InfraLUM_ID_Sofosbuvir

InfraLUM ID Sofosbuvir

Lumex QC URS & FS input.csv output.json rule-based LIMS-ready InfraLUM
Открыть подборку

Описание утилиты: InfraLUM ID Sofosbuvir

InfraLUM ID Sofosbuvir — Идентификация Софосбувира методом ИК-спектроскопии

ℹ️  Утилита проверяет критические параметры идентичности софосбувира по ИК-спектру:
   • Коэффициент корреляции с эталонным спектром (≥0.99)
   • Наличие характерных полос поглощения:
     - 1745 см⁻¹ (валентные колебания C=O эфирной группы)
     - 1680 см⁻¹ (валентные колебания C=O амидной группы)
     - 1250 см⁻¹ (валентные колебания P=O фосфатной группы)

⚠️  КРИТИЧНО: Несоответствие ИК-спектра может указывать на:
   • Подделку препарата
   • Грубые ошибки синтеза (неверный изомер)
   • Разложение субстанции при хранении

Использование:
 InfraLUM_ID_Sofosbuvir.exe                            → демо-режим (вывод в консоль)
 InfraLUM_ID_Sofosbuvir.exe input.csv output.json      → оценка ваших данных

Формат input.csv:
BatchNumber,IrCorrelation,Peak1745,Peak1680,Peak1250,PurityProxy

Пример (интенсивность пиков в нормализованных единицах):
 SOFO-2026-001,0.998,0.85,0.72,0.91,99.9

— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Софосбувир — прямой противовирусный препарат (ПППД) для лечения гепатита С.
• Требует строгой идентификации перед использованием в производстве лекарственных форм.
• ИК-спектроскопия — быстрый и надежный метод подтверждения подлинности (Ph. Eur., USP).
• Ключевые функциональные группы (фосфорамидат, эфир, амид) должны быть четко идентифицированы.

⚠️  КРИТИЧЕСКИ ВАЖНО:
• Коэффициент корреляции ≥0.99 — строгий критерий соответствия спектра эталону.
• Отсутствие пика 1745 см⁻¹ может указывать на гидролиз эфирной группы.
• Отсутствие пика 1250 см⁻¹ критично — указывает на повреждение фосфорамидатной связи (ключевой фармакофор).

Ключевые особенности утилиты:
• Автоматическая проверка корреляции спектров.
• Контроль наличия специфических пиков (fingerprints).
• Интеграция с LIMS через JSON-формат LabWare.

Критические параметры:
• IR Correlation: ≥0.99
• Peak 1745 cm⁻¹: Present (>0.5 abs)
• Peak 1680 cm⁻¹: Present (>0.5 abs)
• Peak 1250 cm⁻¹: Present (>0.5 abs)

💡 Советы по использованию:
1. Используйте аттестованный стандарт софосбувира для записи эталонного спектра.
2. Образец должен быть сухим (влажность искажает область OH/NH).
3. Метод ATR (нарушенного полного внутреннего отражения) наиболее удобен для твердых субстанций.
4. При несоответствии >0.01 по корреляции перекристаллизуйте образец или проверьте чистоту кристаллической решетки.

⚠️ Особенность: Софосбувир имеет хиральный центр. ИК-спектроскопия не различает энантиомеры, но выявляет грубые химические отклонения. Для контроля энантиомерной чистоты используйте хиральную ВЭЖХ (CE_DNA_Vaccine_Purity_Checker или аналогичные утилиты для хиральных молекул).

input.csv

BatchNumber,IrCorrelation,Peak1745,Peak1680,Peak1250,PurityProxy
SOFO-2026-001,0.998,0.85,0.72,0.91,99.9
SOFO-2026-002,0.995,0.82,0.70,0.88,99.8
SOFO-FAIL-003,0.850,0.10,0.05,0.12,95.0

URS & FS — спецификация пользовательских требований и функциональная спецификация

Документ описывает контролируемый интерфейс, валидационное поведение и ожидаемые результаты утилиты InfraLUM_ID_Sofosbuvir. Документ предназначен для включения в папку утилиты рядом с input.csv и файлом описания. Предполагаемый исполняемый файл: InfraLUM_ID_Sofosbuvir.exe.

Назначение: утилита выполняет детерминированную проверку входных QC-данных по утверждённым пределам, формирует машинно-читаемый output.json и поддерживает review в QC/QA, интеграцию с LIMS/ELN/MES и подготовку CSV/CSA-пакета.

