвоте образца.
5. Документирование: Все сырые данные (количество положительных лунок на каждом разведении) должны сохраняться для аудита.
⚠️ Особенность: В ветеринарии часто используются сложные поливалентные вакцины. Для них титрование каждого компонента проводится отдельно, так как вирусы могут интерферировать друг с другом при совместном культивировании.input.csv
BatchNumber,ProductName,MethodType,CalculatedTiter_Log10,MinRequiredTiter_Log10,CellControlSurvival_Percent,VirusBackTitration_Log10,NumberOfReplicates,CPE_Observation_Days VAC-TCID-2026-001,IBR Live Vaccine,TCID50,7.5,6.5,95.0,4.0,8,"3,5,7" VAC-EID-2026-002,Newcastle Disease Vaccine,EID50,9.2,8.5,100.0,5.5,5,"3,4" VAC-FAIL-2026-003,BVDV Vaccine,TCID50,6.0,6.5,50.0,3.8,8,"3,5,7"
URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация
Документ описывает контролируемый интерфейс и поведение утилиты VaccinePotencyTCID50_EID50_QualityChecker для сценария Vaccine Potency TCID50/EID50 Quality Checker.
Предметные ограничения и критические параметры
Ниже приведены ключевые фрагменты исходного описания. Перед продуктивным применением пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
- Vaccine Potency TCID50/EID50 Quality Checker — Контроль титра вакцины (TCID50 / EID50)
- ℹ️ Утилита оценивает potency (активность) живых ветеринарных вакцин методами определения тканевой инфекционной дозы (TCID50) или яйцевой инфекционной дозы (EID50):
- • Проверка валидности клеточного контроля (Cell Control): выживаемость клеток должна быть высокой (>80%), чтобы исключить токсичность среды
- ⚠️ КРИТИЧНО:
- • Если выживаемость клеточного контроля низкая (<80%), тест считается НЕДЕЙСТВИТЕЛЬНЫМ (Invalid), так как ЦПД может быть вызвано токсичностью, а не вирусом.
- VaccinePotencyTCID50_EID50_QualityChecker.exe → демо-режим (вывод в консоль)
- VaccinePotencyTCID50_EID50_QualityChecker.exe input.csv output.json → оценка ваших данных
- В отличие от инактивированных вакцин, где важна масса антигена, здесь важно количество жизнеспособных инфекционных единиц.
- ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
- • Соответствие требованиям Ph. Eur. 5.2.14 и VICH GL53
- Критические параметры:
- • Титр: ≥ Минимально требуемого (указывается в досье)
- • Выживаемость клеточного контроля: ≥ 80%
- • Обратная титрация: в пределах допустимого диапазона от целевого значения
URS — пользовательские требования
| ID | Требование | Критичность | Критерий приемки |
|---|---|---|---|
| URS-001 | Утилита должна принимать файл input.csv для Vaccine Potency TCID50/EID50 Quality Checker с заголовками, определёнными в контракте данных. | High | Файл обрабатывается без ручного изменения заголовков. |
| URS-002 | Утилита должна выполнять детерминированную оценку QC/ОКК без машинного обучения и без вероятностного принятия решения о соответствии. | High | При одинаковых входных данных, версии правил и конфигурации результат полностью воспроизводим. |
| URS-003 | Утилита должна валидировать обязательные поля, типы данных, диапазоны, единицы измерения и предметную правдоподобность значений. | High | Ошибки схемы, преобразования и диапазона явно отражаются в результате. |
| URS-004 | Утилита должна применять предметные пределы и правила из описания, утверждённой спецификации, регистрационного досье и локальных SOP. | High | Каждая проверка имеет результат PASS/WARNING/FAIL и понятное сообщение. |
| URS-005 | Утилита должна формировать output.json с машинно-читаемыми результатами, исходными значениями, предупреждениями, отказами и критическими находками. | High | JSON пригоден для LIMS/ELN/MES-интеграции и QA/QC review. |
| URS-006 | Утилита должна сохранять трассируемость между серией/образцом, входным файлом, применёнными правилами и итоговым статусом. | High | Выход содержит идентификаторы, список параметров и audit metadata. |
| URS-007 | Документация должна поддерживать подготовку IQ/OQ/PQ, CSV/CSA и обсуждение с инспекторами или внутренним QA. | Medium | URS, FS, контракт input/output и тестовые сценарии поставляются вместе с утилитой. |
| URS-008 | Утилита должна использоваться как decision-support инструмент QC, а не как замена утверждённым спецификациям и выпускному решению Qualified Person/QA. | Medium | В документации указан контроль change control и необходимость сверки пределов. |
