TcmAristolochicAcidsAndPAsQualityChecker
Tcm Aristolochic Acids And P As
ℹ️ Утилита выполняет контроль безопасности согласно EMA/HMPC/566819/2014, FDA Import Alert #54-10, ChP 2341 и ICH M7:
АРИСТОЛОХИЕВЫЕ КИСЛОТЫ (АК):
• Zero Tolerance: АК запрещены в ЕС, США и Китае. Любое обнаружение выше LOD = отказ.
• AA-I и AA-II: Наиболее токсичные варианты; приоритетные маркеры.
• Species Confirmation: ⛔ Подтверждение вида Aristolochia = автоматический запрет независимо от уровня АК.
• LOD Requirement: Метод должен обеспечивать LOD ≤10 ppb для достоверного подтверждения отсутствия.
ПИРРОЛИЗИДИНОВЫЕ АЛКАЛОИДЫ (ПА):
• EMA Limit: 0.007 мкг/кг массы тела в сутки (для взрослых при пожизненном приеме).
• Batch-Level Conversion: Лимит в продукте рассчитывается из суточной дозы и массы тела пациента.
• Marker Panel: Сенкиркин, ретрозин, монкроталин, сенкиркин, эхимидин.
• PA-Producing Species: Детекция видов Senecio, Crotalaria, Heliotropium, Symphytum.
РИСК ПЕРЕКРЕСТНОЙ КОНТАМИНАЦИИ:
• Grown Near Risk Plants: Совместное выращивание с ПА/АК-продуцирующими видами.
• Shared Equipment: Использование общего оборудования без валидированной очистки.
• Cleaning Validation: Статус валидации очистки критичен при shared equipment.
СУТОЧНОЕ ПОТРЕБЛЕНИЕ:
• Автоматический пересчет концентрации в продукте → мкг/кг массы тела/сут.
• Учет индивидуальной дозы и массы тела пациента.
• Предупреждение даже при соответствии batch-level лимиту, если суточное потребление превышено.
⚠️ ВАЖНО:
• АК — канцероген группы 1 IARC; безопасного порога не существует.
• Подмена Stephania tetrandra на Aristolochia fangchi — исторически наиболее частая причина нефропатии.
• ПА накапливаются в печени; токсичность зависит от структуры (1,2-ненасыщенные наиболее опасны).
• LOD метода должен быть достаточно низким; LOD >10 ppb неприемлем для zero-tolerance.
• Перекрестная контаминация на общем оборудовании — реальный риск; требуется валидация очистки.
• Для детских препаратов лимит ПА пересчитывается на массу тела ребенка (значительно строже).
Использование:
TcmAristolochicAcidsAndPAsQualityChecker.exe → демо-режим
TcmAristolochicAcidsAndPAsQualityChecker.exe input.csv output.json → оценка данных
📍 Область применения:
• Входной контроль сырья ТКМ: Обязательный скрининг для всех партий.
• Экспортный контроль: Соответствие требованиям EMA/FDA.
• Расследование инцидентов: Анализ образцов при подозрении на нефро-/гепатотоксичность.
• Аудит поставщиков: Оценка риска перекрестной контаминации.
• Регистрационные досье: Документирование безопасности для регуляторов.
💡 Советы:
1. DNA Barcoding First: Для видов группы Fang_Ji всегда начинайте с ДНК-идентификации.
2. LC-MS/MS Required: HPLC-UV недостаточно чувствителен для zero-tolerance АК.
3. PA Conversion Tool: Автоматизируйте пересчет batch limit ↔ daily intake для разных дозировок.
4. Supplier Zoning: Требуйте от поставщиков карты полей с указанием соседних культур.
5. Trend Analysis: Мониторьте уровни ПА между партиями одного вида для выявления сезонных/географических паттернов.
⚠️ Примечание: Утилита оценивает БЕЗОПАСНОСТЬ ПО НЕФРО- И ГЕПАТОТОКСИНАМ. Она не заменяет полный токсикологический профиль (тяжелые металлы, пестициды, микотоксины). Статус PROHIBITED_SPECIES означает немедленную утилизацию; DETECTED_BELOW_LIMIT требует документирования и трендового мониторинга.