Область применения

Класс утилитыИК-спектроскопия / ИнфраЛЮМ
Основной объект/методИдентификация Софосбувира методом ИК-спектроскопии
Входinput.csv с фиксированным заголовком и контролируемыми типами данных.
Выходoutput.json со статусами PASS, WARNING, FAIL, перечнем проверок и критическими находками.
ИсключенияУтилита не заменяет утверждённую спецификацию, методику анализа, расследование OOS/OOT и решение Qualified Person / QA о выпуске.

Предметные ограничения и критические параметры

Ниже приведены ключевые фрагменты исходного описания. Перед продуктивным применением пределы должны быть сверены с утверждённой спецификацией, регистрационным досье, актуальной фармакопейной редакцией и локальными SOP.
  • ℹ️ Утилита проверяет критические параметры идентичности софосбувира по ИК-спектру:
  • • Коэффициент корреляции с эталонным спектром (≥0.99)
  • • Наличие характерных полос поглощения:
  • - 1745 см⁻¹ (валентные колебания C=O эфирной группы)
  • - 1680 см⁻¹ (валентные колебания C=O амидной группы)
  • - 1250 см⁻¹ (валентные колебания P=O фосфатной группы)
  • ⚠️ КРИТИЧНО: Несоответствие ИК-спектра может указывать на:
  • • Подделку препарата
  • • Грубые ошибки синтеза (неверный изомер)
  • • Разложение субстанции при хранении
  • InfraLUM_ID_Sofosbuvir.exe input.csv output.json → оценка ваших данных
  • Формат input.csv:
  • BatchNumber,IrCorrelation,Peak1745,Peak1680,Peak1250,PurityProxy
  • • Требует строгой идентификации перед использованием в производстве лекарственных форм.
  • • ИК-спектроскопия — быстрый и надежный метод подтверждения подлинности (Ph. Eur., USP).
  • • Ключевые функциональные группы (фосфорамидат, эфир, амид) должны быть четко идентифицированы.

Фармакопейные и нормативные ссылки, найденные в описании

#ИсточникПримечание
1Ph. EurИспользуется как указание на источник/контекст метода; перед внедрением требуется сверка с актуальной редакцией.
2USPИспользуется как указание на источник/контекст метода; перед внедрением требуется сверка с актуальной редакцией.

Производственный поток данных

ШагОтветственный объектОписаниеКонтроль
1LIMS/ELN/MES или аналитик QCФормирует input.csv с результатами измерений и идентификатором серии.Проверка заголовков, обязательных полей и единиц измерения.
2InfraLUM_ID_SofosbuvirЗагружает CSV, выполняет приведение типов, применяет предметные правила и формирует результат.Детерминированные правила, отсутствие ML/эвристического решения о соответствии.
3QC reviewer / QAПроверяет output.json, предупреждения, критические отклонения и исходные значения.Review, расследование отклонений, сохранение следа данных.
4Архив / eQMSСохраняет вход, выход, версию утилиты, документацию и контрольную сумму.Data integrity: ALCOA+, воспроизводимость, change control.

URS — пользовательские требования

IDТребованиеКритичностьКритерий приемки
URS-001Утилита должна поставляться с документацией InfraLUM_ID_Sofosbuvir.documentation.html в той же папке, где находится описание и пример input.csv.MediumФайл документации присутствует в папке InfraLUM_ID_Sofosbuvir и открывается локально в браузере.
URS-002Утилита должна принимать input.csv с точными заголовками, определёнными в контракте данных.HighCSV с корректным заголовком обрабатывается без ручного редактирования.
URS-003Утилита должна проверять наличие обязательных полей, количество колонок, типы данных и базовую правдоподобность значений.HighОшибки схемы и преобразования явно отражаются в результате.
URS-004Утилита должна выполнять оценку по утверждённым пределам для каждого критического и некритического QC-параметра.HighКаждый проверяемый параметр получает статус и пояснение.
URS-005Утилита должна формировать итоговый статус серии/строки: PASS, WARNING или FAIL.HighКритическое отклонение приводит к FAIL; некритическое — к WARNING.
URS-006Утилита должна формировать output.json, пригодный для LIMS/ELN/MES-интеграции и QA/QC review.HighJSON содержит исходные значения, правила, статусы, предупреждения и критические находки.
URS-007Утилита должна сохранять трассируемость между идентификатором серии, входными значениями, применёнными правилами и итоговым статусом.HighВ выходе есть идентификатор серии/строки и перечень проверенных параметров.
URS-008Утилита не должна использовать машинное обучение или вероятностную интерпретацию для решения о соответствии.MediumРезультат воспроизводим и основан на явных правилах, порогах и входных значениях.
URS-009Утилита должна быть пригодна для запуска в CLI-сценарии: InfraLUM_ID_Sofosbuvir.exe input.csv output.json.HighПри корректных аргументах создаётся output.json; при ошибке возвращается диагностическое сообщение.
URS-010Документация должна поддерживать подготовку IQ/OQ/PQ или эквивалентной CSV/CSA-проверки.MediumДокумент содержит URS, FS, CSV-контракт, правила, тестовые сценарии и traceability.
URS-011Утилита должна разделять ошибки данных, предупреждения метода и критические отказы спецификации.HighВ output.json доступны отдельные коллекции/поля для errors, warnings, critical findings.
URS-012Утилита должна поддерживать архивирование входа и выхода без изменения данных.Mediuminput.csv и output.json могут быть сохранены как часть записи серии или OQ/PQ-доказательства.

