BioassayValidityChecker
Bioassay Validity
Bioassay Validity Checker — Проверка валидности биологического испытания (Ph. Eur. 5.3)
ℹ️ Утилита проверяет статистическую валидность биологического испытания согласно Европейской фармакопее.
ℹ️ Не использует машинное обучение — только правила.
Использование:
BioassayValidityChecker.exe → демо-режим (вывод в консоль)
BioassayValidityChecker.exe input.csv output.json → оценка ваших данных
Формат input.csv:
ProductName,BatchNumber,PValueLinearity,RSD_Replicates_percent,Slope
Пример:
Human_Coagulation_Factor_VIII,B20250110,0.15,3.2,1.05
— ЗАЧЕМ ЭТО НУЖНО?
Валидность биоиспытания — обязательное условие для расчёта активности:
• p-значение линейности > 0.05 — подтверждает линейную зависимость ответа,
• RSD повторов ≤ 5% — гарантирует воспроизводимость,
• Невалидное испытание = недействительный результат, даже если активность в пределах.
Соответствие Ph. Eur. 5.3 обязательно для всех биологических препаратов.
input.csv
ProductName,BatchNumber,PValueLinearity,RSD_Replicates_percent,Slope Human_Coagulation_Factor_VIII,B20250110,0.15,3.2,1.05
URS & FS — пользовательские требования и функциональная спецификация
Этот документ описывает требования пользователя и функциональную спецификацию для утилиты контроля качества. Он предназначен для обсуждения внедрения, подготовки IQ/OQ и интеграции в контур ОКК/QC.
1. Область применения
Утилита Bioassay Validity Checker применяется для объекта Bioassay Validity. Источником истины для структуры входных данных является фактический input.csv; критерии контроля задаются исполняемым модулем и предметным описанием.
Утилита не использует машинное обучение; решение формируется детерминированными правилами.
Категории: Pharmacopoeial methods
Теги: heavy metals, microbiology, particulate contamination, Ph. Eur., pharmacopoeia, residual solvents
2. Режимы запуска
BioassayValidityChecker.exe → демо-режим (вывод в консоль) BioassayValidityChecker.exe input.csv output.json → оценка ваших данных
3. Ключевые контролируемые области
- остаточные растворители
- тяжёлые металлы / элементные примеси
- pH и физико-химические параметры
4. Предметные ограничения и критические параметры
- p-значение линейности > 0.05 — подтверждает линейную зависимость ответа,
- RSD повторов ≤ 5% — гарантирует воспроизводимость,
5. URS — пользовательские требования
| ID | Требование | Критичность | Критерий приемки |
|---|---|---|---|
| URS-001 | Система должна принимать файл input.csv для Bioassay Validity с точным набором колонок, перечисленным в разделе «Контракт входных данных». | High | Файл с корректным заголовком читается без ручного редактирования; отсутствие обязательной колонки приводит к FAIL/ошибке импорта. |
| URS-002 | Система должна обрабатывать запуск без аргументов в демонстрационном режиме и запуск с аргументами input.csv output.json для пользовательских данных. | Medium | Оба сценария запуска дают предсказуемый результат или понятное сообщение об ошибке. |
| URS-003 | Система должна выполнять rule-based контроль по областям: остаточные растворители, тяжёлые металлы / элементные примеси, pH и физико-химические параметры. | High | Каждый контролируемый параметр получает статус и сообщение; результат не зависит от скрытых Excel-формул или ML. |
| URS-004 | Система должна сохранять трассируемость между серией/партией, исходными значениями, применёнными правилами и итоговым вердиктом. | High | В выходе присутствуют идентификатор серии, исходные значения, статусы параметров и критические находки. |
| URS-005 | Система должна формировать машинно-читаемый output.json для LIMS/ELN/MES, batch record и QA/QC review. | High | JSON содержит общий статус, массив проверок, предупреждения, отказы и ссылку на исходный файл. |
| URS-006 | Система должна поддерживать применение в валидационном пакете клиента: URS/FS, IQ/OQ-подготовка, проверка установки и операционных сценариев. | High | Документ, тестовые сценарии и воспроизводимый CSV/JSON-поток пригодны для аудита и внутреннего согласования. |
| URS-007 | Система должна явно отделять технические ошибки данных от предметных несоответствий спецификации. | Medium | Ошибки схемы/типов не смешиваются с фармакопейными отклонениями и отображаются отдельно. |
6. Контракт входных данных input.csv
Источник истины для схемы входа — фактический заголовок input.csv. Имена колонок технические и не переводятся.