input.csv
SampleID,HerbName,LatinName,PartUsed,AnalyticalMethod,LOD_AA_ppb,LOD_PA_ppb,AA_I_ppb,AA_II_ppb,AA_IV_ppb,TotalAA_ppb,MaxAllowedAA_ppb,AASpeciesDetected,Senecionine_ppb,Retrorsine_ppb,Monocrotaline_ppb,Senkirkine_ppb,Echimidine_ppb,TotalPA_ppb,MaxAllowedPA_ppb,PASpeciesDetected,GrownNearRiskPlants,NeighboringRiskSpecies,SharedProcessingEquipment,CleaningValidationStatus,DailyDose_g,PatientBodyWeight_kg TCM-AA-2026-001,Fang_Ji,Stephania_tetrandra,Root,LC_MS_MS,2.0,3.0,0,0,0,0,0,false,0,0,0,0,0,5.2,100,false,false,,false,Validated,5.0,70 TCM-AA-2026-002,Guang_Fang_Ji,Aristolochia_fangchi,Root,LC_MS_MS,2.0,3.0,450,120,35,605,0,true,0,0,0,0,0,0,100,false,false,,false,Validated,3.0,70 TCM-AA-2026-003,Pei_Lan,Eupatorium_fortunei,Herb,LC_MS_MS,5.0,5.0,0,0,0,0,0,false,45,28,12,8,15,108,100,true,true,Senecio_scandens,true,Not_Validated,6.0,70
TcmAristolochicAcidsAndPAsQualityChecker — URS & FS
TCM Aristolochic Acids & PAs Quality Checker
TCM Aristolochic Acids & PAs Quality Checker
1. Назначение документа
Документ описывает пользовательские требования (URS) и функциональную спецификацию (FS) для утилиты TcmAristolochicAcidsAndPAsQualityChecker. Утилита предназначена для детерминированной проверки данных input.csv, формирования структурированного результата output.json и поддержки прослеживаемого QA/QC review.
Документ является проектной URS/FS-основой для CSV/CSA, IQ/OQ/PQ и дальнейшей валидации в контексте конкретной лабораторной процедуры.
2. Исходное описание утилиты
3. URS — пользовательские требования
3.1 Цель и область применения
Система должна принимать табличные результаты лабораторного контроля, выполнять проверку по заранее заданным критериям и возвращать понятный статус по каждой серии/записи: Pass, Review или Fail.
3.2 Нормативная / методическая база
В исходном описании и правилах утилиты используются следующие ориентиры: ChP, EP, ICH, EMA, FDA. Финальные лимиты должны быть подтверждены утверждённой спецификацией, монографией, SOP или протоколом трансфера метода.
3.3 Ключевые QC-проверки
- Zero Tolerance: АК запрещены в ЕС, США и Китае. Любое обнаружение выше LOD = отказ.
- AA-I и AA-II: Наиболее токсичные варианты; приоритетные маркеры.
- Species Confirmation: ⛔ Подтверждение вида Aristolochia = автоматический запрет независимо от уровня АК.
- LOD Requirement: Метод должен обеспечивать LOD ≤10 ppb для достоверного подтверждения отсутствия.
- EMA Limit: 0.007 мкг/кг массы тела в сутки (для взрослых при пожизненном приеме).
- Batch-Level Conversion: Лимит в продукте рассчитывается из суточной дозы и массы тела пациента.
- Marker Panel: Сенкиркин, ретрозин, монкроталин, сенкиркин, эхимидин.
- PA-Producing Species: Детекция видов Senecio, Crotalaria, Heliotropium, Symphytum.
3.4 Пользователи
- QC analyst — подготовка и загрузка
input.csv. - QA/QC reviewer — проверка результата и отклонений.
- CSV/validation specialist — подтверждение пригодности утилиты.
- System owner — управление версией, доступом и изменениями.
3.5 Требования к данным и Data Integrity
- каждая строка CSV должна быть прослеживаемой к серии, образцу или измерению;
- исходные значения не должны изменяться утилитой;
- расчёты должны быть воспроизводимыми при повторном запуске;
- любое отклонение должно сохраняться как структурированное finding с указанием поля и правила;
- ручное изменение итогового статуса вне QA-процесса не допускается.
4. FS — функциональная спецификация
4.1 Поток обработки
- Проверить наличие и кодировку
input.csv. - Проверить заголовки, обязательные поля и типы данных.
- Нормализовать числовые и булевы значения без изменения исходного следа.
- Выбрать набор правил по категории продукта/типа, если он предусмотрен.
- Сравнить значения с лимитами и вычислить derived metrics.
- Сформировать запись результата по каждой строке.
- Сохранить
output.jsonс общей сводкой, findings и traceability.