Контракт input.csv

#ПолеТипПримерНазначение
1BatchNumberstringSOFO-2026-001Идентификатор серии/партии для трассируемости.
2IrCorrelationdecimal0.998Критерий сходства/корреляции с эталонным профилем.
3Peak1745decimal0.85Положение спектрального пика или характеристика аналитического/хроматографического пика.
4Peak1680decimal0.72Положение спектрального пика или характеристика аналитического/хроматографического пика.
5Peak1250decimal0.91Положение спектрального пика или характеристика аналитического/хроматографического пика.
6PurityProxydecimal99.9Параметр чистоты; используется для оценки соответствия, примесей и выпуска.
BatchNumber,IrCorrelation,Peak1745,Peak1680,Peak1250,PurityProxy
SOFO-2026-001,0.998,0.85,0.72,0.91,99.9
SOFO-2026-002,0.995,0.82,0.70,0.88,99.8
SOFO-FAIL-003,0.850,0.10,0.05,0.12,95.0

Правила валидации входных данных

IDПолеТипПроверкаКритичность
VR-001BatchNumberstringне пусто; уникально в пределах файла, если применимоMedium
VR-002IrCorrelationdecimalпреобразуется как invariant decimal; конечное значение; без NaN/Infinity; оценка относительно утверждённого числового пределаMedium
VR-003Peak1745decimalпреобразуется как invariant decimal; конечное значение; без NaN/Infinity; оценка относительно утверждённого числового пределаMedium
VR-004Peak1680decimalпреобразуется как invariant decimal; конечное значение; без NaN/Infinity; оценка относительно утверждённого числового пределаMedium
VR-005Peak1250decimalпреобразуется как invariant decimal; конечное значение; без NaN/Infinity; оценка относительно утверждённого числового пределаMedium
VR-006PurityProxydecimalпреобразуется как invariant decimal; конечное значение; без NaN/Infinity; оценка относительно утверждённого %-пределаHigh

FS — функциональная спецификация

IDФункцияРеализацияСвязь с URS
FS-001Локальная HTML-документацияПредоставить двуязычный файл InfraLUM_ID_Sofosbuvir.documentation.html с переключателем RU/EN, исходным описанием, URS, FS, контрактами и тестами.URS-001, URS-010
FS-002CSV importСчитать input.csv в UTF-8/CSV-совместимом формате, определить строку заголовка и записи данных.URS-002, URS-009
FS-003Schema validationСравнить фактические колонки с ожидаемым контрактом; отсутствующие ключевые поля фиксировать как ошибку схемы.URS-002, URS-003
FS-004Type conversionПреобразовать decimal, flag/boolean и controlled string. Некорректные значения фиксировать на уровне строки и поля.URS-003
FS-005Domain rule engineПрименить правила для объекта/метода InfraLUM ID Sofosbuvir, включая критические пределы из описания и утверждённой спецификации.URS-004, URS-008
FS-006Status aggregationАгрегировать статусы параметров: FAIL при критическом отказе, WARNING при некритическом отклонении, PASS при соответствии.URS-005, URS-011
FS-007JSON exportЗаписать output.json с идентификатором утилиты, исходными значениями, результатами проверок, warnings и critical findings.URS-006, URS-007
FS-008Error handlingРазделить ошибки запуска, ошибки схемы, ошибки преобразования и ошибки предметных пределов.URS-003, URS-011
FS-009Audit supportОбеспечить структуру результата, пригодную для review, расследования OOS/OOT, повторного расчёта и инспекционного обсуждения.URS-007, URS-012
FS-010Integration contractПоддерживать стандартный сценарий: LIMS/ELN/MES создаёт input.csv, утилита возвращает output.json, портал отображает описание и документацию.URS-006, URS-009
FS-011Configuration/change controlЛюбое изменение пределов, имён колонок или логики правил требует версии, review, регрессионных тестов и обновления документации.URS-010, URS-012
FS-012Data integrityНе изменять исходный input.csv; результаты сохранять отдельно в output.json с возможностью архивирования.URS-007, URS-012