| # | Колонка | Тип | Ед. | Описание | Пример | Правило контроля |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | ProductName | идентификатор | as specified | Product Name | Human_Coagulation_Factor_VIII | обязательное значение; формат и допустимость проверяются утилитой |
| 2 | BatchNumber | идентификатор | as specified | Batch Number | B20250110 | обязательное поле; используется для трассируемости серии/партии |
| 3 | PValueLinearity | десятичное число | as specified | PValue Linearity | 0.15 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 4 | RSD_Replicates_percent | десятичное число | % | RSD Replicates percent | 3.2 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
| 5 | Slope | десятичное число | as specified | Slope | 1.05 | обязательное числовое значение; сравнение с правилом выполняет утилита |
Пример CSV
ProductName,BatchNumber,PValueLinearity,RSD_Replicates_percent,Slope Human_Coagulation_Factor_VIII,B20250110,0.15,3.2,1.05
7. FS — функциональная спецификация
| ID | Функция | Описание реализации |
|---|---|---|
| FS-001 | CLI entry point | Исполняемый файл BioassayValidityChecker.exe принимает режим демонстрации и режим обработки input.csv output.json. |
| FS-002 | CSV parser | Модуль импорта читает CSV, проверяет заголовок, порядок/наличие колонок, количество значений и кодировку. Для десятичных значений ожидается точка. |
| FS-003 | Field conversion | Для каждой колонки выполняется преобразование к ожидаемому типу: идентификатор, текст, десятичное число, дата/время или логический флаг. |
| FS-004 | Domain rule engine | Для объекта Bioassay Validity применяются явные правила: диапазон, минимум, максимум, отсутствие запрещённого признака, полнота данных или расчётная проверка. |
| FS-005 | Criticality handling | Критичные нарушения формируют FAIL; некритичные отклонения и неполные данные формируют WARNING; соответствие всем правилам формирует PASS. |
| FS-006 | JSON writer | output.json сохраняет общий статус, результаты по каждому параметру, исходные значения, предупреждения, отказы и диагностические сообщения. |
| FS-007 | Integration contract | Формат CSV → JSON стабилен для вызова из LIMS/ELN/MES, планировщика задач или wrapper-сервиса. |
| FS-008 | Error handling | При ошибке схемы, отсутствующем файле, нечисловом значении или невозможности записи JSON возвращается диагностируемая ошибка без тихого PASS. |
8. Выходной контракт output.json
Выходной файл должен быть пригоден для автоматической обработки, аудита и сопоставления с исходной строкой input.csv.
{
"utility": "BioassayValidityChecker",
"api": "Bioassay Validity",
"batchNumber": "B20250110",
"overallStatus": "PASS|WARNING|FAIL",
"checkedAtUtc": "2026-05-18T00:00:00Z",
"checks": [
{
"parameter": "ProductName",
"value": "Human_Coagulation_Factor_VIII",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "BatchNumber",
"value": "B20250110",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "PValueLinearity",
"value": "0.15",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "RSD_Replicates_percent",
"value": "3.2",
"unit": "%",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
},
{
"parameter": "Slope",
"value": "1.05",
"unit": "as specified",
"status": "PASS|WARNING|FAIL",
"message": "Результат проверки по правилу"
}
],
"criticalFindings": [],
"sourceFile": "input.csv"
}9. Тестовые сценарии OQ/PQ
| ID | Сценарий | Ожидаемый результат |
|---|---|---|
| TC-001 | Валидный CSV с заголовком и строкой из примера | Все строки обработаны; результат содержит PASS/WARNING/FAIL и детализацию по параметрам. |
| TC-002 | Отсутствует обязательная колонка из input.csv | Импорт отклоняется или строка получает FAIL со ссылкой на схему. |
| TC-003 | Числовое поле содержит текст или пустое значение | Фиксируется ошибка преобразования типа; результат не маскируется как PASS. |
| TC-004 | Параметр выходит за предел спецификации / критического лимита | Для критического параметра формируется FAIL; для некритического — WARNING согласно правилу. |
10. QA/QC, CSV и управление изменениями
- Перед применением на производстве клиент фиксирует версию исполняемого файла, контрольную сумму, версию спецификации/монографии, тестовый CSV, ожидаемый JSON и результаты IQ/OQ.
- Нельзя менять имена колонок без обновления валидатора и тестовых сценариев.
- Исходный CSV, output.json и версия утилиты должны храниться вместе как пакет доказательств.
- Любое изменение правил контроля должно проходить change control и повторную проверку OQ-сценариев.
Входит в пакеты
European Pharmacopoeia QC Suite
Утилиты для общих фармакопейных методов и испытаний по европейскому регуляторному контуру.
ОткрытьИммунология
Пакет QC-утилит для иммунологии: моноклональные антитела, биоаналоги, иммуномодуляторы, иммуносупрессанты, ELISA/SPR, HCP, белковая характеристика, стерильность и pyrogen/release checks.
Открыть