4.2 CSV-схема
| № | Поле CSV | Тип | Обяз. | Назначение |
|---|---|---|---|---|
| 1 | SampleID | string | Да | Входной атрибут для детерминированной оценки правил и прослеживаемости результата. |
| 2 | HerbName | string | Да | Идентичность продукта, препарата или образца. |
| 3 | LatinName | string | Да | Идентичность продукта, препарата или образца. |
| 4 | PartUsed | string | Да | Входной атрибут для детерминированной оценки правил и прослеживаемости результата. |
| 5 | AnalyticalMethod | string | Да | Метаданные аналитического метода или условий анализа. |
| 6 | LOD_AA_ppb | decimal | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 7 | LOD_PA_ppb | decimal | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 8 | AA_I_ppb | integer | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 9 | AA_II_ppb | integer | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 10 | AA_IV_ppb | integer | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 11 | TotalAA_ppb | integer | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 12 | MaxAllowedAA_ppb | boolean | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 13 | AASpeciesDetected | boolean | Да | Бинарный признак обнаружения для правил нулевой толерантности или предупреждений. |
| 14 | Senecionine_ppb | integer | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 15 | Retrorsine_ppb | integer | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 16 | Monocrotaline_ppb | integer | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 17 | Senkirkine_ppb | integer | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 18 | Echimidine_ppb | integer | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 19 | TotalPA_ppb | decimal | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 20 | MaxAllowedPA_ppb | integer | Да | Измеренный аналитический результат для сравнения с критерием приемлемости. |
| 21 | PASpeciesDetected | boolean | Да | Бинарный признак обнаружения для правил нулевой толерантности или предупреждений. |
| 22 | GrownNearRiskPlants | boolean | Да | Входной атрибут для детерминированной оценки правил и прослеживаемости результата. |
| 23 | NeighboringRiskSpecies | string | Да | Входной атрибут для детерминированной оценки правил и прослеживаемости результата. |
| 24 | SharedProcessingEquipment | boolean | Да | Входной атрибут для детерминированной оценки правил и прослеживаемости результата. |
| 25 | CleaningValidationStatus | string | Да | Входной атрибут для детерминированной оценки правил и прослеживаемости результата. |
| 26 | DailyDose_g | decimal | Да | Входной атрибут для детерминированной оценки правил и прослеживаемости результата. |
| 27 | PatientBodyWeight_kg | integer | Да | Входной атрибут для детерминированной оценки правил и прослеживаемости результата. |
4.3 Пример входных данных
| SampleID | HerbName | LatinName | PartUsed | AnalyticalMethod | LOD_AA_ppb | LOD_PA_ppb | AA_I_ppb | AA_II_ppb | AA_IV_ppb | TotalAA_ppb | MaxAllowedAA_ppb | AASpeciesDetected | Senecionine_ppb | Retrorsine_ppb | Monocrotaline_ppb | Senkirkine_ppb | Echimidine_ppb | TotalPA_ppb | MaxAllowedPA_ppb | PASpeciesDetected | GrownNearRiskPlants | NeighboringRiskSpecies | SharedProcessingEquipment | CleaningValidationStatus | DailyDose_g | PatientBodyWeight_kg |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TCM-AA-2026-001 | Fang_Ji | Stephania_tetrandra | Root | LC_MS_MS | 2.0 | 3.0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | false | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 5.2 | 100 | false | false | false | Validated | 5.0 | 70 | |
| TCM-AA-2026-002 | Guang_Fang_Ji | Aristolochia_fangchi | Root | LC_MS_MS | 2.0 | 3.0 | 450 | 120 | 35 | 605 | 0 | true | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 100 | false | false | false | Validated | 3.0 | 70 | |
| TCM-AA-2026-003 | Pei_Lan | Eupatorium_fortunei | Herb | LC_MS_MS | 5.0 | 5.0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | false | 45 | 28 | 12 | 8 | 15 | 108 | 100 | true | true | Senecio_scandens | true | Not_Validated | 6.0 | 70 |
4.4 Выходной JSON
{
"utility": "TcmAristolochicAcidsAndPAsQualityChecker",
"runId": "urn:fuzkk:run:example",
"sourceFile": "input.csv",
"recordsProcessed": 3,
"overallStatus": "Pass / Review / Fail",
"records": [
{
"recordId": "TCM-AA-2026-001",
"status": "Pass / Review / Fail",
"criticalFindings": [],
"warnings": [],
"evaluatedRules": [
"Configured acceptance criteria from the utility rule set"
],
"inputTrace": {
"SampleID": "TCM-AA-2026-001",
"HerbName": "Fang_Ji",
"LatinName": "Stephania_tetrandra",
"PartUsed": "Root",
"AnalyticalMethod": "LC_MS_MS",
"LOD_AA_ppb": "2.0",
"LOD_PA_ppb": "3.0",
"AA_I_ppb": "0"
}
}
],
"dataIntegrity": {
"deterministicEvaluation": true,
"sourceRowTraceability": true,
"manualOverrideAllowed": false
}
}
5. Трассировка URS → FS → тесты
| URS | FS-механизм | Проверка |
|---|---|---|
| Загрузка корректного input.csv | CSV parser + schema validator | OQ: валидный/невалидный CSV |
| Детерминированная оценка лимитов | Rule engine с фиксированной конфигурацией | OQ: граничные значения и known expected results |
| Статусы Pass/Review/Fail | Status aggregator по findings | OQ/PQ: образцы с проходными и провальными сериями |
| Прослеживаемость к исходной строке | inputTrace + recordId | PQ: сверка output.json с исходным CSV |
| Поддержка QA review | структурированные findings и warnings | PQ: review сценарии и deviation handling |
6. CSV/CSA и валидационный подход
IQ
- проверка версии утилиты;
- проверка расположения исполняемого файла;
- проверка шаблона CSV;
- контроль прав доступа.