Пример структуры output.json

{
  "utilityId": "infralum-id-sofosbuvir",
  "utilityName": "InfraLUM_ID_Sofosbuvir",
  "object": "InfraLUM ID Sofosbuvir",
  "overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
  "sourceFile": "input.csv",
  "recordCount": 3,
  "checks": [
    {
      "parameter": "BatchNumber",
      "value": "SOFO-2026-001",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result",
      "ruleReference": "VR-001"
    },
    {
      "parameter": "IrCorrelation",
      "value": "0.998",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result",
      "ruleReference": "VR-002"
    },
    {
      "parameter": "Peak1745",
      "value": "0.85",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result",
      "ruleReference": "VR-003"
    },
    {
      "parameter": "Peak1680",
      "value": "0.72",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result",
      "ruleReference": "VR-004"
    },
    {
      "parameter": "Peak1250",
      "value": "0.91",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result",
      "ruleReference": "VR-005"
    },
    {
      "parameter": "PurityProxy",
      "value": "99.9",
      "status": "PASS|WARNING|FAIL",
      "message": "Rule-based check result",
      "ruleReference": "VR-006"
    }
  ],
  "criticalFindings": [],
  "warnings": [],
  "metadata": {
    "executionMode": "CLI",
    "interface": "CSV to JSON",
    "documentationFile": "InfraLUM_ID_Sofosbuvir.documentation.html"
  }
}

Матрица трассировки URS → FS → OQ/PQ

URSFSПроверкаОжидаемый результат
URS-001FS-001Проверить наличие файла InfraLUM_ID_Sofosbuvir.documentation.html в папке утилиты.Файл присутствует, открывается, RU/EN переключатель работает.
URS-002/003FS-002/003/004Запустить утилиту с корректным CSV, CSV без обязательной колонки и CSV с неверным типом.Корректный CSV обработан; ошибки схемы и типа явно указаны.
URS-004/005FS-005/006Передать значения в пределах, на предупредительном уровне и за критическим пределом.Получены PASS, WARNING, FAIL согласно правилам.
URS-006/007FS-007/009/012Проверить структуру output.json и трассируемость серии.JSON содержит идентификатор серии, значения, правила, статусы и critical findings.
URS-008FS-005Повторить запуск с тем же input.csv.Результат идентичен; нет вероятностного поведения.
URS-009/010/012FS-010/011/012Выполнить CLI-сценарий и архивировать вход/выход/версию.Артефакты пригодны для OQ/PQ и change-control записи.

OQ/PQ тестовые сценарии

IDСценарийВходные данныеОжидаемый результат
OQ-001Позитивный путьCSV из примера с валидными значениями.output.json создан; итоговый статус PASS или допустимый WARNING согласно правилам.
OQ-002Отсутствует обязательная колонкаУдалить один ключевой столбец из заголовка.Ошибка схемы; строка не должна считаться прошедшей проверку.
OQ-003Некорректный типВ числовое поле внести текстовое значение.Ошибка преобразования типа с указанием поля и строки.
OQ-004Критический пределЗначение критического параметра вне утверждённого предела.FAIL и запись в criticalFindings.
OQ-005ПредупреждениеНекритическое отклонение или неизвестная контролируемая категория.WARNING без сокрытия исходного значения.
PQ-001Реальная серия пользователяРеальный input.csv из QC-процесса.Согласованный review с сохранением input.csv, output.json, версии и контрольной суммы.

QA/QC, CSV/CSA и change control

  • Не менять имена колонок без обновления валидатора, тестового набора и документации.
  • Хранить input.csv, output.json, версию исполняемого файла, контрольную сумму и копию документации.
  • Перед продуктивным использованием провести IQ/OQ/PQ или эквивалентную риск-ориентированную CSV/CSA-проверку.
  • Критические пределы должны быть утверждены владельцем процесса и сверены с регистрационным досье, фармакопеей и локальными SOP.
  • Любое изменение правил, порогов или интерпретации статусов должно проходить через change control и регрессионные тесты.

Входит в пакеты

Lumex QC Suite

Единый пакет Lumex, объединяющий исходные Lumex и Lumex2: инструментальный и общий фармацевтический QC, AAS/ICP, CE, HPLC, NIR/PAT, стабильность, растворение, однородность дозирования, системная пригодность и статистический контроль.

Открыть

Радиология

Пакет для радиологии и диагностической визуализации: радиофармпрепараты, PET/SPECT, контрастные вещества, йодсодержащие и гадолиниевые препараты, а также проверки частиц, стерильности и эндотоксинов.

Открыть