LiveAttenuatedVaccineGeneticStability_QualityChecker

URS & FS — спецификация пользователя и функциональная спецификация

Документ описывает контролируемый интерфейс и поведение утилиты LiveAttenuatedVaccineGeneticStability_QualityChecker для сценария Live Attenuated Vaccine Genetic Stability Quality Checker.

Предметные ограничения и критические параметры

• ℹ️ Утилита анализирует данные секвенирования (NGS/Sanger) для подтверждения генетической стабильности живых аттенуированных вакцин согласно WHO и Ph. Eur. 5.2.14:
• ⚠️ КРИТИЧНО:
• Критически важно убедиться, что он не "исправил" те мутации, которые сделали его безопасным (аттенуированным).
• ⚠️ КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• • Соответствие требованиям WHO TRS и Ph. Eur.
• Критические параметры:
• • Идентичность: ≥ 99.9%
• • Покрытие: ≥ 100x (для NGS)
• ⚠️ Особенность: Для некоторых вирусов (например, грипп) генетическая изменчивость высока, и критерии стабильности фокусируются на конкретных генах гемагглютинина и нейраминидазы, а не на всем геноме.

URS — пользовательские требования

Контракт input.csv

BatchNumber,ProductName,VirusStrain,SequenceIdentity_Percent,MutationsInAttenuationSites,TotalMutations_vs_MasterSeed,CoverageDepth_X,ReversionMarkersDetected,PassageNumber
GEN-STAB-OPV-001,Oral Polio Vaccine Type 2,Sabin 2,99.95,3,5,500.0,None,40
GEN-STAB-MMR-002,Measles Vaccine,Edmonston-Zagreb,99.98,2,3,300.0,None,35
GEN-FAIL-REV-003,Varicella Vaccine,Oka Strain,99.90,1,12,450.0,ORF62_Reversion,42

Правила валидации входных данных

FS — функциональная спецификация

Пример output.json

{
  "utilityId": "liveattenuatedvaccinegeneticstability-qualitychecker",
  "utilityFolder": "LiveAttenuatedVaccineGeneticStability_QualityChecker",
  "package": "huvac",
  "overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
  "sourceFile": "input.csv",
  "processedAtUtc": "2026-06-10T00:00:00Z",
  "checks": [
    {
      "parameter": "BatchNumber",
      "value": "GEN-STAB-OPV-001",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-001"
    },
    {
      "parameter": "ProductName",
      "value": "Oral Polio Vaccine Type 2",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-002"
    },
    {
      "parameter": "VirusStrain",
      "value": "Sabin 2",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-003"
    },
    {
      "parameter": "SequenceIdentity_Percent",
      "value": "99.95",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-004"
    },
    {
      "parameter": "MutationsInAttenuationSites",
      "value": "3",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-005"
    },
    {
      "parameter": "TotalMutations_vs_MasterSeed",
      "value": "5",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-006"
    },
    {
      "parameter": "CoverageDepth_X",
      "value": "500.0",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-007"
    },
    {
      "parameter": "ReversionMarkersDetected",
      "value": "None",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-008"
    },
    {
      "parameter": "PassageNumber",
      "value": "40",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Deterministic rule-based check result",
      "ruleReference": "FS-RULE-009"
    }
  ],
  "criticalFindings": [],
  "warnings": [],
  "audit": {
    "inputHash": "sha256:<calculated at runtime>",
    "rulesVersion": "<utility executable version>",
    "documentation": "LiveAttenuatedVaccineGeneticStability_QualityChecker.documentation.html"
  }
}

Матрица трассируемости

IQ/OQ/PQ тестовые сценарии

QA/QC и change control

• Не менять имена колонок без обновления валидатора, документации и тестового набора.
• Хранить input.csv, output.json, версию исполняемого файла и контрольную сумму.
• Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную CSV/CSA-проверку.
• Критические пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье и локальными SOP.
• Утилита предоставляет формализованный QC decision support, но окончательное решение выпуска остаётся за QA/QP и утверждёнными процедурами.