OQ
- проверка обязательных полей;
- проверка типов данных;
- проверка граничных значений;
- проверка zero-tolerance правил.
PQ
- прогоны на реальных/репрезентативных данных;
- сверка с ручным расчётом;
- подтверждение QA review workflow.
Change control
- версионирование лимитов;
- impact assessment при изменении правил;
- регрессия после обновления.
1. Document purpose
This document defines user requirements (URS) and functional specification (FS) for TcmAristolochicAcidsAndPAsQualityChecker. The utility is intended to evaluate input.csv data deterministically, generate structured output.json output and support traceable QA/QC review.
This document is a project-level URS/FS baseline for CSV/CSA, IQ/OQ/PQ and further validation under an approved laboratory procedure.
2. Source utility description
3. URS — user requirements
3.1 Intended use and scope
The system shall accept tabular laboratory QC results, evaluate them against configured acceptance criteria and return a clear status for each batch or record: Pass, Review or Fail.
3.2 Regulatory / methodological basis
The source description and utility rules refer to the following framework: ChP, EP, ICH, EMA, FDA. Final acceptance limits shall be confirmed by the approved specification, pharmacopoeial monograph, SOP or method-transfer protocol.
3.3 Key QC checks
Key rules are taken from the utility configuration and source description.
3.4 Users
- QC analyst — prepares and loads
input.csv. - QA/QC reviewer — reviews output, findings and deviations.
- CSV/validation specialist — confirms fitness for intended use.
- System owner — controls versioning, access and change management.
3.5 Data and data-integrity requirements
- each CSV row shall be traceable to a batch, sample or analytical measurement;
- source values shall not be modified by the utility;
- calculations shall be reproducible on repeated execution;
- each deviation shall be captured as a structured finding with field and rule references;
- manual override of the final status outside QA process is not allowed.
4. FS — functional specification
4.1 Processing flow
- Verify presence and encoding of
input.csv. - Validate headers, mandatory fields and data types.
- Normalize numeric and boolean values while preserving the source trace.
- Select an adaptive rule set by product/category type, where applicable.
- Compare values with limits and compute derived metrics.
- Create a result record for each input row.
- Write
output.jsonwith summary, findings and traceability.
4.2 CSV schema
| # | CSV field | Type | Req. | Purpose |
|---|---|---|---|---|
| 1 | SampleID | string | Yes | Input attribute required for deterministic rule evaluation and output traceability. |
| 2 | HerbName | string | Yes | Product, preparation or sample identity. |
| 3 | LatinName | string | Yes | Product, preparation or sample identity. |
| 4 | PartUsed | string | Yes | Input attribute required for deterministic rule evaluation and output traceability. |
| 5 | AnalyticalMethod | string | Yes | Analytical method / condition metadata required for technical review. |
| 6 | LOD_AA_ppb | decimal | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 7 | LOD_PA_ppb | decimal | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 8 | AA_I_ppb | integer | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 9 | AA_II_ppb | integer | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 10 | AA_IV_ppb | integer | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 11 | TotalAA_ppb | integer | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 12 | MaxAllowedAA_ppb | boolean | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 13 | AASpeciesDetected | boolean | Yes | Binary detection flag used for zero-tolerance or warning rules. |
| 14 | Senecionine_ppb | integer | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 15 | Retrorsine_ppb | integer | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 16 | Monocrotaline_ppb | integer | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 17 | Senkirkine_ppb | integer | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 18 | Echimidine_ppb | integer | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 19 | TotalPA_ppb | decimal | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 20 | MaxAllowedPA_ppb | integer | Yes | Measured analytical result compared with the configured acceptance criterion. |