Контракт input.csv
| # | Поле | Тип | Пример | Назначение |
|---|---|---|---|---|
| 1 | BatchNumber | string / controlled vocabulary | VAC-TCID-2026-001 | Идентификатор серии/партии для трассируемости. |
| 2 | ProductName | string / controlled vocabulary | IBR Live Vaccine | Наименование продукта или проверяемой лекарственной формы. |
| 3 | MethodType | string / controlled vocabulary | TCID50 | Метод или технологический подход; контролируемое справочное значение. |
| 4 | CalculatedTiter_Log10 | decimal | 7.5 | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
| 5 | MinRequiredTiter_Log10 | decimal | 6.5 | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
| 6 | CellControlSurvival_Percent | decimal | 95.0 | Контрольная точка/контрольный образец для валидности серии анализа. |
| 7 | VirusBackTitration_Log10 | decimal | 4.0 | Отношение компонентов; структурный или рецептурный CQA. |
| 8 | NumberOfReplicates | integer / decimal | 8 | Контролируемый входной параметр для детерминированных QC-правил. |
| 9 | CPE_Observation_Days | string / controlled vocabulary | 3,5,7 | Временной параметр процесса, инкубации, хранения или анализа. |
BatchNumber,ProductName,MethodType,CalculatedTiter_Log10,MinRequiredTiter_Log10,CellControlSurvival_Percent,VirusBackTitration_Log10,NumberOfReplicates,CPE_Observation_Days VAC-TCID-2026-001,IBR Live Vaccine,TCID50,7.5,6.5,95.0,4.0,8,3,5,7 VAC-EID-2026-002,Newcastle Disease Vaccine,EID50,9.2,8.5,100.0,5.5,5,3,4 VAC-FAIL-2026-003,BVDV Vaccine,TCID50,6.0,6.5,50.0,3.8,8,3,5,7
Правила валидации входных данных
| ID | Поле | Правило | Критичность |
|---|---|---|---|
| VR-001 | BatchNumber | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | High |
| VR-002 | ProductName | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | High |
| VR-003 | MethodType | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | High |
| VR-004 | CalculatedTiter_Log10 | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-005 | MinRequiredTiter_Log10 | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-006 | CellControlSurvival_Percent | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-007 | VirusBackTitration_Log10 | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-008 | NumberOfReplicates | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
| VR-009 | CPE_Observation_Days | Поле должно соответствовать утверждённому справочнику/словарю или допустимой строковой форме. | Medium |
FS — функциональная спецификация
| ID | Функция | Реализация |
|---|---|---|
| FS-001 | CLI execution | Поддержать режимы запуска: demo mode без аргументов и production mode input.csv output.json. |
| FS-002 | CSV import | Прочитать input.csv в UTF-8/CSV-совместимом формате, проверить наличие заголовка и ожидаемых колонок. |
| FS-003 | Schema validation | Проверить обязательные поля, количество колонок, неизвестные ключевые поля и пустые обязательные значения. |
| FS-004 | Type conversion | Преобразовать числовые, флаговые и текстовые значения; некорректный формат фиксировать как ошибку строки. |
| FS-005 | Domain rule engine | Применить правила для Vaccine Potency TCID50/EID50 Quality Checker, включая критические пределы из описания и утверждённой спецификации. |
| FS-006 | Status aggregation | Сформировать итоговый статус: FAIL при критическом отказе, WARNING при некритическом отклонении, PASS при соответствии. |
| FS-007 | JSON export | Записать output.json с детализацией проверок, исходными значениями, предупреждениями, отказами и critical findings. |
| FS-008 | Audit support | Сохранять структуру результата пригодной для review, расследования отклонений и воспроизведения расчёта. |
| FS-009 | Integration contract | Поддержать сценарий LIMS/ELN/MES → input.csv → utility → output.json → portal/admin review. |
| FS-010 | Error handling | Возвращать явные сообщения для отсутствующего файла, пустого CSV, неверной схемы, ошибки записи output.json и некорректного формата. |
Пример output.json
{
"utilityId": "vaccinepotencytcid50-eid50-qualitychecker",
"utilityFolder": "VaccinePotencyTCID50_EID50_QualityChecker",
"package": "Vet",
"overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
"sourceFile": "input.csv",