| 21 | PASpeciesDetected | boolean | Yes | Binary detection flag used for zero-tolerance or warning rules. |
| 22 | GrownNearRiskPlants | boolean | Yes | Input attribute required for deterministic rule evaluation and output traceability. |
| 23 | NeighboringRiskSpecies | string | Yes | Input attribute required for deterministic rule evaluation and output traceability. |
| 24 | SharedProcessingEquipment | boolean | Yes | Input attribute required for deterministic rule evaluation and output traceability. |
| 25 | CleaningValidationStatus | string | Yes | Input attribute required for deterministic rule evaluation and output traceability. |
| 26 | DailyDose_g | decimal | Yes | Input attribute required for deterministic rule evaluation and output traceability. |
| 27 | PatientBodyWeight_kg | integer | Yes | Input attribute required for deterministic rule evaluation and output traceability. |
4.3 Input data example
| SampleID | HerbName | LatinName | PartUsed | AnalyticalMethod | LOD_AA_ppb | LOD_PA_ppb | AA_I_ppb | AA_II_ppb | AA_IV_ppb | TotalAA_ppb | MaxAllowedAA_ppb | AASpeciesDetected | Senecionine_ppb | Retrorsine_ppb | Monocrotaline_ppb | Senkirkine_ppb | Echimidine_ppb | TotalPA_ppb | MaxAllowedPA_ppb | PASpeciesDetected | GrownNearRiskPlants | NeighboringRiskSpecies | SharedProcessingEquipment | CleaningValidationStatus | DailyDose_g | PatientBodyWeight_kg |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TCM-AA-2026-001 | Fang_Ji | Stephania_tetrandra | Root | LC_MS_MS | 2.0 | 3.0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | false | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 5.2 | 100 | false | false | false | Validated | 5.0 | 70 | |
| TCM-AA-2026-002 | Guang_Fang_Ji | Aristolochia_fangchi | Root | LC_MS_MS | 2.0 | 3.0 | 450 | 120 | 35 | 605 | 0 | true | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 100 | false | false | false | Validated | 3.0 | 70 | |
| TCM-AA-2026-003 | Pei_Lan | Eupatorium_fortunei | Herb | LC_MS_MS | 5.0 | 5.0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | false | 45 | 28 | 12 | 8 | 15 | 108 | 100 | true | true | Senecio_scandens | true | Not_Validated | 6.0 | 70 |
4.4 Output JSON
{
"utility": "TcmAristolochicAcidsAndPAsQualityChecker",
"runId": "urn:fuzkk:run:example",
"sourceFile": "input.csv",
"recordsProcessed": 3,
"overallStatus": "Pass / Review / Fail",
"records": [
{
"recordId": "TCM-AA-2026-001",
"status": "Pass / Review / Fail",
"criticalFindings": [],
"warnings": [],
"evaluatedRules": [
"Configured acceptance criteria from the utility rule set"
],
"inputTrace": {
"SampleID": "TCM-AA-2026-001",
"HerbName": "Fang_Ji",
"LatinName": "Stephania_tetrandra",
"PartUsed": "Root",
"AnalyticalMethod": "LC_MS_MS",
"LOD_AA_ppb": "2.0",
"LOD_PA_ppb": "3.0",
"AA_I_ppb": "0"
}
}
],
"dataIntegrity": {
"deterministicEvaluation": true,
"sourceRowTraceability": true,
"manualOverrideAllowed": false
}
}
5. Traceability URS → FS → tests
| URS | FS mechanism | Test evidence |
|---|---|---|
| Load valid input.csv | CSV parser + schema validator | OQ: valid/invalid CSV cases |
| Deterministic limit evaluation | Rule engine with fixed configuration | OQ: boundary values and known expected results |
| Pass/Review/Fail statuses | Status aggregator based on findings | OQ/PQ: passing and failing representative batches |
| Traceability to source row | inputTrace + recordId | PQ: output.json reconciliation to source CSV |
| QA review support | structured findings and warnings | PQ: review and deviation-handling scenarios |
6. CSV/CSA and validation approach
IQ
- utility version check;
- executable location check;
- CSV template check;
- access-right verification.
OQ
- mandatory field checks;
- data type checks;
- boundary-value checks;
- zero-tolerance rule checks.
PQ
- runs on real or representative data;
- comparison with manual calculation;
- confirmation of QA review workflow.
Change control
- rule and limit versioning;
- impact assessment for rule changes;
- regression after updates.
Входит в пакеты
Традиционная китайская медицина (ТКМ)
Пакет QC-утилит для ТКМ: botanical identity, fingerprint consistency, marker compounds, decoction pieces, Paozhi processing, pesticides, mycotoxins, heavy metals, sulfur fumigation, microbial limits and adulteration screening.
Открыть