"processedAtUtc": "2026-06-10T00:00:00Z",
"checks": [
{
"parameter": "BatchNumber",
"value": "VAC-TCID-2026-001",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-001"
},
{
"parameter": "ProductName",
"value": "IBR Live Vaccine",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-002"
},
{
"parameter": "MethodType",
"value": "TCID50",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-003"
},
{
"parameter": "CalculatedTiter_Log10",
"value": "7.5",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-004"
},
{
"parameter": "MinRequiredTiter_Log10",
"value": "6.5",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-005"
},
{
"parameter": "CellControlSurvival_Percent",
"value": "95.0",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-006"
},
{
"parameter": "VirusBackTitration_Log10",
"value": "4.0",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-007"
},
{
"parameter": "NumberOfReplicates",
"value": "8",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-008"
},
{
"parameter": "CPE_Observation_Days",
"value": "3,5,7",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Deterministic rule-based check result",
"ruleReference": "FS-RULE-009"
}
],
"criticalFindings": [],
"warnings": [],
"audit": {
"inputHash": "sha256:<calculated at runtime>",
"rulesVersion": "<utility executable version>",
"documentation": "VaccinePotencyTCID50_EID50_QualityChecker.documentation.html"
}
}
Матрица трассируемости
| URS | FS | Тест | Подтверждение |
|---|---|---|---|
| URS-001 | FS-001, FS-002 | OQ-001 | Проверить запуск и импорт валидного input.csv. |
| URS-002 | FS-005, FS-006 | OQ-004 | Повторить один и тот же набор данных и сравнить output.json. |
| URS-003 | FS-003, FS-004, FS-010 | OQ-002, OQ-003 | Проверить отсутствующие колонки и неверные типы. |
| URS-004 | FS-005, FS-006 | OQ-004, PQ-001 | Проверить критические отклонения по реальным/граничным данным. |
| URS-005 | FS-007, FS-009 | OQ-005 | Проверить JSON schema и пригодность для downstream-систем. |
| URS-006 | FS-008 | OQ-006 | Проверить наличие идентификаторов и audit metadata. |
| URS-007 | FS-008, FS-010 | IQ-001, OQ-007 | Проверить комплектность документации и control evidence. |
| URS-008 | FS-005, FS-008 | PQ-002 | Проверить review workflow и запрет автоматической замены QA-решения. |
IQ/OQ/PQ тестовые сценарии
| ID | Сценарий | Ожидаемый результат |
|---|---|---|
| IQ-001 | Проверить наличие executable, input.csv, документации и контрольной суммы. | Комплект поставки полон; версия зафиксирована. |
| OQ-001 | Валидная строка из примера input.csv. | PASS или допустимый WARNING согласно правилам. |
| OQ-002 | Удалить обязательную колонку из CSV. | Ошибка схемы или FAIL с указанием отсутствующей колонки. |
| OQ-003 | Внести нечисловое значение в числовое поле. | Ошибка преобразования типа с указанием строки/поля. |
| OQ-004 | Значение критического параметра вывести за предел. | FAIL и critical finding. |
| OQ-005 | Проверить структуру output.json. | Все обязательные секции присутствуют, JSON валиден. |
| OQ-006 | Проверить трассируемость серии/образца. | Идентификаторы входа и результатов совпадают. |
| PQ-001 | Проверить 3–5 реальных партий/образцов пользователя. | Результат подтверждён QC/QA review. |
| PQ-002 | Проверить workflow отклонения и ручного QA-решения. | Утилита поддерживает review, но не заменяет утверждённое решение. |
QA/QC и change control
- Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
- Хранить
input.csv,output.json, версию исполняемого файла и контрольную сумму. - Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
- Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
- Утилита предоставляет формализованный QC decision support, но окончательное решение выпуска остаётся за QA/QP и утверждёнными процедурами.
Входит в пакеты
Инфекционистика
Пакет QC-утилит для инфекционистики: антибактериальные, противовирусные, противогрибковые и противопаразитарные продукты, микробиология, стерильность, эндотоксины, вирусная безопасность, вакцинные release-checks.
ОткрытьVet — ветеринарные QC утилиты
Пакет Vet предназначен для ветеринарной фармацевтики и вакцин: адъюванты, антигены, аутогенные вакцины, аквакультура, корма/премиксы, антибактериальные и паразитарные препараты, стерильность и выпуск серии.
Открыть